集群快速部署.pdf

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1、Rockscluster安装一.Rocks前端安装准备：带两个网口的机器光驱、Rocks安装系统盘安装1.插入系统盘、设置光盘启动2.光盘启动后你将看到：3.当你看到上图，输入build。将看到如下画面：我们选择IPv4，手动输入，然后选OK确认4.这个时候我们需要输入之前规划好的局域网IP（非集群内ip）5.这个时候我们需要输入之前规划好的局域网IP（非集群内ip）例如：下图，其中nameserver选项需要使用固定的方式，解：Bgisz2genomics.org.cn固定地区第几个集群固定格式6．当我们设置好IP参

2、数，将出现如下：7．下图，这个时候我们需要选择需要安装的rolls8．下图，将显示需要安装的模块，确认后选择下一步9．下图，需要输入集群的信息，10．下图，输入集群规划好的内网IP和掩码11．下图，确认局域网IP和掩码，网关和DNS12．设置时区和时间同步服务器13．下图，此时我们选手动分区14．这时需要我们建立分区：分区结构建议如下；分区大小仅做参考/boot512M/state/partton1200G/opt50G/tmp50G/var50G/swap物理内存X2，物理内存超过32除外，/500G分区后，点下一步

3、，15．下图，系统正在安装中二.Rocks计算节点安装安装前规划，1，因为每个计算节点硬盘大小不同，所以我们需要先在前端节点定义分区信息cd/export/rocks/install/site-profles/5.3/nodescpskeleton.xmlskeleton.xml.bakvimskeleton.xml

echo"clearpart--drives=sda--all--initlabel--linuxpartswap--fstypesw
4、ap--size16000--ondisksdapart/tmp--fstypeext3--size16000--ondisksdapart/--fstypeext3--size1--grow--ondisksda">/tmp/user_partton_info

5、tmpfs7.9G0%/dev/shmDell_M1000ESwap32G物理内存16G/dev/sda127G35%//dev/sda364G2%/tmptmpfs7.9G0%/dev/shm开始安装1．以root身份登录到前端节点。2．运行insert-ethers开启安装程序如下图：如要安装计算节点选compute如安装登录节点选login3．出现下图，表明等待新的计算节点4.下面将准备安装的节点设置为网络启动。获取pxe安装文件5.当前端节点接受到计算节点DHCP请求，将出现如下画面6.当前端节点接受计算节点信

6、息，并写入数据库并更新所有文件。将显示下图：注意（）里是空白，此时计算节点还没有要求获取kickstart文件，7.下图，计算节点已成功地要求从前端一个kickstart文件。如果没有更多的计算节点，您现在可以按F8退出。三.SEG配置1、qconf-mconf，对如下参数做红色部分修改login_shellsbash,sh,ksh,csh,tcsh（bash放在最前边）max_aj_instances2000max_aj_tasks3000max_u_jobs1000max_jobs10000auto_user_de

7、lete_time6048002.qconf-msconf，对如下参数做红色部分修改schedd_job_infotruemaxujobs1003.qconf-mc，对如下参数做红色部分修改num_procpINT<=YESYES104.qconf-me***，对每台计算节点的内存和cpu核数做如下红色配置（根据每个节点的配置数值做调整），如complex_valuesvirtual_free=64G,num_proc=245.sge装好后缺省为all.q，需对如下参数做红色部分修改（qconf-mqall.q）she

8、ll/bin/bash6.在新建队列时，需对如下参数做红色部分修改（qconf-aq***.q）qname***.qhostlist@***hosts（***跟上边.q前的***一致，需先用qconf-ahgrp添加@***hosts）shell/bin/bashuser_lists***q（***跟上边.q前的***一致，需先用