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时间:2020-01-19
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1、PubMed数据库川北医学院文献检索教研室黄老师2007年12月PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统。PubMed是NCBIEntrez数据库查询系统中的一个。PubMed提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务,收录世界1950年以来近5000种是生物医学期刊,累积文献达1600万,90%为英文。PubMed包含与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据及序列中心的数据等等。PubMed提供分子生
2、物学数据库的链接与接入服务,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。IndexMedicus,简称《IM》,印刷型检索刊物,1879-2004MedLine,光盘数据库,1983—PubMed,网络数据库,1997—MedicalSubjectHeadings,简称《MeSH》,医学主题词表,数据标引依据1.MEDLINE2.Pre-MEDLINE[PubMed-inprocess]3.出版商直接提供的其它文献数据[PubMed-assuppliedbypublisher]
3、PubMed与NCBI的8个数据库建立了超链接并进行了整合。1.Nucleotide(核苷酸序列数据库):该数据库由国际核苷酸序列数据库成员美国国立卫生研究院GenBank、日本DNA数据库和英国的欧洲分子生物学实验室数据库三部分数据组成。这三个组织联合组成国际核苷酸序列数据库协作体,每天交换各自数据库中的新增序列记录,实现数据共享。2.Protein(蛋白质序列数据库):包括各种来源的蛋白序列,这其中包括蛋白质信息资源、蛋白质研究奖励会(日)、蛋白质资料库中的蛋白序列数据。其收录的蛋白序列都有各类链接信息。3
4、.Genome(基因组数据库):提供了多种基因组、完全染色体、Contiged序列图谱以及一体化基因物理图谱。4.Structure(结构数据库或称分子模型数据库):包含来自X线晶体学和三维结构的实验数据。其数据从ProteinDataBank获得。NCBI已经将结构数据交叉链接到书目信息、序列数据库和NCBI的Taxonomy中,运用NCBI的3D结构浏览器,可以获得分子的分子结构间相互作用的图像。5.OMIM(孟德尔遗传学数据库):是人类基因和基因疾病的目录数据库。该数据库包括原文信息、图片和参考信息,同时
5、还可以链接到Entrez系统MEDLINE数据库中相关文献和序列信息。6.PMC(生命科学期刊全文数据库):是2000年1月由美国国家医学图书馆(NLM)的国家生物技术信息中心建立的生命科学期刊全文数据库,它旨在保存生命科学期刊中的原始研究论文的全文,并在全球范围内免费提供使用。目前加入PMC的期刊116种,这些期刊免费全文访问的时间延迟是出版后0-2个月,并且由PMC直接提供全文。Nucleotide(核苷酸序列数据库)Protein(蛋白质序列数据库)Genome(基因组数据库)Structure(结构数据
6、库或称分子模型数据库)OMIM(孟德尔遗传学数据库)PMC(生命科学期刊全文数据库)JournalsBooks数据库选择区辅助选项Limits:限定检索preview/index:预检索和索引检索History:检索史Clipboard:粘贴板,保存检索记录Details:查看实际检索提问策略PubMedServicesJournalsDatabase(期刊数据库检索)MeSHDatabase(主题词库检索)SingleCitationMatcher(单篇文献检索)BatchCitationMatcher(批量
7、文献检索)ClinicalQueries(临床相关文献检索:与临床相关的疗法,诊断,病因,预后)SpecialQueries(特定文献检索)LinkOut(链接)基本检索功能:1.自动转换匹配检索3.著者检索4.刊名检索5.截词检索8.拼写检查6.主题词自动扩展检索7.布尔逻辑匹配检索2.短语检索课题:“高血压的治疗”hypertensiontherapyHypertension[mh]therapy[sh]Hypertension/therapyHypertension/therapy[mh:noexp]比较
8、下列检索式的检索结果:字段限定检索基本格式:SmithJ[au]Biology[ta]ALLAllFieldsAUAuthors’namesMAJRMeSHMajorTopicMHMeSHTermsSHPSubheadingsSBSubsetDPPublicationDate字段标识符ISISSNLALanguagePTPublicationTypeSOSourceTAJournalT
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