利用微卫星标记分析两个吉富罗非鱼群体的遗传差异.pdf

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1、南方农业学报JournalofSouthernAgriculture2015,46(1):138—143ISSN2095—1191;CODENNNXAABhttp://www.nfnyxb.cnDOI:10.3969/j:issn.2095—1191.2015.1.138利用微卫星标记分析两个吉富罗非鱼群体的遗传差异李建林,李红霞,唐永凯,俞菊华+,于凡(中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室,江苏无锡214081)摘要:【目的】评价不同吉富罗非鱼群体的遗传多样性,

2、筛选出鉴别不同群体的分子标记,为吉富罗非鱼种质资源保护及其新品种选育提供理论依据。【方法】对48尾来自两个不同群体的吉富罗非鱼进行尾静脉采血,抽提其基因组DNA,应用微卫星标记技术判定其等位基因和基因型,然后采用GenAlEx6.2、Cervus3.0和Populations软件进行数据分析,计算有效等位基因数(Ne)等群体遗传多样性相关参数,对两个吉富罗非鱼群体进行遗传差异分析。【结果】从50对微卫星引物中筛选出23对扩增产物稳定、条带清晰、特异性好的引物,扩增出的DNA片段大小在110~388bp

3、。利用23个微卫星位点,从两个吉富罗非鱼群体中共检测到89个等位基因和163种基因型,平均每个位点的等位基因数(Na)3.8个、基因型7.1种。两个吉富罗非鱼群体的平均观察杂合度(日b)分别为0.6383和0.5957,平均期望杂合度(He)分别为0.5759和0.5559;23个位点在两个群体中平均多态信息含量(P『C)分别为0.5131和0.4942,平均固定系数(vis)分别为一o.1184和一o.0718;两个群体间的遗传距离(DA)为0.1287,平均遗传分化系数(FsT)为0.135。UN

4、H911、GMl41、GM287、GMl34等4个位点在两个群体中扩增的条带存在明显差异。【结论】两个吉富罗非鱼群体遗传多样性水平较高,均存在杂合子过剩现象,群体间遗传分化程度中等,具有较强的环境适应能力,且选育空间大。UNH911、GMl41、GM287、GMl34等4个微卫星位点可作为鉴别两个吉富罗非鱼群体的分子标记,也可用于分子标记辅助育种研究。关键词:吉富罗非鱼;群体;微卫星标记;遗传多样性;杂合子过剩中图分类号:$965.125文献标志码:A文章编号:2095—1191(2015)01—01

5、38—06Geneticdifferenceanalysisoftwogeneticallyimprovedfarmed⋯●'J●1●·ll●·●tllaplapopulaUonsDynSlngmicrosatellitemarKerLIJian-lin,LIHong-xia,TANGYong-kai,YUJu-hua。,YUFan(FreshwaterFisheriesResearchCenter,ChineseAcademyofFisherySciences/KeyLaboratoryofFres

6、hwaterFisheriesandGennplasmResourcesUtilization,MinistryofAgriculture,Wuxi,Jiangsu214081,China)Abstract:【Objective】Inordertopreservegermplasmresourceofgeneticallyimprovedfarmedtilapia(GIFI’)andprovidetheoreticalbasisesforitsnewvarietybreeding.thegenetic

7、polymorphismsofdifierentGIFvI’populationswerein.vestigatedandthemoleeularmarkerswhichcoulddistinguishdifferentGIFrpopulationswerescreened.【Method】,11legenomicDNAof48caudalvenousbloodsamplesfromtwoGI丌populationswereextracted.thentheirallelesandgenotypesw

8、eredetectedbyusingmicrosatellitemarkertechnique.ThegeneticdiversityparametersoftwoGIFTpopula—tionsv五.effectivenumberofalleles(Ne),etc.weredeterminedbyanalysisofGenAlEx6.2.Cervus3.0andPopula—tionssoftware.【Result】Among50pairsofmic

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