chemoffice2008实用教程

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1、ChemOffice2008实用教程——化学结构绘图分子模拟数据整合主编：曾炜、孙延辉、李红霞时间：2009年8月目录1.ChemOffice基础知识2.ChemDraw操作基础3.Chem3D操作基础4.ChemFinder操作基础11.ChemOffice基础知识1.1ChemOffice2008简介1.2ChemOffice2008的模块1.3ChemOffice2008的安装与启动1.4其他绘图软件21.1ChemOffice2008简介图1-1ChemOffice发展历史31.2ChemOffice2008模块ChemDraw：化学结构

2、绘图（ChemicalStructureDrawingStandard）Chem3D：分子模拟分析绘图（MolecularModelingandAnalysis）ChemFinder：化学信息搜寻整合系统（Searching&InformationIntegration）41.2.1ChemDraw模块组件•AutoNom：是Beilsteiny最强的软件，现已包含于ChemDrawUltra中，它可按照IUPAC的标准自动命名化学结构。•ChemNMR：预测13C和1H-NMR谱图，节省实验费用。•ChemProp：预测沸点（BP）、熔点（MP

3、）、临界温度（Tc）、临界气压（CP）、吉布斯自由能（G）、logP、折射率（n）、热结构（HF）等性质。•ChemSpec：提示用户输入JCAMP及SPC频谱数据，以比较ChemNMR预测的结果。•ClipArt：高质量的实验室玻璃仪器图库，用于搭配ChemDraw使用。•NameStruct：输入IUPAC化学名称后可自动生成ChemDraw结构。51.2.2Chem3D模块组件•ExcelAdd-on：与微软的Excel完全整合，并可与ChemFinder联合使用。•GaussianClient：量子化学计算软件Gaussian03W的客

4、户端接口，可直接在Chem3D中运行Gaussian，并提供数种坐标格式（需要安装Gaussian03W）。Gaussian是做半经验计算和从头计算时使用最广泛的量子化学软件，可以研究分子能量和结构、过渡态的能量和结构、化学键、反应能量、分子轨道、偶极矩和多极矩、原子电荷和电势、振动频率、红外和拉曼光谱、NMR、极化率和超极化率、热力学性质以及反应路径等。计算可以模拟在气相和溶液中的体系，模拟基态和激发态。Gaussian03还可以对周期边界体系进行计算。Gaussian是研究取代效应、反应机理、势能面和激发态能量的有力工具（需另外获得GAMES

5、S）。•CSGAMESS：量子化学计算软件GAMESS的客户端接口，可直接在Chem3D中运行GAMESS的计算。•MOPAC：Fujitsu公司的量子化学计算软件MOPAC已包含在Chem3DUltra中，搭配Chem3D的图形界面。分子计算的方法有AM1、PM3、MNDO、MINDO/3和新的MINDO/d，可以计算瞬时的几何形状及物理特性等。61.2.3ChemFinder模块简介ChemFinder（化学信息搜寻整合系统）模块可以建立化学数据库、储存数据及搜索化学数据库，并可与ChemDraw和Chem3D联合使用，也可以使用现成的化学数

6、据库。ChemFinder是一个智能型的快速化学搜寻引擎，所提供的ChemInfo信息系统是目前世界上最丰富的数据库之一，包括ChemACX、ChemINDEX、ChemRXN以及ChemMSDX，并不断有新的数据库加入。ChemFinder可以从本机或网上搜寻Word、Excel、PowerPoint、ChemDraw和ISIS格式的分子结构文件。还可以与微软的Excel结合，可连接的关联式数据库包括Oracle及Access，输入的格式包括ChemDraw、MDL、ISIS、SD及RD文件。71.2.4其他模块ChemOffice组件中还包括

7、ChemOfficeWebServer——化学网站服务器数据库管理系统。用户可将ChemDraw和Chem3D发表在网站上，使用者可以使用ChemDrawProPlugin网页浏览工具在Web上查看ChemDraw的图形，或使用Chem3DStdPlugin网页浏览工具查看Chem3D的图形。同时ChemOfficeWebServer提供250000种化学品数据库，包括Sigma、Aldrich和FisherAcros等国外著名公司提供的信息。81.3ChemOffice2008的安装与启动1系统配置要求2安装、启动及退出3如何获得帮助91.3.

8、1系统配置要求ChemOffice2008可以在Windows上运行（ChemDraw2008可在Macintosh操作系统上运行）。操