太湖沉积物中的可培养细菌：i.细菌多样性初步分析

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1、LakeSci．(湖泊科学)，2009，2l(1)：27-35http：／／www．jlakes．org．E—mail：jlakes@niglas．ac．cn~2009byJournalofLakeSciences太湖沉积物中的可培养细菌：I．细菌多样性初步分析周丽华，陈士超3邓志瑞，陈沁，郑乐平，刘志学”(1：上海大学环境与化学_丁程学院，上海200444)(2：上海大学生命科学学院，上海200444)(3：同济大学生命科学与技术学院，上海200092)摘要：采用牛肉膏培养基培养，从不同深度的太湖沉积物中共分离得到603个菌落形态不同的菌株，通过数值分析比较了40个形态

2、表征性状，以不加权平均连锁聚类(UPGMA)的方式进行簇群归类，在O．75水平上可分成4个聚类群和51个亚群．从51个亚群中各随机选取一个菌株，测定其16SrDNA部分序列(约540bp)并据此进行分析，表明这些菌株分别属于Firmicutes、Actinobacteria、y-Proteobacteria这三大类群，与数据库中已知的芽孢杆菌属(Bacillus)、类芽孢杆菌属(Paenibacillus)、微球菌属(Micrococcus)、节杆菌属(rthrobacter)、迪茨菌属(Dietzia)和假单胞菌属(Pseudomonus)细菌具有很高的相似性．其中迪茨

3、菌属在国内淡水湖泊沉积物中为首次报道．关键词：太湖；沉积物；可培养细菌；数值分类；多样性CulturablebacteriainthesedimentofLakeTaihu(I)：primaryanalysisofbacteriadiversityZHOULihua，CHENShichao，DENGZhirui，CHENQin，ZHENGLeping＆LIUZhixue(1：SchoolofEnvironmentalandChemicalEngineering，ShanghaiUniversity，Shanghai200444，PR．China)(2：SchoolofLS

4、cience，ShanghaiUniversity，Shanghai200444，P．RChina)(3：SchoolofLireScienceandTechnology，Tong／iUniversity，Shanghai200092，PRChina)Abstract：ThesedimentsamplescollectedfromthedifierentsitesoftheLakeTaihu，2006wereculturedontraditionalnutrientmedium．603bacteriastrainswereseparatedwith40differentm

5、orphologicalfeatures，andweregroupedinto4clustersand51subclustersatthelevelof0．75withnumericalclassifiedbasedontheunweightedpairgroupmethodwitharithmeticaverages(UPGMA)algorithm．Basedonthepartialsequencesof16SrDNA(540bp)analysis，thebacteriastrainssamplechosenfromeachsubclustersrandomlywere

6、rankedintoFirmicutes，Actinobacteriaand7-Proteobacteriathreegroups，andcloselyrelatedtoBacillus，Paenibacillus，Micrococcus，Arthrobacter，DietziaandPseudomonasgenera．ThedietziagenerawasreportedinthesedimentoffreshwaterlakeinChinaforthefirsttime．Keyword：LakeTaihu；sediment；culturablebacteria；num

7、ericaltaxonomy；diversity湖泊沉积物的环境效应是水环境研究的重点之一，所关注的主要问题包括沉积物“源”、“汇”转换的时空变化【”，对污染物的吸附和沉积，以及水一土界面的营养盐、污染物释放通量等【2-3】．除温度、pH值、溶解氧(DO)、氧化还原电位(ORP)、水动力等物化因素之外llI4J，沉积物和上覆水体组成的二相结构界面问，存在一个复杂的生物相[6】．微生物由于本身的特点，在其中占有不可或缺的地位，在湖泊的物质循环和水体自净化能力维持中具有非常重要的作用l7】．因此，其种群结构及其生态功能、季节性变化