大黄鱼免疫球蛋白重链可变区基因序列特征【开题报告+文献综述+毕业设计】

大黄鱼免疫球蛋白重链可变区基因序列特征【开题报告+文献综述+毕业设计】

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1、本科毕业论文系列开题报告生物技术大黄鱼免疫球蛋白重链可变区基因序列特征一、选题的背景与意义大黄鱼,隶属于脊索动物门(Chordata)、脊椎动物亚门(Vertebrata)、硬骨鱼纲(Osteichthyes)、鲈形目(Perciformes)、鲈形亚目(Percoidei)、石首鱼科(Sciaenidae)、黄鱼属(Larimichthys),为暖温性集群洄游鱼类,为传统“四大海产”之一,是我国主要海产经济鱼类之一。大黄鱼肉质较好且味美,含有丰富的蛋白质、微量元素和维生素,除鲜食和制成特色风味水产品外,还具有药用价值。中医认为,黄鱼有和胃止血、益

2、肾补虚、健脾开胃、安神止痢、益气填精之功效;对贫血、失眠、头晕、食欲不振及妇女产后体虚有良好疗效。但由于过度捕捞以及海洋环境恶化,野生大黄鱼产量急剧下降,大黄鱼养殖因此兴起。然而,近年来,在大黄鱼的人工养殖过程中,出现性成熟提早、病害频繁发生等问题,这些都说明大黄鱼的种质资源出现退化现象。在长期的鱼类病害防治过程中,人们逐步认识到通过鱼类的适应性免疫系统进行病害免疫防治的重要性。由于免疫球蛋白是鱼类适应性体液免疫应答中最主要的介质。免疫球蛋白基本结构是由四肽链组成的,即由二条相对分子量较小的轻链和二条相对分子量较大的重链组成,在免疫球蛋白分子轻链和

3、重链的N端,氨基酸的种类和排列顺序随抗体特异性不同而有所变化,称为可变区,它赋予抗体以特异性。因此,通过对大黄鱼免疫球蛋白基因的研究对增强大黄鱼免疫力,提高抗病害能力显得尤为重要。二、研究的基本内容与拟解决的主要问题:(一)、课题研究的基本内容随机测序大黄鱼肌肉组织cDNA全长文库的克隆菌,获得免疫球蛋白重链可变区序列;运用生物信息学进行序列同源性分析,进行系统进化树分析,蛋白质结构预测分析,总结分析其特征。(二)、拟解决的主要问题1.大黄鱼免疫球蛋白重链可变区基因的结构分析。2.大黄鱼免疫球蛋白重链可变区基因序列与其他物种相比有何特征。三、研究的

4、方法与技术路线:大黄鱼肌肉组织cDNA全长文库菌扩大培养提取质粒EST测序BLAST比对获得目的基因生物信息学分析蛋白质结构分析系统进化树分析序列同源性分析四、研究的总体安排与进度:2010.11—2010.12:查询与论文有关的资料,撰写综述、试验计划。2010.12—2011.01:确定实验方法,熟悉相关软件的应用,翻译外文文献。2011.03—2011.05:进行实验,收集整理实验材料和撰写论文,准备答辩。五、主要参考文献:[1]刘红柏,王荻.史氏鲟免疫球蛋白重链可变区序列及多样性[J].动物学报,2006,52(3):557-563.[2]

5、刘英,朱平,胡亚关.儿童急性B淋巴细胞白血病免疫球蛋白重链可变区基因的分子特征[J].中华血液学杂志,2004,25(1):9-12.[3]ZhangYA,SalinasI,LiJ,etal.IgTaprimitiveimmunoglobulinclassspecializedinmucosalimmunity[J].NatureImmunology,2010,11:827-835.[4]王俊相,李玉萍,孔令富,等.鱼类免疫系统的研究进展[J].四川畜牧兽医,2010,7:29-31.[5]RumfeltLL,DiazM,LohrRL,etal.U

6、nprecedentedmultiplicityofIgtransmembraneandsecretorymRNAformsinthecartilaginousfish[J].JImmunol,2004,173(2):1129-1139.[6]肖凡书,聂品.鱼类免疫球蛋白重链基因与基因座的研究进展[J].水产学报,2010,34(10):1617-1628.[7]GambnDF,SnchezEC,MagadnMS.PresenceofanuniqueIgTontheIGHlocusinthreespinedsticklebackfish(Gaste

7、rosteusaculeatus)andtheveryrecentgenerationofarepertoireofVHgenes[J].Developmental&ComparativeImmunology,2010,34(2):114-122.[8]SavanR,AmanA,SatoK,etal.Discoveryofanewclassofmimunoglobulinheavychainfromfugu[J].EuropeanJournalofImmunology,2005,35(11):3320-3331.[9]王长法,安利国,杨桂文,等.鱼

8、类免疫球蛋白研究进展[J].中国水产科学,1999,6(2):105-107.[10]侯月娥,冯娟,杨清华,等.鱼类免疫球

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