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《云南省甘蔗白叶病病原巢式PCR检测技术规程2018征求意见稿.doc》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在应用文档-天天文库。
1、云南省甘蔗白叶病病原巢式PCR检测技术规程2018征求意见稿 ICS65.020B15中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局备案号DB53/TXXXXX—2018甘蔗白叶病病原巢式PCR检测技术规程2018-XX-XX发布2018-XX-XX实施云南省质量技术监督局发布DB53/TXXXXX—2018I前言本标准按照GB/T1.1-xx《标准化工作导则第1部分标准的结构和编写》给出的规则起草。 本标准由云南省农业科学院提出。 本标准由云南省农业标准化技术委员会(YNTC07)归口。 本标准起草单位云南省农业科学院甘蔗研究所
2、。 本标准主要起草人仓晓燕、黄应昆、李文凤、王晓燕、张荣跃、单红丽、罗志明、尹炯。 DB53/TXXXXX—20181甘蔗白叶病病原巢式PCR检测技术规程1范围本标准规定了仪器与器材、试剂、采样及样品处理、DNA提取、巢式PCR检测、及结果判定等。 本标准适用于甘蔗白叶病病原巢式PCR检测。 2规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。 凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。 凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB/T28067甘蔗黄叶病毒实时荧光RT-PC
3、R检测方法。 3术语和定义下列术语和定义适用于本文件。 3.1巢式PCR巢式PCR是一种使用两对PCR引物扩增完整的片段,第一对PCR引物扩增片段和普通PCR相似,第二对引物结合在第一次PCR产物内部,使得二次PCR扩增灵敏度高于一次PCR扩增的变异聚合酶链反应。 4缩略语下列缩略语适用于本文件。 bp碱基对(basepair)CTAB十六烷基三甲基溴化铵(HexadecylTrimethylAmmoniumBromide)dNTPs脱氧核苷三磷酸混合液(DeoxyribonucleosideTriphosphatesmi
4、xture)ddH2O双蒸水EDTA乙二胺四乙酸(EdetateDisodium)PCR聚合酶链式反应(Polymerasechainreaction)Tris三羟甲基氨基甲烷(HydroxymethylMethylAminomethane)5仪器与器材、试剂5.1仪器与器材DB53/TXXXXX—20182仪器与器材包括台式离心机、小型离心机、微量可调移液器、恒温水浴锅、旋涡混匀仪、核酸蛋白分析仪、PCR扩增仪、电泳槽、电泳仪等电泳装置、凝胶成像仪、冰箱(温控范围4℃和-20℃)、高压灭菌锅、鼓风干燥箱、液氮罐、电子天平、带滤芯
5、移液头、PCR反应管等。 5.2试剂除另有规定外,所用试剂均为分析纯。 5.2.1DNA提取试剂DNA提取试剂及配制方法见附录A。 5.2.2PCR试剂PCR试剂及配制方法参见附录A。 5.2.3电泳缓冲液储存液为50倍TAE电泳缓冲液,配制方法见附录A,工作液用ddH2O将储存液稀释50倍后获得。 5.2.4扩增产物检测试剂琼脂糖、Goldenview核酸染料、6倍上样缓冲液、DNA分子量标准。 6采样及样品处理6.1采样工具采样工具处理按照GB/T28067的要求执行。 6.2采样方法采样方法参照GB/T2806
6、7的要求执行。 其中,叶片样品采集时首选疑似甘蔗白叶病病株,具体参见附录B,样品独立分装,编号备用。 6.3样品保存样品存放与运送按照GB/T28067要求执行。 7DNA提取DNA提取方法参见附录A8巢式PCR检测巢式PCR检测方法参见附录C。 9结果判定DB53/TXXXXX—20183阳性对照有条带,阴性对照和空白对照无条带时,检测结果有效,当检测结果有效时,依据表1进行结果判定。 表1判定表目的条带大小(bp)样品阳性对照阴性对照空白对照结果判定1240有有无无含白叶病植原体1240无有无无不含白叶病植原体DB5
7、3/TXXXXX—20184AA附录A(规范性性附录)DNA提取A.1DNA提取试剂配制DNA提取试剂配制方法见表A.1。 表A.12倍CTAB抽提缓冲液组分配制量(L)配制方法1.0mol·L-1Tris-HCl(pH8.0)母液1称取121.0gTris,溶解于800mL的ddH2O中,用6mol·L-1的HCL调节pH至8.0后,用ddH2O定容到1.0L。 0.5mol·L-1EDTA(pH8.0)的母液1称取186.0gNa2EDTA·2H2O,加入800mLddH2O,充分搅拌,用2mol·L-1的NaOH调节pH
8、至8.0后,用ddH2O定容到1.0L。 2倍CTAB抽提缓冲液1依次加入20g的CTAB粉末,100mL的1.0mol·L-1的Tris-HCl(pH8.0)母液,40mL的0.5mol·L-1的EDTA(pH8.0)的母液,81.8g的NaC
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