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《一株渤海丝状海洋真菌的分子生物学复核鉴定》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、第29卷第1期天津师范大学学报(自然科学版)Vol.29No.12009年1月JournalofTianjinNormalUniversity(NaturalScienceEdition)Jan.2009文章编号:1671-1114(2009)01-0059-04一株渤海丝状海洋真菌的分子生物学复核鉴定张丽琳,冯欣,孟庆恒,孙建华(天津师范大学化学与生命科学学院,天津300387)摘要:采用真菌形态观察的标准培养条件,结合18SrDNA-ITS片段克隆测序和序列特征GeneBank比较分析,对本实验室分离保藏的海洋真菌Penicilliumsp.BH06进
2、行了培养特征和显微形态的复核鉴定研究,依据分子生物学和形态结构特征,认定该菌株应修订为桔青霉(Penicilliumcitrinum).研究结果提示,基于传统形态学观察并结合ITS序列分析,可为丝状真菌的分类鉴定提供可靠的分子生物学依据.关键词:渤海;丝状海洋真菌;复核鉴定;18SrDNA中图分类号:Q939.5文献标识码:AMorphologicalandmolecularidentificationofamarinefilamentousfungusfromBoha-iSeaZHANGLilin,FENGXin,MENGQingheng,SUNJian
3、hua(CollegeofChemistryandLifeScience,TianjinNormalUniversity,Tianjin300387,China)Abstract:ThefilamentousfungalstrainofPenicilliumsp.BH06,whichwasobtainedfromBoha-iSea,wasrecheckedviaitsmorphologicalpropertiesbindingafurtherassayof18SrDNAInternalTranscribedSpacer(ITS)regionunderthe
4、stand-ardculturecondition.Thesequenceofthe18SrDNA-ITSregionwasrevealedthroughBlastfromGeneBankafteritwasclonedandsequenced.TheresultssuggestedthatthestrainofPenicilliumsp.BH06shouldberedefinedastoPenicilliumcitrinum.Moreover,assayingoffungal18SrDNA-ITSsequencecouldbeasignificantsu
5、pplementarymethodintegratedwithitsmorphologicalidentificationtotheclassificationoffilamentousfungi.Keywords:Boha-iSea;marinefilamentousfungi;recheckidentification;18SrDNA海洋真菌生活在高盐、高压、低氧、低温等特殊态和资源开发的特殊意义.生境中,相对于陆生微生物而言,特殊的生活环境造传统的真菌分类鉴定以形态特征和生理生化指就了海洋微生物在物种、基因组成和生态功能上的标为基础,在有性阶段缺如时
6、,该方法则受到一定的多样性.近年来,海洋真菌代谢产物的研究和开发局限.随着分子生物学的发展,分子生物学技术在应用已取得较大进展,主要集中在新型活性物质提真菌分类领域的作用已得到广泛认可.以ITS序列[1-9]取和药物研发领域.尽管如此,考虑到大量微生作为分子标记的生物学技术现已广泛应用于真菌的物的/不可培养性0以及海洋生境的特殊性,开发海分类鉴定.ITS作为分子分类指标具有以下优点:[10-13]洋真菌种质资源仍然任重道远.到2000年,被快速的协同进化适合种及种以下水平的分类研究;描述过的海洋真菌仅有444种,不足陆生真菌(约其变异以点突变为主,突变位点
7、相互独立;通过上、[6]5万种)的1%.此外,不同的海域生境也分布着下游rDNA保守序列的通用引物,可以对广泛的种不同的生物种群,渤海水域由于其特殊的地理位置类进行PCR扩增和测序,并作为分类的通用标记;和生境,其真菌类群及分布的调查显得更具海洋生基于ITS序列具有片段较小、多拷贝、需样量少等优收稿日期:2008-10-10基金项目:国家自然科学基金项目(30270877);天津市科委科技攻关重点项目(05YFGZGX04400);天津师范大学青年基金(52LJ69)第一作者:张丽琳(1982)),女,硕士研究生.通讯作者:孟庆恒(1961)),男,副教授
8、,主要从事应用微生物学研究.E-mail:hsxymqh@mail
