分子间相互作用与分子识别.pdf

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1、中科院研究生物理有机化学课程,2012年10月第三讲分子间相互作用与分子识别授课教师：王任小研究员中国科学院上海有机化学研究所ShanghaiInstituteofOrganicChemistry,CAS授课提纲一．溶剂以及溶液的性质(chapter3.1)二．分子间的相互作用(chapter3.2)三．分子识别(chapter4.1～4.3)参考教材：EricV.Anslyn,DennisA.Dougherty,ModernPhysicalOrganicChemistry,UniversityScienceBooks,Sausalito,Califor

2、nia,2006.中国科学院上海有机化学研究所ShanghaiInstituteofOrganicChemistry,ChineseAcademyofSciences2I.SolventandSolutionProperties中国科学院上海有机化学研究所ShanghaiInstituteofOrganicChemistry,ChineseAcademyofSciences3StructureofCondensedPhasesLiquidphaseSolidphase近近程程有有序序，，远远程程无有序序中国科学院上海有机化学研究所ShanghaiInst

3、ituteofOrganicChemistry,ChineseAcademyofSciences4MicroscopicStructureofLiquidPhase中国科学院上海有机化学研究所ShanghaiInstituteofOrganicChemistry,ChineseAcademyofSciences5MolecularInteractionsinSolventMostcommoninteractionsbetweensolvent-solventandsolvent-solutemoleculesarehydrogenbonding,dipo

4、le-dipole,andLondondispersionforces.HydrogenbondingDipole-dipoleLondondispersion中国科学院上海有机化学研究所ShanghaiInstituteofOrganicChemistry,ChineseAcademyofSciences6WaterCrystalstructureofwaterStructureofliquidwater空间占有率(packingcoefficient)：PC=V/Vvdw纯水的PC值为63%，大部分有机溶剂的PC值为50%～60%。中国科学院上海有机

5、化学研究所ShanghaiInstituteofOrganicChemistry,ChineseAcademyofSciences7PolarandNon-polarSolvents极性溶剂分子具有较大的偶极矩。极性溶剂能够较好地溶解盐或是偶极矩较大的化合物，而非极性溶剂不能。溶剂的极性常用介电常数(Dielectricconstant)来衡量：=/0中国科学院上海有机化学研究所ShanghaiInstituteofOrganicChemistry,ChineseAcademyofSciences8DielectricConstantDipole

6、(D)Formamide(3.73)Water(1.80)DMSO(3.96)DMF(3.86)HMPA(5.50)Hexamethyl-Phosphoramide(HMPA)中国科学院上海有机化学研究所ShanghaiInstituteofOrganicChemistry,ChineseAcademyofSciences9HeatofVaporization汽化热(Heatofvaporization,H0)是指在温度恒定为溶剂的vap沸点时蒸发一摩尔溶剂所需的热量。内聚能密度(Cohesiveenergydensity):0HvapDV摩尔体积

7、请思考：Water和Decane的内聚能密度谁更大一些，为什么？中国科学院上海有机化学研究所ShanghaiInstituteofOrganicChemistry,ChineseAcademyofSciences10SurfaceTension表面张力(surfacetension)也是反映溶剂内部分子间相互作用大小的物理性质。表面张力系数溶剂表面积/需要的做功中国科学院上海有机化学研究所ShanghaiInstituteofOrganicChemistry,ChineseAcademyofSciences11SolvationNaCl的溶解

8、过程示意图中国科学院上海有机化学研究所ShanghaiInstituteofOr