蛋白质组学整理——2014(修改版).doc

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1、第一章绪论(名词解释8个5分简答3个十分论述2个15分)名词解释：1.蛋白质组：指的是由一个细胞、一个组织或是一种生物的基因组所表达的全部相应的蛋白质。是一个整体概念。2.蛋白质组学：旨在阐明生物体内全部蛋白质的表达模式和功能模式，其内容包括蛋白质的表达与存在方式（修饰方式），结构与功能，以及各个蛋白质之间相互作用等。3.可变剪接：是指同一基因转录形成的RNA前体可经过一种以上剪接方式产生多种不同的mRNA的过程。可将同一基因中的外显子以不同的组合方式来表现，使一个基因在不同时间、不同环境中能够制造出不同的蛋白质。从而使蛋白质组的复杂性远远高于基因组。4.蛋白质翻译后修饰（

2、PTM）：是指对新合成的多肽链或蛋白质进行的化学修饰，主要是磷酸化、糖基化、酰基化、硝基化、磺基化、脂化、泛素化和水解修饰等。使数量有限的编码基因产生数量巨大的蛋白质。简答题：1.基因组与蛋白组的区别与联系（1）同一性与多样性：同一个体的基因组不论是在不同的发育阶段或不同种类的细胞里都是一样的；对于不同类型的细胞或同一个细胞在不同的生理状态下，蛋白质组的构成是不同的（2）有限性与无限性：基因组无论大小，其核苷酸的数量和序列是一定的，对基因组序列的测定是一种“有限”的工作；由于细胞内大部分蛋白质存在翻译后修饰，包括磷酸化、糖基化、酰基化等，很难确定蛋白质组的蛋白质数量；对蛋白

3、质组的蛋白质种类的确定是一种“无限”的工作。（3）静态与动态：一个个体的基因组自个体诞生到死亡，始终保持不变；个体的蛋白质组，作为新陈代谢的主要执行者，在个体的生命活动中却总是变动的。（4）周期性与空间性：基因组通常位于细胞核内，比较稳定，序列和功能一般不受空间的影响，但是在发育的不同阶段和不同的细胞周期，mRNA的表达是不一样的；不同的蛋白质分布在细胞的不同部位，它们的功能与其空间定位密切相关；许多蛋白质在细胞内不是静止的，他们常常在不同的亚细胞环境里运动而发挥作用。2.重点：基因组与蛋白组的区别与联系：区别/联系基因组蛋白质组同一性与多样性同一个体的基因组不论是在不同的

4、发育阶段或不同种类的细胞里都是一样的；对于不同类型的细胞或同一个细胞在不同的生理状态下，蛋白质组的构成是不同的。有限性与无限性基因组无论大小，其核苷酸的数量和序列是一定的，例如人类基因组长度为32亿个碱基对；对基因组序列的测定是一种“有限”的工作。由于细胞内大部分蛋白质存在翻译后修饰，包括磷酸化、糖基化、酰基化等，很难确定蛋白质组的蛋白质数量；对蛋白质组的蛋白质种类的确定是一种“无限”的工作。静态与动态一个个体的基因组自个体诞生到死亡，始终保持不变；个体的蛋白质组，作为新陈代谢的主要执行者，在个体的生命活动中却总是变动的。周期性与空间性基因组通常位于细胞核内，比较稳定，序列

5、和功能一般不受空间的影响，但是在发育的不同阶段和不同的细胞周期，mRNA的表达是不一样的；不同的蛋白质分布在细胞的不同部位，它们的功能与其空间定位密切相关；许多蛋白质在细胞内不是静止的，他们常常在不同的亚细胞环境里运动而发挥作用。孤立作用与相互作用基因组表达的各种mRNA是彼此孤立的，互不干扰；蛋白质组中的各种蛋白质却是彼此间有着广泛的相互作用。单一手段与多种技术在基因组研究中，DNA测序技术是最基本和最主要的工具，因为基因组的均一性和简单性使得一种单一的技术就能胜任基因组的研究任务；在蛋白质组研究中，需要的研究技术远远不止一种，并且技术的难度也远远大于基因组的研究技术。第

6、二章蛋白质概述名词解释：1.等电点：在某一pH的溶液中，氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等，成为兼性离子，呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。2、蛋白质是一切生物体中普遍存在的，由20种左右天然α-氨基酸通过肽键相连形成的高分子含氮化合物；简答题3、氨基酸的分类、光学性质、重要化学反应1）非极性（疏水性）氨基酸(8种）A丙氨酸Ala、V缬氨酸Val、L亮氨酸Leu、I异亮氨酸Ile、F苯丙氨酸Phe、W色氨酸Trp、M甲硫氨酸Met、P脯氨酸Pre2）极性（亲水）中性氨基酸7种G甘氨酸Gly、S丝氨酸Ser、T苏氨酸Thr、C半胱氨酸Cys、Y酪氨酸Ty

7、r、N天冬酰胺Asn、Q谷氨酰胺Gln3）碱性氨基酸3种H组氨酸His、K赖氨酸Lys、R精氨酸Arg4）酸性氨基酸D天冬氨酸Asp、E谷氨酸Glu2、光学性质1）除甘氨酸外，所有天然α-氨基酸都有不对称碳原子，这其四个不同的取代基可有两种不同的空间排列方式，L型和D型。它们具有相反的旋光性，也称分子手性。蛋白质分子中的氨基酸一般为L－型。2）参与蛋白质组成的20种氨基酸中色氨酸(Trp)、酪氨酸(Tyr)和苯丙氨酸(Phe)的R基团中含有苯环共轭双键系统，在紫外光区（220-300nm）显示特征的吸收谱带，最大光