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《zhanghan_功能磁共振数据处理-北京2012+》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、2012/5/12主要内容•脑成像数据分析软件介绍功能磁共振数据处理培训•Matlab基本操作•利用SPM处理任务fMRI数据张寒研究员•利用REST/DPARSF处理静息态fMRI数据杭州师范大学认知与脑疾病研究中心•静息态fMRI数据的ICA分析hanzhang@hznu.edu.cn•我归纳的一些数据分析小窍门•一整套静息态fMRI数据分析流程示例2012/5/11主要内容各种脑成像数据分析软件•脑成像数据分析软件介绍•SPM(我用的最多，Windows/Linux，基于•Matlab基本操作Matlab，适合处
2、理任务fMRI数据)•利用SPM处理任务fMRI数据•REST/DPARSF(A)(臧玉峰团队开发，Windows/Linux，基于Matlab，静息态fMRI•利用REST/DPARSF处理静息态fMRI数据分析工具，富含各种fMRI数据分析小工具)•静息态fMRI数据的ICA分析•AFNI(Linux，命令行方式，功能强大)•我归纳的一些数据分析小窍门•FSL(Linux，GUI/命令行方式)•一整套静息态fMRI数据分析流程示例•BrainVoyager(收费，Windows/Linux，GUI界面很方便，也可以
3、命令行模式)12012/5/12各种脑成像数据分析软件AFNI•SPM(我用的最多，Windows/Linux，基于•优秀的可视化Matlab，适合处理任务fMRI数据)•数据组织形式合理有效•REST/DPARSF(A)(臧玉峰团队，•利用提供的函数和Plug‐ins，几乎可以做任Windows/Linux，基于Matlab，静息态fMRI何事，编写完脚本后，一劳永逸。分析工具，富含各种fMRI数据分析小工具)•AFNI(Linux，命令行方式，功能强大)•FSL(Linux，GUI/命令行方式)•BrainVoya
4、ger(收费，Windows/Linux，GUI界面很方便，也可以命令行模式)CoxFSLBrainVoyager•FMRI,MRIandDTI•fMRI,DTI,TMS,EEG和MEG数据分析•各种SPM可以做的预处理和统计分析•C++,parallel,multi‐core,multi‐processor,GPU•MELODIC，ASL数据分析，BET，FAST，TBSS•各种SPM可以做的预处理和统计分析……，可以用GUI•Surfacemap,cortex‐basedrealignment•用它所给的各种函数，
5、你几乎可以对•MVPA,ICA,corticalthickness,volumerenderingMRI/fMRI做任何事，但是上手比较难•提供了各种模板：AnalysisGroup,FMRIB,Oxford,UKRainerGoebel22012/5/12各种脑成像数据分析软件主要内容•SPM(我用的最多，Windows/Linux，基于•脑成像数据分析软件介绍Matlab，适合处理任务fMRI数据)•Matlab基本操作•REST/DPARSF(A)(臧玉峰团队，•利用SPM处理任务fMRI数据Windows/Li
6、nux，基于Matlab，静息态fMRI•利用REST/DPARSF处理静息态fMRI数据分析工具，富含各种fMRI数据分析小工具)•静息态fMRI数据的ICA分析•AFNI(Linux，命令行方式，功能强大)•我归纳的一些数据分析小窍门•FSL(Linux，GUI/命令行方式)•一整套静息态fMRI数据分析流程示例•BrainVoyager(收费，Windows/Linux，GUI界面很方便，也可以命令行模式)Matlab基本操作Matlab界面的基本组成部分TheMathWorksCo.Matlab6.5,Matl
7、ab7.1,Matlab7.3,Matlab2009a,Matlab2010a…32012/5/12Matlab基本概念:WorkingDirectoryMatlab基本概念:CommandwindowCommand窗口：你和matlab对话的地方。如果在命令结束后不加“；”，matlab就直接打印结果，但是会慢！所以批处理时，一定要记得加“；”。workingdirectory即currentfolder，所有的生成的数据，默认都是放在这里。Matlab的报错信息，都会出现在这里，要留意观察！Matlab会最先搜索这
8、里的文件。打开文件选择窗口，最先到这里。•程序怎么没有运行出结果？•怎么每次要找半天才能找到我的数据所在文件夹？相关命令：pwd•上面一行红字是什么意思？•怎么我的程序一会能运行一会不能运行？cd•SPM生成的结果报表ps文件到哪儿去了？dirMatlab基本概念:Workspace,variable变量编辑窗口可以自由对变量内容
