浅谈蛋白质折叠

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1、浅谈蛋白质折叠姓名:申磊丰学号:04002612关键字:生物大分子蛋白质的折叠分子伴侣蛋白质聚集大分子拥挤影响灵活性牛物大分子的结构与功能的研究是了解分子水平的先象的基础。没有对仝物人分子的结构与功能的认识,就没冇分子生物学。正如没冇DNA双螺旋结构的发现,就没冇遗传传达传递的屮心法则,也就没冇今天的分子生物学。结构分子以由第一分子进入对复和物乃至多亚基,多分子复和体结构研究。同时,过去难以研究的分子水平上的生命运动情况也随着研究的深入和技术手段的发展而逐渐由难点变为热点。蛋白质晶体学研究己从牛物大分子静态(时间统计)的结构分析开始进入动态(时间分辨)的结构分

2、析及动力学分析。第I-三届国际生物物理大会的25个专题讨论会中冇一半以上涉及蛋白质的结构与功能,而“结构与功能”又强调“动力学(Dynamics)”,即动态的结构或结构的运动少蛋白质分子功能的关系,以及对大分子相互作用的贡献。蛋白质折叠问题被列为“21世纪的生物物理学”的重要课题,它是分子生物学中心法则尚未解决的一个重人生物学问题。从一级序列预测蛋白质分了的三级结构外进一步预测其功能,是极富挑战性的工作。研究蛋口质折叠,尤其是折叠早期过程,即新生肽段的折叠过程是全面的最终阐明屮心法则的一个根本问题,在这一领域中,近年来的新发现对新生肽段能够自发进行折叠的传统概

3、念做了根木的修止。这其中,X射线晶体衍射和各种波谱技术以及电子显微镜技术等发挥了极其重耍的作用。笫十三届国际生物物理人会上,Nobel奖获得者Ernst在报告中强调指出,NMR用于研究蛋白质的一个主要优点在于它能极为详细的研究蛋白质分了的动力学,即动态的结构或结构的运动与蛋白质分了功能的关系。hl前的NMR技术已经能够在秒到皮秒的吋间域I:观察蛋白质结构的运动过程,其小包括主链和侧链的运动,以及在各种不同的温度和压力下蛋白质的折叠和去折叠过程。蛋白质大分子的结构分析也不仅仅只是解出某个具休的结构,而是更加关注结构的涨落和运动。例如,运输小分子的酶和蛋口质通常存

4、在着两种构象,结合配体的和未结合配体的。一种构象内的结构涨落是构象转变所必需的前奏,因此需要把光谱学,波谱学和X射线结构分析结合起来研究结构涨落的平衡,构象改变和改变过程屮形成的多种屮间态,又如,为了了解蛋白质是如何折叠的,就必须知道折叠时儿个基本过程的时间尺度和机制,包括二级结构(螺旋和折叠)的形成,卷曲,长程相互作用以及耒折叠肽段的全而崩溃。多种技术用于研究次过程,如快速核磁共振,快速光谱技术(荧光,远紫外和近紫外圆二色)。一、新生肽段折叠研究屮的新观点长期以来关于蛋白质折叠,形成了口组装(self-assembly)的主导学说,因此,在研究新生肽段的折叠

5、时,就很口然的把在体外蛋白质折叠研究中得到的规律推广到体内,用变性蛋白的复性作为新生肽段折叠的模型,并认为细胞中新合成的多肽链,不需要别的分了的帮助,不需耍额外能量的补充,就应该能够白发的折叠而形成它的功能状态。1988年,邹承鲁明确指出,新生肽段的折叠在合成早期业已开始,而不是合成完示才开始进行,随着肽段的延仲同时折叠,乂不断进行构象的调整,先形成的结构会作用于后合成的肽段的折叠,而后合成的结构又会影响前面已形成的结构的调整。因此,在肽段延伸过程中形成的结构往往不一定是最终功能蛋白中的结构。这样,三维结构的形成是一个同时进行着的,协调的动态过程。九十年代一类

6、具有新的主物功能的蛋白,分子伴侣(Molecularchaperone)的发现,以及在更广泛意义上说的帮助蛋口质折叠的辅助蛋0(Accessoryprotein)的提出,说明细胞内新生肽段的折叠一般意义上说是需要帮助的,而不是自发进行的。二、蛋白质分子的折叠和分子伴侣的作用蛋白质分子的三维结构,除了共价的肽键和二硫键,还靠大量极其复朵的弱次级键共同作用。因此新生肽段在一边合成一边折叠过程屮有可能暂时形成在最终成熟蛋白中不存在不该有的结构,他们常常是一些疏水表面,它们Z间很可能发生本不应该有的错谋的相互作用而形成的非功能的分子,甚至造成分子的聚集和沉淀。按照口组

7、装学说,每一步折叠都是正确的,充分的,必要的。实际上折叠过程是一个正确途径和错误途径相互竞争的过程,为了提高蛋白质牛物合成的效率的,应该有帮助正确途径的竞争机制,分子伴侣就是这样通过进化应运而生的。它们的功能是识别新生肽段折亞过程中暂时暴露的错谋结构的,与之结合,生成复和物,从而防止这些表面Z间过早的相互作用,阻止不止确的非功能的折叠途径,抑制不可逆聚合物产生,这样必然促进折叠向正确方向进行。(从哲学的观点说,似乎很容易驳斥自组装学说,它违背了矛盾的普遍性原理,试想,如果蛋白质的每一步折叠均是正确的,充分的,必要的,岂不是在无任何才盾的前捉F,完成了复杂的最稳

8、定构象的形成,即完成了山量变到质变的伟

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