DigitalMicrograph使用手册

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1、美国Gatan公司/科扬国际贸易（上海）有限公司第二期数字电子显微学训练班DigitalMicreograph软件练习（2005年5月中国杭州）DigitalMicrograph软件入门在电子显微学界GatanDigitalMicrograph(DM)是一个为人皆知的软件。DM具有采集图像，图像处理和分析，数据管理和报告打印等多种功能。为了使广大用户能够更好地熟悉和掌握DM的多种功能，我们特别编辑了这本练习册。由于DM软件的功能五花八门，丰富多彩，我们不可能对它的每一项功能作详细的介绍。本练习册汇集了一些代表性很强的练习。每一个练习都有详细的步骤说明

2、。希望以此能够将读者带进门，以便日后自学提高对DM软件的理解和操作使用能力。从而更好地满足用户在数字电子显微学方面的需求。数字暗室同传统的底片技术相比，数字图像最突出的优点在于图像可以很容易地通过计算机软件进行多种操作与变换。很多同暗室相关的实验步骤都可以通过软件在计算机中很容易地实现。比如，调节图像的亮度或衬度，选区放大，图像的非均匀亮度调节（遮挡曝光），图像粘贴，贴字和测量等。上面所举的例子构成了数字暗室的基础。数字暗室图像技术可以大大地提高工作效率。通过使用计算机软件，很多繁琐，重复性高和费力的工作步骤可以被大大地简化。这一点仅从获取一张洗印好

3、的图片所需经过的全过程就可以清楚地说明（底片冲洗，暗室放大，贴字等）。修订本2.0(2005年5月)2DigitalMicrograph工作环境全貌(DMMenu)菜单：多种操作指令按照其功能分类。(DMTool)工具;这些可移动窗口包括标准工具以及多种与被显示图像有关的信息。(Image)图像：图像在DM软件里被显示的位置。(Results)结果：这个文字窗口包含DM软件在运行中的一些输出信息。比如图像分析和测量的结果。窗口里面的文字可以被拷贝或以文件格式存储。修订本2.0(2005年5月)3练习一1．图像的亮度与衬度图像亮度与衬度的调节是保证图像

4、质量的重要一环。DM可以很容易地对图像的亮度和衬度进行调节。为了更好地说明DM调节亮度和衬度的原理，我们首先讲解一下计算机屏幕显示的原理。一般来讲，屏幕显示器的灰度为8位（黑白）24位（彩色）。Gatan数码相机最低是12位（最高16位）。一个12位的数字图像含有4096个强度值。屏幕显示器的灰度分辨率为256（8位）。因为图像的强度分辨率大于显示器的灰度级别，所以我们必须首先确定怎样使用有限的显示器灰度来显示图像中更高数目的强度。换句话说，我们可以在图像中任选两个强度值，指定较低的强度为屏幕显示器的黑色（灰度=0），较高的强度为屏幕显示器的白色（灰

5、度=255）。由此我们定义了一个图像（4096个强度值）与显示器（256灰度）之间的相互关系。图像亮度与衬度的调节实际上就是改变上述图像与显示器的相互关系。操作步骤：在计算机桌面的文件夹(GatanSchool)里，打开（单击）图像”Nerve.5.dm3”.DigitalMicrograph软件启动并显示图像。这是一个衬度较低的图像。图像中的铜网像（黑）大大地影响了样品真实图像的显示。请按照以下的步骤说明来调节图像的亮度和衬度。－在显示窗口中，使用亮度和衬度划尺来优化图像的显示。－双击”Contrast”或”Brightness”可以复原亮度或衬度

6、的初值。(请练习并学会使用)。修订本2.0(2005年5月)4－强度直方图”Histogram”窗口（如下），用鼠标选择位于右边的强度峰（点击峰的左端，按下鼠标并拖至峰的右端）。这个操作改变了上面提到的图像与显示器之间的相互关系。从而改变了图像的显示。Å双击此处－双击直方图窗口下端的灰度横带可以复原直方图的初始显示值。(请练习并学会使用)。－使用在显示窗口中的”gamma”划尺也可以改变图像的显示。双击”Gamma”可以复原其初始值。(请练习并学会使用)。强度直方图窗口中的曲线称为“衬度变换曲线”（它就是我们上面提到的图像与显示器之间的强度对应关系）

7、。在线性模式里，它是一条直线。在”gamma”显示模式中，它变为非线性关系。此外通过选择ImageDisplay…(在Object菜单下)，也可以把线性模式变为非线性。具体步骤如下：修订本2.0(2005年5月)5在图像显示的对话窗口中(上右图)，用鼠标点击衬度(Contrast)。然后在其右面的模式(Mode)选择项中，选取均匀化(Equalized)。最后点击OK退出。用划尺调节亮度或衬度，并观察图像的变化。此时强度直方图中的曲线已经不再是直线了。现在我们再回到原先的线性模式(ImageDisplay…,选择Linearmode).在考察(sur

8、vey)设定选择中，练习选择cross-wire。用鼠标选择自动考察(AutoSurvey)。然后用鼠标点击