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1、本程序用来绘制发表质量的质粒图，可广泛应用与论文、教材的质粒插图。其特性包括：z知道序列或不知序列结构均能绘制质粒图z可读入各种流行序列格式文件引入序列信息。z自动识别限制位点z可构建序列结构，功能包括：从文件插入序列、置换序列、序列编辑、部分序列删除等。z绘图功能强大，功能包括：位点标签说明、任意位置文字插入、生成彩图、线性或环形序列绘制、可输出到剪贴板、可输出到图像文件。z限制酶消化分析报告输出与序列输入报告功能。1.不知序列结构绘制质粒图从菜单或工具栏选择FileNew，出现一个空白文件，再在菜单或工
2、具栏选择InsertBlank，出现一个对话框，如下：输入质粒标题与碱基对数，选择为线性或环形序列，单击OK键，便出现质粒图，可继续进行编辑，但因为不知其序列，所以有一些功能无法进行。2.从一个GenBank文件建立一个质粒图选择FileNew后，在菜单或工具条中选择InsertGenBankFile，便打开对话框，由你选择一个指定文件，确定后，便根据此序列生成质粒图，进行进一步编辑。3.从一个其它序列格式文件建立质粒图选择FileNew后，在菜单或工具条中选择InsertSequenceFile，便打开对
3、话框，由你选择一个指定文件，确定后，便根据此序列生成质粒图，进行进一步编辑。支持的序列格式包括：Stanford,NRBF,EMBL,Fasta,GCG,DNAStrider,Fitch,Pearson,Zuker,Olsen,Phylip,ASXII/RAW,PIR,CODATA,MSF,DNAStar，若是多序列文件，将由你选择哪一条序列进行作图。4.标记限制酶切位点菜单或工具条中中选择RestrictionEnzymes命令，用来标记目前序列中发现的限制酶切位点。出现以下窗口：左边的队列为按字母排列的
4、限制酶，数字为发现的位点数量，右边让用选择显示何种限制酶显示在左面的队列中，选项如下：SingleCutter：在队列中只显示对本序列有一个酶切位点的限制酶。AllCutter:在队列中显示所有对本序列有一个或一个以上酶切位点的限制酶。AllEnzymes：显示所有的限制酶，不管是否对本序列有酶切位点。Cuts_____to_____times：显示指定有几个切点的酶。用鼠标左键选择所有需要作标记的酶的名称，单击OK,便自动在质粒图上标记出酶切位点与酶名称。5自动标记GenBank文件指定的特征序列菜单或工
5、具条中中选择SequenceFeatures命令，用来标记目前GneBank序列文件中含有的特征序列。选择此命令后打开一个对话框，用鼠标选择希望程序标记在质粒图上的特征序列，单击OK,便自动在质粒图上标记这些选定的特征序列。6插入文字内容在菜单或工具条中中选择Text命令，便可插入文字内容，可定义大小，粗细，字体等，插入的文字内容可用鼠标拖动，放置在质粒图的任意位置。7.将线性序列图变成环形序列图或将环形序列图变成线性序列图在菜单或工具条中中选择CloseSequence命令或OpenSequence命令，
6、便可在二者之间转换。8.标记碱基对在菜单或工具条中中选择Marker命令，定义碱基对与标记文字后，单击OK即可。9.定义弓形结构Arc在菜单或工具条中中选择Arc命令，定义碱基对位置、长度、文字、弓形结构颜色、填充色、形状、宽度等内容，单击OK即可。10.限制酶数据库程序本身含有一个限制酶数据库，选择菜单命令EditEnzymes可以编辑限制酶数据库，包括，修改、增加、删除、从DNASIS.格式文件引入。限制序列可以模糊定义，模糊代码表示如下：AAACCCGGGTTTUUURGorAG,A,RYCorTC,
7、T,YMAorCA,C,MKGorTG,T,KSGorCG,C,SWAorTA,T,WBC,G,orTC,G,T,B,Y,K,SDA,G,orTA,G,T,D,R,K,WHA,C,orTA,C,T,H,Y,M,WVA,C,orGA,C,G,V,R,M,SNAnyAny11.工具栏图标含义依次为：FileNew打开一个新文件FileOpen...打开一个原存盘文件FileSave文件存盘FileSaveAs...文件另存为FilePrint...打印EditCopy拷贝到剪贴板EditCloseSequenc
8、e线性序列转化为环形EditOpenSequence环形序列转化为线性InsertWinPlasFile...插入WinPlas文件InsertBlankSegment...插入空片段InsertSequencefile...插入序列文件InsertGenBankfile...插入GenBank文件InsertDeleteRegion...删除选定区域InsertText...插入文字InsertMarker..
