土壤微生物群落磷脂脂肪酸(plfa)生物标记多样性分析

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1、5土壤微生物群落磷脂脂肪酸(PLFA)生物标记多样性分析基金项目:福建省财政专项-福建省农业科学院科技创新团队建设基金(STIF-Y03)、福建省自然科学基金资助项目(B0410024);福建省烟草专卖局科技计划项目(闽烟科[2006]18号)------????。FoundationItem:TheprojectwassupportedbyspecificprojectofFujianFinancefortheFundofScienceTechnologyInnovationTeamofFujianAcademyofAgriculturalSciences(STIF-Y03);Natura

2、lScienceFoundationofFujian(N0.B0410024);FujianTobaccoCompanySci-technologyproject(MYK[2006]No.18)(福建农业科学院农业生物资源研究所,福建福州350003)摘要:磷脂脂肪酸(PLFA)生物标记法是一种可定性和定量分析土壤中微生物群落多样性的方法。本研究以烟田土壤为例,应用生态学评价方法,即丰富度指数(S)、Pielou均匀度(J)、Simpson优势度指数(D)、Shannon-Wienner(H1)、Brillouin(H2)和Mcintosh(H3)多样性指数等测度方法,分析土壤中微生物群落P

3、LFA生物标记的多样性。研究结果表明,供试土壤微生物群落中,先后出现了43种PLFAs。将其聚类分析,可以将所获得的PLFA分成五大类:第Ⅰ类为高含量、高频次和多样性,PLFA为18:1ω9c的真菌生物标记;第Ⅱ类为高含量、高频次和多样性,PLFA为16:0的假单胞菌标记;第Ⅲ类为高含量、高频次,多样性中等,PLFA为16:1ω5c的甲烷氧化菌生物标记;第Ⅳ类为中等含量,频次较高,多样性中等,含有表征好氧菌的i15:0、a15:0、i16:0和a17:0的PLFA,还有表征厌氧菌的18:1ω7c以及硫酸盐还原菌的16:010Me;第Ⅴ类为低含量,低频次和多样性,其特征生物标记有表征好氧菌的i

4、15:03OH、15:1iG、a16:0、i16:1G、i16:1H、17:0、i17:0、15:02OH、15:03OH、17:0和17:02OH的PLFA,存在有表征真菌的18:3ω6c(6,9,12)、放线菌的17:010Me和18:010Me以及表征原生动物的20:4ω6,9,12,15c。说明供试土壤中能够起主导作用的功能菌依次是真菌、假单胞菌、甲烷氧化菌和部分的好氧菌、厌氧菌及硫酸盐还原菌,将为合理调节土壤微生态系统提供指导。是一种可行的评价土壤微生物群落多样性的新方法。关键词:土壤;微生物群落;磷脂脂肪酸(PLFAs);生物标记;多样性Thediversityofphospho

5、lipidfattyacid(PLFA)biomarkerforthemicrobialcommunityinsoilZHANGQiu-fang,LIUBo**,LINYing-zhi,SHIHuai,YANGShu-shengandZHOUXian-zi(AgriculturalBioresourceInstitute,FujianAcademyofAgriculturalSciences,Fuzhou,Fujian350003,China)Abstract:Asakindofbiomarker,phospholipidfattyacid(PLFA)wasusedtodetectedthe

6、microbialcommunitydiversityinthesoilqualitativelyandquantitatively.ThediversityofPLFAinthetobaccosoilswastested.AndthedataofPLFAwereanalyzed,combiningwiththeevaluationmethodsofecology,suchassuchasShannon-Wienner(H1),Brillouin(H2)andMcintosh(H3)diversityindices,theabundance(S),Pielouevenness(J)andSi

7、mpsonindices(D).Theresultoftheecologicalevaluationshowedthat:thetotal43kindsofPLFAsinthesoilswhichweretestedduringthewholegrowingperiodsoftobacco.AndthebiologicalweightofPLFAsreachedthehighestinsoilsthatcol

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