猪流行性腹泻病毒的遗传变异情况分析.doc

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1、猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况分析摘要：猪流行性腹泻病毒（PEDV）主要就是指能导致猪发生流行性腹泻病等一些肠道性疾病的某种动物性的冠状病毒。这种病毒可以与宿主系统形成相互作用，引起以腹泻以及呕吐和脱水为主要病变特征的一种具有极大传染能力的接触性的肠道病毒。本文主要对猪流行性腹泻病毒（PEDV）的遗传变异情况进行实验分析，并对实验的结果进行探讨，为猪流行性的腹泻病毒的防治提供一些可行性的建议，促进猪养殖业的发展。关键词：猪流行性腹泻病毒（PEDV）；遗传变异；免疫猪的流行性腹泻主要是由PEDV引发的以腹泻和呕吐以及脱水等为主要病症表现一种具有极大传染性以及高接触性的肠道疾病

2、。在出生的仔猪一周龄到两周龄时，死亡率很高（90%）。PEDV是一种动物性的冠状病毒，它的表面主要有三种类型的结构蛋白，纤突蛋白S以及膜蛋白M和包膜蛋白E。其中冠状病毒中S1基因的主要变化最能体现PEDV的遗传变异的情况，因此，对此种基因的研究就显得尤为重要。一、实验材料的选择和方法1、实验材料的选择是进行实验的关键，所以在实验开始之前要对样本的收集工作详细的进行分类和研究。本实验中的病料样品（病猪的小肠和粪便），主要就是来自不同的发生此种传染病的养猪场的一周龄内的仔猪，普遍的发病特点就是：严重的腹泻以及呕吐和脱水，甚至是死亡，这种病症疑似感染PEDV。2、病毒中RNA的提取以及cDN

3、A的主要合成。把采集到的小肠的内容物按照1比5的比例用PBS进行稀释，在进行充分的正震荡后在进行反复的冻融（三次即可），然后以每分钟五千转进行十分钟的离心，然后提取上清液中的RNA，最后按照试剂盒的说明书进行cDNA的合成。3、对S1基因的序列进行分析。在对S1基因进行扩增以及克隆之后，采用专业的软件（DNAstar以及DNAMAN）对其进行核苷酸序列的分析，并利用MAGE5进行基因系统发生树的构建。二、实验结果分析通过实验证明，PEDV的S1基因和参考的病毒株的S1基因的核苷酸序列的同源性介于90%和99.97%之间，但是相较于参考病毒株，其S1基因不仅具有点突变还具有插入以及缺失突

4、变。三、猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况分析经过对不同的发病猪的小肠内容物的采集，以及后期的病料处理和病毒RNA的提取等等一系列的规范实验，最终得出发的结论就是这批样本的来源确实存在着PEDV的感染状况。根据资料我们知道，在过去的几年中，PEDV的感染在亚洲养猪场中存在的比较严重，这就给养猪户带来了严重的损失，但是在欧洲由于PEDV引发的传染病仔猪的死亡率就相对较低。PEDV的遗传变异主要集中在S基因也就是纤突蛋白上，根据不同的冠状病毒的S蛋白的相对保守的基因序列，可以把PEDV的S基因认为的划分成S1区与S2区，并对这两种序列以及全序列进行序列的测定和分析，对PEDV的S蛋

5、白基因的抗原表位的研究提供了可靠的依据。结语：对于猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况分析是对猪流行性腹泻病进行防治的关键，在此种传染病发病率较高的我国，只有这样才能在最大程度上提高一周龄指两周龄的仔猪的成活率，为减少养殖户的损失提供极大地保障。对于PEDV的金基因研究，我国国内出现了一种新的基因型，这还有待于我们的进一步研究。参考文献：[1]杨群.两种猪肠道冠状病毒诊断方法的建立和国内新分离毒株主要结构蛋白基因克隆与序列分析[D].南京农业大学,2005[2]韦显凯.猪流行性腹泻病毒S蛋白不同基因片段重组腺病毒的构建与小鼠免疫特性研究[D].南京农业大学,2007[3]熊静.猪

6、流行性腹泻病毒S蛋白基因在昆虫细胞中的表达及间接ELISA抗体检测方法的初步建立[D].南京农业大学,2008