分子模拟软件汇总

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1、MolecularModelingSoftware汇总(附每个软件的链接)·3DNA2.0–VsualizationofThree-DimensionalNucleicAcidStructures·ActiveICM1.1.6–PowerPoint&WebBrowsersPlugintoDisplay3DModules·AlloPathFinder1.1–ComputeLikelyAllostericPathwaysinProteins·AlphaMol1.0–ToolsforBiomolecularGeometry·AMBER11–AssistedModelBuildingwithEner

2、gyRefinement·AmberTools1.5–MolecularDynamicsSimulation·ANTHEPROT3D1.0.162-MoleculeViewertolookatPDBfiles·APBS1.3–EvaluatElectrostaticPropertiesofNanoscaleBiomolecularSystem·ArgusLab4.0.1–MolecularModeling,Graphics&DrugDesignProgram·Ascalaph1.7.12–MolecularModellingSuite·AtVol1.2–AtomicVolumeCalcula

3、tion·AUDockerv1–GUIforAutoDockVina·Autobondrot2.0–GenerateMultipleMolecularConformation·AutoDock4.2.3/AutoDockTools1.5.6–SuiteofAutomatedDockingTools·AutoDockVina1.1.2–MolecularDockingandVirtualScreeningProgram·Autodock/VinapluginforPyMOL·AutoGrow2.0.4–UseAutoDockVinainProteinInhibitorDesign·Avogad

4、ro1.0.3–MoleculeEditor&Visualizer·AVP1.3–CalculateProteinVoidVolumesandPackingQuality·AxPyMOL1.0r1–PowerPointPlug-InforEmbedding3DMolecularImages&Animations·B1.0alpha–BiomolecularModelingPackage·BALLView2.0-r1–MolecularModeling&Visualization·Benchware®3DExplorer2.6–3DChemicalVisualization·Bioclipse

5、2.4–LifeSciencesWorkbench·Biodesigner0.75–MolecularModeling&Visualization·BioEditor1.6.1–PresentMacromolecularStructure&StructuralAnnotation·BioViewer1.5.7–ReadonlyversionofBioEditor·Biskit2.3.1–PythonPlatformforStructuralBioinformatics·BndLst1.6–ListCovalent&H-bondedNeighboringAtoms·C2A1.0–Coarset

6、oAtomic·CCOMP3.70–CompareLigand/ReceptorComplexes·CHARMM36–MacromolecularDynamicsandMechanics·ChemCraft1.6–GraphicalProgramforworkingwithQuantumChemistryComputation·Chemis3D2.89b–Java3DMolecularViewerApplet·Chemitorium3.5–MoleculeEditor&3DChemicalStructureViewer·Chime2.6SP8–Display2D/3DMoleculesdir

7、ectlyinWebPages·ClashList1.1–BuildListsofvanderWaalsClashesfromPDBfile·ClashScore1.1–RScriptforVTFPercentilePlot·CLICK–ComparisonofBiomolecular3DStructures·Cluster1.3–BuildCollectionsofInteractingItems·CN3D

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