《基因组学概论》课程教学大纲

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1、《基因组学》课程教学大纲一、课程基本信息课程代码：0235204课程名称：基因组学英文名称：Genomics课程类别：选修课学时：28学　　分：1.5适用对象:生物技术等相关专业考核方式：N+2。笔记10%，考试成绩占40%，平时成绩N占50%。先修课程：生物化学、遗传学、基因工程、分子生物学。二、课程简介基因组学是生物学科的基础课程，主要讲授基因组学的相关生物学基础、基因组学的基本原理与方法、理论与应用，介绍基因组学的发展动态。三、课程性质与教学目的本课程为选修课。要求学生一般掌握基因组学的基本原理与方法、理论与应用，了解

2、基因组学的发展动态。四、教学内容及要求第一章基因组学基础（3学时）（一）教学内容1、细胞组织与结构功能；细胞分裂。2、DNA的分子生物学。3、基因组顺序。4、基因组学的应用前景。5、染色体；染色体的带型；基因组。6、细胞分裂。9（二）基本概念和知识点1、细胞分裂类型及过程。2、人类染色体的带型分析。3、原核生物和真核生物基因组。（三）问题与应用（能力要求）1、细胞的结构与功能。2、原核生物和真核生物基因组的差异。（四）课后练习查阅有关资料，了解细胞的结构与功能。（五）教学方法与手段讲授，课堂讨论。第一章分子标记（3学时）（一

3、）教学内容1、遗传标记的类型与特征；DNA标记的优势。2、RFLP(Restrictionfragmentlengthpolymorphism)，限制性片段长度多态性；RFLP基本操作步骤。3、PCR(polymerasechainreaction)即多聚酶链式反应；DNA复制的原理；PCR技术；影响PCR的因素；引物设计的原则；PCR产物的检测和多态性分析。4、RAPD(RandomamplifiedpolymorphicDNA)随机扩增多态DNA，RAPD与一般PCR的主要差异；RAPD的检测5、AFLP(Amplifi

4、edfragmentlengthpolymorphism)扩增性片段长度多态性；限制性片段的产生；限制性片段扩增；选择性扩增产物的检测。6、SSLP(simplesequencelengthpolymorphism)即简单序列长度多态性；微卫星DNA；微卫星标记的发展。7、几种分子标记特点的比较。（二）基本概念和知识点1、遗传标记的概念及类型与特征。92、PCR技术。3、几种分子标记特点。（三）问题与应用（能力要求）1、DNA标记的优势与应用。2、几种分子标记的应用。（四）课后练习查阅有关资料，了解分子标记的应用发展。（五）

5、教学方法与手段讲授，实验演示，课堂讨论。第一章遗传作图（3学时）（一）教学内容1、传统遗传图；连锁分析；2、图谱构建；作图群体；作图群体的基本要求；各类作图群体的特点。3、分子标记分析；亲本分析；作图群体的分析；4、遗传图谱的构建；连锁作图的基本原理；Mapmaker软件的利用；图谱分析。5、亲本分析；亲本间的亲缘距离与多态性程度的关系；亲本间多态性的分析；作图群体的分析。6、作图群体的分子标记分析、数据库的建立。（二）基本概念和知识点1、传统遗传图；连锁分析；各类作图群体的特点。2、连锁作图的基本原理。3、亲本间的亲缘距离

6、与多态性程度的关系。4、数据库的建立。（三）问题与应用（能力要求）1、Mapmaker软件的利用；图谱分析。2、亲本间多态性的分析。3、作图群体的分子标记分析。9（四）课后练习查阅有关资料，了解遗传作图的应用发展。（五）教学方法与手段讲授，Mapmaker软件的实验演示，课堂讨论。第一章基因定位（3学时）（一）教学内容1、基因的鉴定；基因的概念；主效基因和微效基因、遗传分析、等位性测定。2、主基因定位；基因定位的原理；表型分析；分子标记的分析；遗传作图。3、QTL定位单标记方差分析法QTL定位的新策略QTL分析的发展方向：把

7、复杂性状变为简单性状；把多基因分解为单基因（单一孟德尔因子）；把数量性状变成质量性状。4、分子标记辅助选择分子标记辅助选择(Marker-assistedselection，MAS)概念、基本的原理和条件；标记与基因的关系、MAS在育种上利用；以PCR为基础的MAS基因定位与MAS一体化；基因聚合；单性状多个基因的聚合、多个性状基因的聚合。（二）基本概念和知识点1、基因的概念主效基因和微效基因、遗传分析、等位性测定。2、QTL定位；单标记方差分析法；分子标记辅助选择；基因聚合。3、分子标记辅助选择基本的原理。4、基因定位的原

8、理。（三）问题与应用（能力要求）1、QTL定位的新策略QTL分析的发展方向。2、基因定位的分子标记分析与遗传作图。（四）课后练习查阅有关资料，了解基因定位的应用发展。（五）教学方法与手段讲授，课堂讨论。第五章物理作图（3学时）（一）教学内容91、物理作图与遗传作图的主要差异。2、大片段DN