第4章_化学软件ChemOffice

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1、第4章化学软件ChemOffice4.1概述4.2化学结构绘图软件CHEMDRAW4.3分子模型及仿真软件CHEM3D4.4化学信息搜索引擎CHEMFINDER化学与化学工程学院4.1概述ChemOffice软件是由剑桥化学软件公司开发的集成化学软件桌面系统,集成了Chem3D、ChemDraw、ChemFinder和ChemInfo,以及ChemTableEditor等软件,具有强大的高端开发功能。ChemDrawUltra8.0化学结构绘图Chem3DUltra8.0分子模型及仿真ChemFinderPro8.0

2、化学信息搜寻整合系统E2NotebookUltra8.0BioAssayPro8.0量化软件MOPAC、Gaussian和GAMESS的界面ChemSARServerExceClogP,CombiChemPExcel化学与化学工程学院4.2化学结构绘图软件ChemDrawChemDraw软件功能十分强大,可以编辑、绘制与化学有关的一切图形,如建立和编辑各类分子式、方程式、结构式、立体图形、对称图形、轨道等,并能对图形进行编辑、翻转、旋转、缩放、存储、复制、粘贴等多种操作。用它绘制的图形可以直接复制粘贴到Word软件中

3、使用。最新版本的软件还可以生成分子模型、建立和管理化学信息库、增加了光谱化学工具等功能。化学与化学工程学院4.2.1主界面图4-1ChemDraw的主界面化学与化学工程学院(1)菜单栏菜单栏共有11个下拉菜单,每一个下拉菜单中都包括相应的命令。其中如果相应的命令前有√,则该条命令已经被执行;若命令后有小三角表示该指示条有子菜单;指示条灰色表示该命令未激活。图4-2ChemDraw的菜单栏化学与化学工程学院“File”菜单命令图4-3文件命令的下拉菜单化学与化学工程学院图4-4文件命令的对话框文件命令对话框化学与化学工

4、程学院图4-5主工具图标板主工具图标板(2)化学与化学工程学院图4-6主工具图表板的子图标板主工具图表板化学与化学工程学院4.2.2模板图4-7模板工具图标板示例化学与化学工程学院4.2.3绘制与编辑典型化学物质结构式(1)键工具:主工具图标板上提供了九个键操作的命令,其中双键命令板中的子菜单中还包括12个键命令。利用键工具进行结构绘制操作的基本操作:首先在命令面板中选取键命令,绘制的基本操作是“点位”、“拖动”和“点击”。化学与化学工程学院图4-8绘制分子结构的基本操作化学与化学工程学院①键的产生:点位后,向某个方

5、向拖动可以产生。直接单击,产生所选择类型的化学键,连续点击两键相连默认角度为120度。点位位于一键的起点(显示小蓝块),沿键拖动会产生重键。点位为于键中间,单击同样可以产生重键(三键点击后变单键)。图4-9官能团或元素符号的输入②元素符号的输入:化学与化学工程学院③键及元素文本属性的设置:图4-10目标设置窗口化学与化学工程学院(2)环工具:主工具面板中提供了10种环工具命令,其中在模板命令中还有芳香化合物模板和双环模板可以绘制环状化合物。环的绘制环的连接化学与化学工程学院面板中选取相应的环命令后,直接在绘制区点击可

6、产生相应的环。点住鼠标左键不放,拖动鼠标可以对环的大小,放置的角度进行自由改变。环己烷的椅式构型直接点击为水平放置,按Shift键点击可由水平变为垂直。在面板中任选一环命令,按Ctrl键点击,可以在环中产生不定域共轭圈。化学与化学工程学院选择键命令或环命令,直接在环的任何一个节点处点击或拖动可以实现键的连接或环与环的点连接。选择环的一个节点,按住鼠标左键,从一个节点拖至另一个节点,可以实现环与环的双点连接。元素符号的输入与目标参数的设置与键操作类似,同样在“Structure”菜单中可以对选择的键的属性进行设定。化学

7、与化学工程学院(3)链工具选取长链工具,在需要进行的连接原子或环上点击或拖动可产生链;同时弹出链长对话框,可以选择增长链的长度。①链的绘制图4-11链长对话框②链属性的设置化学与化学工程学院(4)化合物结构绘制示例图4-12胡萝卜素结构化学与化学工程学院图4-13连接点及单键的产生化学与化学工程学院图4-14长链的生成化学与化学工程学院结构的复制及旋转化学与化学工程学院两个结构的连接连接前的胡萝卜素结构化学与化学工程学院4.2.4化合物结构与命名4-17命名示例图示表化学与化学工程学院4.2.5绘制化学反应方程式(1

8、)反应物结构式的绘制普通分子结构的绘制离子结构的绘制中间体结构的绘制立体结构的绘制(2)方程式的建立箭头的选择利用绘图工具选择合适的阴影框罩住方程式化学与化学工程学院(3)化学反应方程式绘制举例乙酰水杨酸又称为阿司匹林,为常用的退热镇痛药物。制备乙酰水杨酸最常用的方法是将水杨酸与乙酐作用,生成乙酰水杨酸。化学与化学工程学院图4-18复制修改得到

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