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1、DNA序列判别分类模型王显金阳军宁波大红鹰学院,浙江宁波315175[目的]结合生物学知识和数学方法构建DNA序列判别分类模型。[方法]根据氨基酸分子中侧链基的极性性质,从不同序列中氨基酸含量不同提炼出能从碱基含量和碱基排列情况两方面代表序列特征的氨基酸类别信息,用一个四维向量来表征,用马氏距离法和FISHER判别法对给定序列进行分类。[结果]该模型中,2种分类方法所得的样本回代率均达100%,分类一致率为90%。[结论]该模型算法简单,分类结果精度较高,优于仅基于碱基含量的判别分类模型。DNA序列;密码子;判别分析;频率S188A05
2、17-6611(2011)23-13955-03DNASequenceIdentificationClassificationModelWANGXian-jin宁波大红鹰学院2011年科研课题(CF102601)。王显金(1978-),男,江西兴国人,讲师,从事数学教育和数学应用研究。2011-04-07(2)@@[1]韩轶平,余杭,刘威,等.DNA序列的分类[J].数学的实践与认识,2001,31(1):38-45.@@[2]吕金翅,马小龙,曹芳,等.DNA序列分类的数学模型[J].数学的实践与认识,2001,31(1):46-53.
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