数量遗传学论文

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1、猪QTL定位研究进展罗琰(华中农业大学动物科技学院,湖北武汉430070)摘要:数量性状位点(QTL)的定位是鉴别家畜控制重要经济性状基因的第一步。人类基因组计划和分子生物学技术的飞速发展及其应用,推动了猪基因图谱的研究进展,使猪的QTL定位研究取得长足的进展,从而为利用分子标记进行数量性状位点的鉴别和定位奠定了坚实的基础。本文概述了影响猪繁殖、生长、肉质、胴体等主要经济性状的QTLs定位研究进展情况。关键词:猪;QTL;定位;研允进展猪是人类最早驯养的动物之一,具有重要的经济价值,且其经济性状多受数量性状位点(quantitativetraitloci,QTL)控

2、制,因而QTL的研究已成为国际上的研究热点,并已取得了一定的成果。目前,对猪数量性状的研究已发展为直接将研究目标指向各个数量性状位点,借助各种分子遗传标记,构建遗传连锁图谱,通过一定的统计分析方法,从而将影响数量性状的多个基因剖分开來,将其定位于特定的染色体区域,确定它们与其它基因的关系,最终分析出英DNA序列。现今,己经检测出了与猪各种性状相关的4928个QTL,为猪的品种改良和数量性状主效基因的检测及应用研究提供了重要的参考依据和前提条件。1QTL及其定位QTL的概念是由Geldermann(1975年)最先提出的,是指数量性状的基因在基因组中的位置,是对某一数

3、量性状有一定决定作用的单个基因或微效多基因簇猪的生长速度、瘦肉率、采食量、肉质性状、产仔率和抗病性等大多数经济性状受数量性状基因座控制。目前,猪的应激敏感基因、高产仔数基因、瘦肉率和脂肪率座位等具有重要经济价值的基因12被定位或发现了与其连锁的DNA标记,其小部分已定位的基因,在育种中发挥着重要的作用,展现出基因定位和遗传图谱研究的价值。虽然分了标记取得了许多进展,但尚处于初始阶段,QTL的特点是多基因的微效性,且在染色体上存在着数以口计甚至千计的QTL,已显出很好的发展前景。近年来,应用DNA分子标记技术,对数量性状基因结构的研究表明,一个数量性状的QTL并不很多

4、,一般为4-8个。每个QTL为一个孟徳尔因子,它可能是一个基因,也可能是由两个或两个以上的基因组成的基因群。这些QTL的效应大小并不相等,有些效应较大,一个主QTL就能反映一个数量性状表型变异的10%或遗传总变异的20%以上,相反有些QTL效应较小;这与传统数量遗传学中微效多基因的效应相等的观点不一致。研究还发现,在QTL效应上,多数QTL既有加性效应也有显性效应,但主要以加性效应为主,少数的QTL还存在超显性效应和上位效应。这表明一个形状的QTL间一般是相对独立的,相关性状的QTL间以及QTL与相关的质量性状基因间多数具冇较大的相关性,这一结果对数量性状的间接选择

5、具有重要意义,但也成为育种中突破不利负相关一道难题。QTL一般易受环境条件的影响,特别是效应较小的QTL,同一品种在不同环境条件下检测到的QTL不同,即环境特异(environment-specific),这可能是数量性状易受环境条件影响的遗传基础。此外,应用公共的DNA标记探针,对不同物种的QTL图谱进行比较研究的结果表明,不同物种间的许多DNA分了标记和QTL图位在基因图谱上十分相似。可能物种间存在着许多共起源的QTL,这样就可以用它来分析物种的起源进化过程2定位QTL最常用的方法是分离分析法、候选基因法和基因组扫描法(genomescanning)o分离分析

6、法被认为是根据表型资料检测主效基因的有效方法,同时也可以减少QTL定位的盲目性⑶。目前借助分子生物学技术进行QTL检测的方法主耍有两类,一类是标记-QTL连锁分析(Mark-QTLlinkageanalysis),也称为基因组扫描(genomescanning);另一类是候选基因分析(candidategeneapproach)!"o标记-QTL连锁分析是基于遗传标记座位等位基因与QTL等位基因Z间的连锁不平衡关系,通过对遗传标记从亲代到了代遗传过程的追踪以及它们在群体中的分离与数量性状表现之间的关系分析,來判断是否有QTL存在、它们在染色体上的相对位置以及它们的效

7、应大小,因而这类方法的前提是:①耍有理想的遗传标记;②要有合适的群体用于进行分析;③在该群体中仍在分离的qtlI5-6]o2猪主要经济性状数量性状位点定位研究2.1繁殖性状QTL的定位排卵率是决定猪产仔数高低的一个重要决定因素,对该性状QTL的定位工作一直是动物遗传学家研究的垂点内容。1996年,Wilkie等⑺首先发现在8号染色体上存在控制排卵率的QTL。在这之后,Rathje等囿和Rohrer等⑼的研究也证实了这一结果,Rathje等还将该QTL定位在和标记SW790相距3cm的区域内。但是,三者在该性状的定位区域上并不相同。Wilkie等认为,该QTL位于

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