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时间:2019-08-04
《7000操作手册》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、7000SDS基本操作简介关于这一章:这一章提供了7000SDS软件的基本操作过程,可以帮助你熟悉ABIPRISM®7000序列检测系统(SequenceDetectionSystem)软件。本章包括以下内容:操作流程图…………………………………………………………2关于样品板文档……………………………………………………3建立样品板文档……………………………………………………3设置样品板文档……………………………………………………5打开已有的样品板文档……………………………………………15关于检测器的其它方面……………………………………………15查看运
2、行结果………………………………………………………16从解链页面查看数据………………………………………………23报告页面……………………………………………………………276操作流程图打开笔记本电脑打开7000仪器运行7000SDS软件用DetectorManager建立detectors打开一个模板或者用WellInspector设置样品板设置热循环仪把样品板文档保存为模板把样品板文档保存为SDS文件或者运行样品板设置基线和阈值查看扩增图重新分析查看标准曲线如果之前设置了解链程序,查看解链页面若出现故障,查看光谱导出或打印结果检查各组分6关于样品板文档
3、样品板文档是一个包含样品类型、所用引物/探针以及样品在96孔反应板上的位置等有关信息的电子文档。在运行PCR反应前,必须先建立样品板文档。你可以用以下三种方式打开一个样品板文档:l建立一个新的样品板文档l打开一个样品板文档模板l打开一个已有的样品板文档在本章中,你将了解到:l样品板文档的作用l如何设置一个样品板文档l运行的结果l如何分析结果建立样品板文档建立一个新的样品板文档:⑴双击电脑桌面上的7000图标。⑵从文件菜单选择新建,打开一个新文件。⑶在新文件窗口中,在测定、容器和模板菜单中做相应选择,然后点击OK。设置样品板文档l建立检测器l通过检测器
4、管理程序将detectors添加到样品板文档。l通过反应管检查程序将detectors添加到反应管。l选择样品类型。l修改样品类型。l设置标准品(如需要)。设置染料管理程序:染料管理程序包含一系列与扩增体系相关的染料,能够管理染料的添加和删除。6注意:染料管理程序中添加的新染料,在应用于文件前,都必须经过校准和分析。校准纯染料的相关信息,参阅单波谱测定。应用检测器管理程序:检测器是样品板设置中与样本相关的标记。在DetectorManager里,可以应用已校准过的染料创建detectors,并将其添加到样品板文档中。应用反应管检查程序:当反应管检查程
5、序设置完后,接着就设置样品板文档。保存样品板文档为模板:样品板文档设置完成后,能保存为模板,在今后运行仪器时可以直接调用。运行前保存为样品板文件:样品板文档设置好了,在运行前,必须存为.sds文件。运行阶段:在7000序列检测系统上运行一个完整的实验需要经过三个阶段(Stages):设置、运行和分析。具体详述如下:阶段名称详述1设置(Setup)确定实验设置和热循环条件2运行(Run)运行7000序列检测系统,并随着PCR反应的进行,实时收集荧光信号的改变3分析(Analysis)查看PCR扩增图、查看标准曲线、计算起始模板量、打印和导出数据运行样品
6、板文档:样品板文档设置好后,可以准备检查热循环仪设置及运行PCR了。⑴在样品板文档中切换到仪器(Instrument)页面。在此能够增加保温、循环或步骤,也能根据当次实验运行所需要的条件编辑时间和温度。⑵进入热循环参数页面,填入循环数、温度和时间。⑶热循环参数(ThermalProfile)页面旁边是自动递增(AutoIncrement)6页面,使用自动递增功能可以逐次增加或减少连续PCR循环的温度和持续时间。注意:始终先设定热循环参数页面,然后根据需要使用自动递增页面。打开已有的样品板文档如果已经建立了一个样品板文档,可以再次打开查看数据。⑴点击文
7、件(File)菜单中的打开(Open),查看现有的文件。⑵在目录下找到所要打开的文件,双击打开。查看运行结果结果页面:实验运行结束后,结果页面会有7个子页面显示结果信息。它们分别是:l样品板(Plate)页面l光谱(Spectra)页面l组分(Component)页面l扩增图(AmplificationPlot)页面l标准曲线(StandardCurve)页面l解链(Dissociation)页面l报告(Report)页面扩增曲线页面:当实验正在运行时,切换到扩增图子页面,扩增图随着数据的收集而不断的更新,因此,一般查阅结果应该先查看此页面。绿色阈值
8、线表示运行已被分析过,而红色阈值线则表示待分析。分析前,必须设置好基线和阈值线。当设置好阈值线,使其处于扩增
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