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时间:2019-10-22
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1、古细菌Pyrococcushorikoshii糖酵解途径酶类的生物信息学统计作者姓名专业指导教师姓名专业技术职务沙岩生物技术刘波(目录格式)目录(三号、黑体、居屮、目录两字空四格、与正文空一行)第一章(空两格)☆☆☆☆☆(小三号、黑体字)1.1.!☆☆☆(四号黑体)□□1.2.1☆☆☆151・2.?☆☆☆24第二章(空两格)☆☆☆☆☆292・1☆☆☆292.?☆☆☆35葡萄糖通过“中心代谢途径"降解为丙酮酸的过程对于生物体物质及能量的代谢具有重要的作用。古细菌的葡萄糖酵解过程具有与真核生物以及细菌葡萄糖代谢显著不同的特征。随着基因
2、组学和蛋白质组学的发展,生物信息学在数据处理中的应用已经越来越广泛。作为数据处理中越来越重要的分析手段,蛋白质组学数据库是蛋白质组学的主要内容之一。生物信息学是以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。序列比对是生物信息学中的一个基本问题,设计快速而有效的序列比对算法是生物信息学研究的一个重要内容,通过序列比较可以发现生物序列中的功能、结构和进化的信息,序列比较的基本操作是比对。本文介绍了序列比对算法的发展现状,描述了常用的各类序列比对算法,并分析了它们的优劣。本实验通过生物信息学分析,运用GenBank.Clustal
3、X.ClustalW.Swiss-Model.BLAST等数据库和工具,得到与古细菌糖酵解途径酶类的关键词:生物信息学ABSTRACTGlucoseisdegradedtopyruvateviathesocalled"centralmetabolicpathways"thatplayvitalrolesinthecarbohydrateandenergymetabolismoforganisms.Somevariancestotheclassicalglycolyticpathwaysinbacteriaandeukaryaare
4、presentedintheglycolysisofarchaea.Bioinformaticsplaysanimportantroleingenomicsandproteomicstoanalyzethevastdatafromexperiments.Recently,manylabsestablishedalotofproteomicdatabases.Bioinformaticsisthesubjectofusingcomputertostore,retrieveandanalyzebiologicalinformation
5、.SequencealignmentisabasicprobleminBioinformatics,anditsmainresearchworkistodeveloprapidandeffectivesequencealignmentalgorithms.Wemaydiscoverfunctional,structuralandevolutionaryinformationinbiologicalsequencesbysequencecomparing・Thispaperintroducesthedevelopmentactual
6、ityofsequencealignmentalgorithms,describesvarietyofsequencealignmentalgorithmandanalysestheadvantagesanddisadvantagesofthem.Theexperimentthroughthebioinformaticsanalysis,useGenBank,ClustalX,ClustalW,Swiss-Model,BLASTandotherdatabasesandtools,hasbeenwiththeancientwayso
7、fbacterialenzymesofglycolysis・Keywords:Bioinformatics第一章前言1.1古细菌概述古细菌(archaeobacteria)(又可叫做古生菌、古菌、古核细胞或原细菌)是一类很特殊的细菌,多生活在极端的生态环境中。具有原核生物的某些特征,如无核膜及内膜系统;也冇真核生物的特征,如以卬硫氨酸起始蛋白质的合成、核糖体对氯霉素不敏感、RNA聚合酶和真核细胞的相似、DNA具有内含了并结合组蛋白;此外还具有既不同于原核细胞也不同于真核细胞的特征,女口:细胞膜屮的脂类是不可皂化的;细胞壁不含肽聚糖
8、,有的以蛋白质为主,有的含杂多糖,有的类似于肽聚糖,但都不含胞壁酸、D型氨基酸和二氨基庚二酸。自古细菌被分为一个单独域以来,随着其新类群的不断发现,现在古细菌可分为广古细菌(Euryarchaeota)、泉古细菌(Crenarchaeota)、古古
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