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1、xiaobandeng.com小板凳社区搜集整理二、立论依据(包括项目的研究意义、国内外研究现状分析,并附主要参考文献及出处。)对基础研究,着重结合国际科学发展趋势,论述项目的科学意义;对应用基础研究,着重结合学科前沿、围绕国民经济和社会发展中的重要科技问题,论述其应用前景1.电子信息杂交策略及其在猪基因组研究中的应用现状电子信息杂交策略是依据比较基因组定位结果,充分利用猪EST(expressedsequencetag,EST)数据库的信息资源,借助计算机辅助进行基因的克隆,又称为“siliconcloning”。其基本原理是利用研究深入、标记稠密的哺乳动物基因组保守功能基因的
2、编码区序列(CDS)作为信息探针,在猪EST数据库筛选同源EST(s)(标准:长度≥100bp,同源性75%~95%),排除已克隆EST(s)后进行拼接,设计引物获取基因(cDNA)全长(Altschul等,1990;Mao等,1998;A田芳等,2000;Cirera等,2000)。该方法的特点是:(1)是建立在生物信息学分析的基础上,进行同源性比较和计算机辅助克隆新基因,具有快速、简便、直接等优点;(2)因为该方法在选择候选基因时有很强的目的性,是一种与定位克隆、定位候选克隆策略并列的比较候选基因法;(3)由于该方法是利用的是EST即cDNA部分序列信息,因而能够获得基因(c
3、DNA)全长(Liang等,2000)。利用电子信息杂交策略在分离猪基因中的应用才刚起步(Cirera等,2000),但该方法在人及其它动物基因分离中已经有广泛的应用(Mao等,1998;Bolognese,等,2000;毕安定等,2000;范玉新等,1999),由此可见,利用电子信息杂交策略分离猪基因将具有良好的应用前景,在国内开展十分必要。2.猪12号染色体上基因及遗传与物理的研究现状与不足12号染色体是猪基因组中最小的中部着丝粒染色体,1999年2月22日申请者在网上检索到的猪12号染色体上遗传与物理图谱现状如图1、图2、图3。收录到猪12号染色体上的基因和标记共57个,其
4、中功能基因26个,微卫星标记31个。功能基因有:ALOX12(二十碳四稀酸-12-脂氧合酶,arachidonate12-lipoxygenase);CDC42(GTP结合蛋白,porcineEST,GTPbindingprotein);EAD(红细胞抗原D,erythrocyteantigenD);GH1(生长激素,growthhormone);HOXB6(同源框B6,HomeoboxgeneB6);NME1(Nm23protein);INHBB(抑制素β亚基,Inhibin,betasubunit);KICT(细胞骨架角蛋白类型I,KeratintypeI,cytoskele
5、tal);MCP(单核苷酸趋化蛋白,Monocytechemoattractantprotein);PRKAR1A(cAMP依赖性蛋白激酶调节亚单位类型1A,cAMP-dependentproteinkinaseregulatorytype1alpha);POLR2(大多肽RNA聚合酶Ⅱ,largepolypeptideRNApolymeraseII);TK1(可溶性胸苷激酶1,thymidine更多精彩资料下载尽在小板凳社区www>xiaobandeng.comxiaobandeng.com小板凳社区搜集整理kinase1,soluble);TP53(肿瘤蛋白53,tumour
6、proteinp53);UMPH2(尿苷酸磷酸水解酶2,uridine5'-monophosphatephosphohydrolase2);MAP2C(微管相关蛋白2,microtubuleassociatedprotein2);ACACA(乙酰辅酶A羧化酶,acetyl-coAcarboxylase);MYH2(肌球蛋白重链2,myosinheavychain2);GAS(胃泌素,gastrin);PNMTP(苯基乙醇胺—N—甲基转移酶,phenylethanolamineNmethyltransferase);LPO(乳过氧化物酶,lactoperoxidase);PAX8(
7、成对盒同源蛋白8,pairedboxhomoprotein8);MYH1(骨骼肌肌球蛋白重链,skeletalmyosinheavychain);GRB2(生长因子受体结合蛋白2,growthfactorreceptor-boundprotein2);D20238(humanEST);H01962(humanEST);Z94858(porcineESTb9)。微卫星标记有:S0083,S0090,S0096,S0106,S0143,S0147,S0229,SW1307,SW135
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