大豆倒伏性相关QTL的整合及Overview分析-论文.pdf

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1、植物遗传资源学报2014,15(1):137143JournalofPlantGeneticResoureesDOI:10.13430/j.cnki.jpgr.2014.01.018大豆倒伏性相关QTL的整合及Overview分析刘硕一,郭勇,罗玲,邱丽娟(中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与遗传改良国家重大科学工程,北京100081南昌大学生命科学学院,南昌330031)摘要:倒伏性是影响大豆产量的重要因素,发掘与大豆倒伏相关的基因对于培育抗倒伏优良高产大豆品种具有重要意义。目前利用不同群体所构建的遗传图谱已经定位了大量与大豆倒伏性相关的QTLs。

2、本研究在对已报道的QTLs进行物理整合的基础上,选择元分析方法将这些倒伏性相关的QTLs进一步整合,鉴定出位于C2(6号染色体)、F(13号染色体)、L(19号染色体)这3个连锁群上重复次数较多的QTL区间6个。选用基于统计学原理的Overview方法进行优化,获得了这些QTL在各个连锁群上的有效遗传位置,这些QTL的置信区间长度最一J、可缩至O.2cM。通过在这些区间内进一步筛选,获得一个稳定性较好的标记Satt277。本研究可为大豆抗倒伏基因发掘及分子标记辅助选择育种提供理论依据。关键词:大豆;倒伏性;物理整合;元分析;Overview分析Integrat

3、ionandOverviewAnalysisofQTLsRelatedtoLodginginSoybean(Glycinemax)LIUShuo一,GUOYong,LU0Ling,QIULi.Juan(’NationalKeyFacilityforCropGeneResourcesandGeneticImprovement(NFCRI)/InstituteofCropSciences,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Beijing100081;CollegeofLifeSciences,NanchangUniveity

4、,Nanchang330031)Abstract:Lodgingisoneofimportantfactorsinfluencingtheyieldofsoybean,therefore,identificationgenes/locirelatedtolodgingisofgreatimportanceforbreedinghigh-yieldvarietiesinsoybean.Uptonow,lotsofQTLsre—latedtolodginghavebeenidentifiedbasedontheconstructionofvariousgeneti

5、clinkagemapsusingdifferentsegre—gationpopulation.Inthisstudy,meta—analysiswasusedtointegrateQTLspublishedinthereferencesbasedonthephysicalintegrationoftheseQTLs.TheresuhsshowedthatsixQTLregionslocatedonthreelinkagegroups(LGC2,F,andL)hadthemostrepetitivetimesintheintegrationanalysis.

6、OverviewmethodwasalsousedtooptimizethegeneticpositionofeachintegratedQTLondifferentlinkagegroups.ThevalidQTLregionswereallnarroweddownandsomeofthemevennarrowedtothe0.2cM.Finally,anSSRmarkerSatt277wasselectedaccordingtothescreeningofthesevalidQTLregions.Theseresultscouldbeusedforgene

7、isolationandmarker—assistedbreedingoflodgingresistantvarietiesinsoybean.Keywords:soybean;lodging;physicalintegration;meta—analysis;overviewanalysis倒伏是由外界因素引发的农作物植株茎秆从自然直立状态到永久失稳的现象,是在作物生产中普收稿日期:201304-15修回日期:2013—05—15网络出版日期:2013-12.19URL:http://www.cnki.net/kcms/detail/1t.4996.S.20

8、131219.1311.029.htm

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