蛋白质组学组员乔杰、徐景燕、杨拉维、谢伟.ppt

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1、蛋白质组学组员:乔杰、徐景燕、 杨拉维、谢伟什么是蛋白质组(proteome)?蛋白质组(proteome)是澳大利亚学者Williams和Wilkins于1994年首先提出,源于蛋白质(protein)与基因组(genome)两个词的杂合,意指proteinsexpressedbyagenome,即“一个细胞或一个组织基因组所表达的全部蛋白质”。什么是蛋白质组学(proteomics)?指应用各种技术手段来研究蛋白质组的一门新兴科学,其目的是从整体的角度分析细胞内动态变化的蛋白质组成成分、表达水平与修饰状态,了解蛋白质之间的相互作用与联系,揭

2、示蛋白质功能与细胞生命活动规律。内容一、蛋白质组学研究的历史与背景二、蛋白质组学的研究内容三、蛋白质组学的发展趋势四、蛋白质组学的研究意义五、蛋白质组学研究中的关键技术一、蛋白质组学研究的历史与背景随着人类基因组计划的实施和推进,生命科学研究已进入后基因组时代。在这个时代,生命科学的主要研究对象是功能基因组学,包括结构基因组研究和蛋白质组研究等。1996年,澳大利亚建立世界第一个蛋白质组研究中心ARAF。丹麦、加拿大、日本也先后成立了蛋白质组研究中心。在美国,各大药厂和公司在巨大财力的支持下,也纷纷加入蛋白质组的研究阵容。瑞士蛋白质组数据库“S

3、WISSPROT”。2001年4月,在美国成立了国际人类蛋白质组研究组织(HumanProteomeOrganization,HUPO),随后欧洲、亚太地区都成立了区域性蛋白质组研究组织,试图通过合作的方式,融合各方面的力量,完成人类蛋白质组计划(HumanProteomeProject)。我国也于1998年启动了蛋白质组学研究,在中科院上海生物化学研究所举办了两次全国性的蛋白质组学研讨会。序列和结构蛋白质组学基于相似的序列产生相似的结构,发展了结构蛋白质组学,处理蛋白质结构的储存,提交,比较和预测。表达蛋白质组学致力于分析蛋白质的丰度,包括分

4、离复杂的蛋白质混合物,鉴定各个组分和它们的系统定量分析相互作用蛋白质组学考虑蛋白质间遗传和物理的相互作用以及蛋白质和核酸或小分子间的相互作用功能蛋白质组学直接进行大规模蛋白质功能测定传统模式:基因→mRNA→蛋白质现代模式:基因组→转录组→蛋白质组五、蛋白质组学研究中的关键技术等电聚焦(IEF)根据蛋白质所带净电荷数在PH梯度胶内进行分离SDS—PAGE根据蛋白质的相对分子质量来进行分离双向凝胶电泳—2DGE第一向等电聚焦,第二向SDS—PAGE质谱法—MS蛋白质组学,一种新型检测治疗癌症 的工具AbstractCancerproteomics

5、isarapidlydevelopingfieldandpromisestoacceleratethediscoveryofnewdiagnostic,prognosticandtherapy-relatedbiomarkers.Increasingly,themechanismsofactionofcancerdrugsaredefinedatthemolecularlevel.Thepossibilityofdetectinghundredsandthousandsofproteinsatthesamepointoftimeisatoolt

6、odefineproteinsassociatedwithresponseorresistancetotherapy.Thisstrategyhasbeenappliedsuccessfullyincellculturemodelsandisimplementedastranslationalresearchtoolinearlyclinicaltrialsofnewanti-canceragents.Thisreviewaimstosummarizebasicconceptsandtechniquesofproteomeanalysis,it

7、schallengesandlimitations,anddiscussestheopportunitiesforcancertherapy.ProteomictechnologiesBecauseofitsdiversityandcomplexity,theproteomecannotberevealedcompletelybyasingletechnology.Therearedifferentapproachestoovercomethiscomplexity,forexamplebytheisolationofsubproteomeso

8、forganellessuchasmitochondriaormembranefractionsorbytheisolationofclassesof

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