第5节 细菌分类

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1、细菌的分类与命名细菌分类学细菌分类学是对细菌进行分类、命名与鉴定的一门学科。任务是在全面了解细菌生物学特征的基础上，研究它们的种类，探索其起源、演化以及与其他类群之间的亲缘关系，进而提出能反映自然发展的分类系统，并将细菌加以分门别类。它包括分类、命名和鉴定三个方面。一、基本概念1．细菌分类根据细菌各自的特征，并按照亲缘关系分类，以不同等级编排系统。分类有两种：①细菌的生理生化分类法，包括有传统分类法和数值分类法；②细菌核酸、蛋白质结构的同源程度进行分类法，称种系分类或自然分类。2．细菌命名在分类基础上，给每种细菌一个科学名

2、称，便于交流并保证所有的科研工作者给予同样名称。3．细菌鉴定将未知细菌按分类原则,确定细菌的分类地位。二、分类等级1.细菌的分类等级依次为界、门、纲、目、科、属、种。细菌属于原核生物界，包括有细菌、放线菌、支原体、衣原体、立克次体和螺旋体。分类等级表示方法如下：目、亚目、科、亚科等。2.种是细菌分类的基本单位，将生物学性状基本相同的细菌群体归成一个菌种；性状相近、关系密切的若干菌种组成一个菌属；相近的属归为一科；依次类推。在两个等级之间，可添加次要的分类单位，如亚门、亚纲、亚属和亚种等。群和组不是正式分类等级，具有某种共同

3、特性的某个集体，任何等级都可借用。3.同一菌种在某些方面仍有差异，可再分成亚种，亚种以下的分类等级为型，以区别某些特殊的特征。例如抗原结构不同而分的血清型；对噬菌体敏感性不同的噬菌体型；对细菌素敏感性不同的细菌素型，生化反应和某些生物学性状不同的生物型。4.由不同来源分离的同一种、同一亚种或同一型的细菌，称为株。株是从一次单独分离物的单个原始菌落传代的纯培养物，例如从10个肺结核患者的痰液中分离出的10株结核分枝杆菌。具有某种细菌典型特征的菌株称为模式菌或标准菌株，它是该种菌株的参比菌株。在细菌的分类、鉴定和命名时以模式菌

4、为依据，也可作为质量控制的标准。三、细菌命名法细菌的学名的生物双名式，具备拉丁化文字形式和明确分类等级的两个特点，即有一个属名和一个种名构成。属名在前，是名词，首字母大写；种名在后，是形容词，均用小写；两者均用斜体表示。细菌学名的中文译名则种名在前，属名在后。例如Salmonellatyphi(沙寒沙门菌)。属名也可用第一个字母代表，如Styphi等。有时泛指某一属细菌而不特指其中的某个细菌则可在属名之后加上sp，如Salmonellasp，即表示沙门菌属细菌(sp代表菌种species，复数用spp)；如果使用1个亚种的

5、名称，则在种名后再加亚种名如Klesbsiellapenumomaesubspeciespneumomae。细菌的分类方法一、生理学与生化学分类法细菌的形态、染色以及特殊结构是最早的分类依据，方法有传统分类和数值分类法两种。1．传统分类法19世纪以来，以形态生理特征为依据选择稳定的生物学性状，如形态结构、染色性、培养特性、生化反应、抗原性作为分类依据，然后按主次顺序逐级区分。使用方便，分类亦明确，但有主观性。2．数值分类法20世纪60年代，随计算机的应用而发展的分类方法。它对各种生物学性状按“等重要原则”进行分类，选用50

6、项以上的生理生化指标进行比较，分析相似度，划分属和种，并确定亲缘关系。二、遗传学分类法遗传学分类是以细菌的核酸、蛋白质等组成的同源程度分类。该分类法的优点是：①对细菌的“种”有较为一致的概念；②使分类不会出现根本性的变化；③可制定可靠的细菌鉴定方案；④有利于了解进化和亲缘关系。基因型分类法有如下几种:1．DNAG+Cmol％测定DNA分子两条链上4种碱基的总分子量为100，测定其中G+C或A／T摩尔百分比，能反映出细菌间DNA分子同源程度，习惯上以G+C作为细菌分类标记。不同菌属间的G+Cmol％范围很大，在25％—75％

7、之间，但同一种细菌G+Cmol％相当稳定，不受菌龄、培养条件和其他外界因素影响，亲缘关系越近的细菌，它们G+Cmol％越相近。2．核酸同源值测定利用DNA分子杂交技术测定DNA分子的相似度。其步骤是先提取DNA，加热变性解链,然后将两种变性的DNA(其中一种为标记DNA或rRNA)混合液在一定的温度下保温复性,重新得到杂交的双螺旋DNA分子，鉴定其双螺旋结合率。结合率大小反映DNA碱基序列相似程度和菌种间的亲缘关系。同一菌的结合率为100％，80％—90％的同源为同种内、同亚种的细菌，60％-70％的同源性为同种内不同亚种

8、的细菌，20％-60％则认为是同属中的不同菌种。3．核蛋白体RNA碱基序列测定细菌核蛋白体RNA序列比较保守，其变化十分缓慢。分离提取细菌16SrRNA，用T1核酸酶消化，分析寡核苷酸的碱基序列可测出rRNA的相关性。绘制各类群关系和树状谱，从而确定种系的发生关系。细菌的分类糸统医学有关的细菌分类表Ⅰ类