PBS用户使用指南

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1、PBS是公开源代码的作业管理系统，在此环境下运行，用户不需要指定程序在哪些节点上运行，程序所需的硬件资源由PBS管理和分配。1、PBS命令PBS提供用于作业管理的命令。(1)qsub命令—用于提交作业脚本命令格式：qsub[-adate_time][-cinterval][-Cdirective_prefix][-epath][-I][-jjoin][-kkeep][-lresource_list][-mmail_options][-Muser_list][-Nname][-opath][-ppriority][-qdestination][-rc][-Spath_list][-

2、uuser_list][-vvariable_list][-V][-Wadditional_attributes][-z][script]参数说明：因为所采用的选项一般放在pbs脚本中提交，所以具体见PBS脚本选项。例：#qsubaaa.pbs提交某作业，系统将产生一个作业号(2)qstat命令—用于查询作业状态信息命令格式：qatat[-f][-a][-i][-n][-s][-R][-Q][-q][-B][-u]参数说明：-fjobid列出指定作业的信息-a列出系统所有作业-i列出不在运行的作业-n列出分配给此作业的结点-s列出队列管理员与scheduler所提供的建议-R列出

3、磁盘预留信息-Q操作符是destinationid，指明请求的是队列状态-q列出队列状态，并以alternative形式显示-auuserid列出指定用户的所有作业-B列出PBSServer信息-r列出所有正在运行的作业-Qfqueue列出指定队列的信息-u若操作符为作业号，则列出其状态。若操作符为destinationid，则列出运行在其上的属于user_list中用户的作业状态。例：#qstat-f211查询作业号为211的作业的具体信息。(3)qdel命令—用于删除已提交的作业命令格式：qdel[-W间隔时间]作业号5命令行参数：例：#qdel-W1521115秒后删除作业

4、号为211的作业(4)qmgr命令—用于队列管理qmgr-c"createqueuebatchqueue_type=execution"qmgr-c"setqueuebatchstarted=true"qmgr-c"setqueuebatchenabled=true"qmgr-c"setqueuebatchresources_default.nodes=1"qmgr-c"setqueuebatchresources_default.walltime=3600"qmgr-c"setserverdefault_queue=batch"2、PBS脚本文件PBS脚本文件由脚本选项和运行脚

5、本两部分组成。(1)PBS作业脚本选项（若无-C选项，则每项前面加‘#PBS’）-adate_time：date_time格式为：[[[[CC]YY]MM]DD]hhmm[.SS]表示经过date_time时间后作业才可以运行。-cinterval：定义作业的检查点间隔，如果机器不支持检查点，则忽略此选项。-Cdirective_prefix：在脚本文件中以directive_prefix开头的行解释为qsub的命令选项。（若无此选项，则默认为’#PBS’）-epath：将标准错误信息重定向到path-I：以交互方式运行-jjoin：将标准输出信息与标准错误信息合并到一个文件jo

6、in中去。-kkeep：定义在执行结点上保留标准输出和标准错误信息中的哪个文件。keep为o表示保留前者，e表示后者，oe或eo表示二者都保留，n表示皆不保留。若忽略此选项，二者都不保留。-lresource_list：定义资源列表。以下为几个常用的资源种类。cput=N：请求N秒的CPU时间;N也可以是hh:mm:ss的形式。mem=N[K

7、M

8、G][B

9、W]：请求N{kilo

10、mega

11、giga}{bytes

12、words}大小的内存。nodes=N:ppn=M：请求N个结点，每个结点M个处理器。-mmail_options：mail_option为a：作业abort时给用户发

13、信；为b：作业开始运行发信；为e：作业结束运行时发信。若无此选项，默认为a。-Muser_list：定义有关此作业的mail发给哪些用户。-Nname：作业名，限15个字符，首字符为字母，无空格。-opath：重定向标准输出到path。-ppriority：任务优先级，整数，[-1024，1023]，若无定义则为0.-qdestination：destination有三种形式：queue,@server,queue@server。-ry

14、n：指明作业是否可运行，y为可运行，n为不