基于茎环引物定量检测miRNA的研究进展_宋伟

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1、基于茎环引物定量检测miRNA的研究进展*宋伟,万百惠,王静,董平,梁兴国(中国海洋大学食品科学与工程学院,山东青岛266003)摘要:MicroRNAs(miRNAs)是一类长约22nt的内源RNA,通过抑制和破坏RNA的方式对动植物体内的基因表达起重要调节作用,其相关方面的研究已成为热点。针对miRNA巧妙设计茎环引物(Stem-loopPrimer),经过反转录、PCR扩增两个步骤,可使实时荧光定量PCR技术(RT-qRCR)用于miRNA的定量检测,简称SLP-RT-qPCR技术。这种茎环引物定量检测技术有特异性强

2、、灵敏度高、可检测范围广和定量准确等特点。另外,最近开发的多重定量法可以同时对样品中多种miRNA进行定量。以上诸多优势,使之对miRNA的研究起到了有力的推动作用。本文系统介绍了该技术自建立近十年来在引物设计、多重定量、荧光标记等方面的发展及其应用情况,对其原理及关键技术进行综述,以期对miRNA的定量检测的应用和发展有所帮助。关键词:microRNA,RT-qPCR,茎环引物,测定ResearchadvanceofmiRNAquantificationbyRT-qPCRbasedonstem-loopprimer*SO

3、NGWei,WANBai-hui,WANGJing,DONGPing,LIANGXing-guo(CollegeofFoodScienceandEngineering,OceanUniversityofChina,Qingdao266003,China)Abstract:MicroRNAs(miRNAs)areatypeofendogenousRNAs(~22nt)whichplayanimportantrolesingeneexpressionandregulationofanimalsandplantscellsbyd

4、estroyingorsuppressingtargetingRNAs.Thus,theresearchesrelatedtomiRNAhaveattractedmoreandmoreattentions.ToquantifyacertainmiRNA,RealTime-quantitativePCR(RT-qRCR)couldbeadoptedincludingreversetranscriptionandPCRamplificationusingastem-loopprimerdesignedaccordingtoth

5、etargetmiRNA.ThismethodiscalledSLP-RT-qPCRforshort.ThemiRNAquantificationmethodusingSLP-RT-qPCRhasalotofadvantages,includinghighspecificity,highsensitivity,widedetectionrange,precisequantification,etc.Moreover,multiplexingRT-PCRdevelopedinrecentyearsmadeitpossible

6、todetermineseveralkindsofmiRNAssimultaneously.AlltheadvantagesmentionedabovegreatlypromotedthestudyofmiRNA.Inthispaper,thedevelopmentandapplicationofprimerdesign,multi-quantificationandfluorescencelabelingfromtheestablishmentofthemethodabouttenyearsagowasintroduce

7、d.Thetheoryandkeytechnologiesofthismethodwasalsoreviewed.ThereviewwillbehelpfultotheapplicationanddevelopmentofmiRNAquantification.Keywords:microRNA;RT-qPCR;stem-loopprimer;determination中图分类号:TS201.1文献标识码:A文章编号:1002-0306(2014)19-0378-06doi:10.13386/j.issn1002-0306

8、.2014.19.074[5-7][8]miRNA是一类广泛存在于生物体内的非编码作用。近期Zhang等人以小鼠作为研究对象,[1]RNA,长度约为22nt。自1993年Lee等人首先发对经口服摄入的植物miRNA的功能进行研究,惊喜现lin-4基因表达的一种小RNA(lin-4RNA)以来,的发现大米

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