真核基因表达与调控1

真核基因表达与调控1

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时间:2019-07-14

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1、第十二章真核基因表达与调控第三节真核基因表达调控背景情况(overview):关键问题:细胞分化和个体发育中基因组选择性表达的时空性;分子事件?机制?如何协调?环境因子的作用?……基因组的全能性细胞的多潜能性(totipotency)(pluripotency)真核细胞基因组全能性的实验证据真核细胞基因组的复杂性:e.g.,humangenome:约30亿bpDNA;包含约3万个基因;95%的非编码DNA序列(功能?);一生合成总蛋白质的种类约10万种,但在一个典型的分化细胞中合成约5000种蛋白质;如何调控?人类基因组计划(HGP)功能基因组学:

2、基因及其产物(蛋白质)的功能。不同组织器官中表达不同的蛋白质组(2D-gel)从DNA到蛋白质的可能的调控步骤真核基因表达的多级控制主要调控水平:*-转录水平调控(transcriptionalcontrol)*-转录后水平调控(post-transcriptionalcontrol)RNA加工水平调控(RNAprocessingcontrol)翻译水平调控(translationalcontrol)-蛋白质的翻译后修饰(post-translationalmodification)一、转录水平的调控基本概念:事件:DNA/protein,prot

3、ein/protein相互作用;顺式作用元件(cis-actingelement):与转录调控蛋白特异结合的DNA序列;反式作用因子(trans-actingfactor):与特定DNA序列结合的调控蛋白因子;“模体”结构(motif):蛋白质中的小结构域,用以识别特定的DNA序列或其他蛋白质;e.g.,helix-turn-helix,zinc-finger,ß-sheet,leucin-zip,etc.共有序列(consensussequence):DNA中一小段保守序列(有时也指蛋白质中的氨基酸序列),能够被特定的蛋白结构域所识别,在转录起始

4、调控中起重要作用;e.g.,TATA-box,CAAT-box,GC-box,etc.通用转录因子(generaltranscriptionfactor):与核心启动子元件相结合(如TATA-box),启动转录;特异转录因子(specifictranscriptionfactor):与基因的特异调控元件相结合,起调节作用(促进或阻抑);(一)、转录的激活(transcriptionalactivation)1,转录的起始涉及一系列的DNA/protein,protein/protein相互作用;转录起始复合体(pre-initiationcompl

5、ex)的形成,etc.RNApolymeraseII(sidecutway)AaronKlug,2001,Science,292:1844-46真核基因的结构转录的起始2,激活因子(activator)和辅激活因子(co-activator)特异性的转录因子,能在DNA序列上形成复合体,激活转录;e.g.,肾上腺(糖)皮质激素的作用:glucocorticoid/GRE辅激活因子在特定的DNA元件上形成复合体,激活转录转录因子(通用转录因子和特异转录因子)的功能结构域:-DNA结合结构域(DNA-bindingdomain):与基因的调控区域的特定

6、DNA序列识别并结合-激活结构域(activationdomain):招募其他激活因子和蛋白质,共同启动或激活转录真核基因转录的调控(genecontrolregions)3,基因远端的调控元件—增强子(enhancer)特点:距离基因的起始点较远位置不定:上游、下游、内含子内部方向性:正反方向均有作用作用机制:间隔DNA可以形成环状通过与enhancer结合的特异因子起作用染色质构型的改变(重塑)基因远端的增强子促进转录复合体的装配(二)、转录的阻抑(transcriptionalrepression)1,顺式作用元件/反式作用因子阻抑物(rep

7、ressor):负调控的特异性转录因子沉默子(silencer):负调控的DNA元件作用机制:阻抑转录起始复合体的组装(与通用转录因子作用)与转录激活因子竞争结合DNA与转录激活因子相互作用,影响其活性改变染色质构型(招募重塑复合体、组蛋白修饰酶)阻抑因子(repressor)抑制基因转录的可能机制2,DNA甲基化(DNAmethylation)CG岛(CGisland):基因组DNA中富含CG碱基的区域,其中一些对称序列中的5’-CG-3’二核苷酸的胞嘧啶(C)常被甲基化修饰;与基因的失活有关。DNA甲基转移酶(DNAmethyltransfer

8、ase,DNMT)–维持性DNMT(maintenanceDNMT):使DNA甲基化的模式(pattern)在细胞分裂中得

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