向GenBank批量上传序列地方法

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1、实用标准文档向GenBank批量上传序列的方法Qin1.利用DNAstar的editSeq制作待序列的FASTA文档：待上传序列删减至合适长度后，将待上传序列全部打开随后点击File-exportasone，保存文件格式为：*.fas，将待上传序列全部归至一个FASTA文档。注意序列命名：文案大全实用标准文档2.在GenBank的SubmissionTools里，下载序列信息编辑软件Sequin。网址：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/（下图中点击Instructions下载软件）注意打开安装文件后，程序会自动安装在安装包所在的文件夹。3.打开Sequin

2、，点击StartNewSubmission。文案大全实用标准文档4.随后选择序列发布日期，输入论文题目。若之前保存有模板，可以点击下面的“Clickheretoimportatemplate”导入。模板导出在下文的第五点提到。文案大全实用标准文档5.联系人、作者信息、机构或者学校信息文案大全实用标准文档建议导出模板，之后修改信息时可以直接导入模板而不需重新输入。5.选择上传的序列类型。6.导入之前准备好的FASTA文件：文案大全实用标准文档导入之后，输入序列ID（序号ID相当于编号，可以自由命名，只要各个序列的ID不一致即可。在这里以病人编号作为序列ID）：文案大全实用标准文档导入序列成功后

3、，显示各个序列信息如下：文案大全实用标准文档点击SequencingMethod，将测序方法输入：文案大全实用标准文档选择上传序列的用途：病毒类型：文案大全实用标准文档5.编辑每条序列的信息：点击ImportSourceTable可以导入模板，点击ExportThisTable可以输出模板备用。6.选择核酸类型，序列内容后，点击OpenRecordViewer。文案大全实用标准文档5.添加每条序列的信息，包括编码区重复区RNA结构等等。双击相关信息可进行修改，点击Annotate添加相关信息。文案大全实用标准文档5.检查信息是否有误（也可以点击Search里的Validate检测是否有明显错

4、误）：有些错误是可以忽略的，如上传的序列为CDS序列，那么软件报错”序列无终止子”时可忽略。随后，点击Done保存待上传序列：注意此时保存的文件包含所有序列信息，因此只需保存一次即可。文案大全实用标准文档12.将保存好的文件作为邮件附件，发送至：gb-sub@ncbi.nlm.nih.gov13.收到accessionnumber即表示上传成功。文案大全实用标准文档文案大全