《张荣娟差异基因》PPT课件

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1、cDNA-AFLP-------差异基因（所有挑选的差异均为间作处理中特异存在）代号基因推断功能同源性RJ2Conservedprotein(氧化还原酶位于同一个操纵元中，还没有关于此基因的研究)98%RJ4secAProbablepreproteintranslocaseSecAsubunitfunctionsinproteinexport;74%RJ6CgtA和ProB1PutativeGTP-bindingprotein和Probableglutamate5-kinase98%RJ7prkAPrkA;Putativ

2、eSerproteinkinase（Signaltransductionmechanisms）76%RJ9gltAtypeIIcitratesynthase:（Citratesynthaseactivitywasessentialfornodulemaintenance）70%RJ14thiCputativethiaminebiosynthesisprotein68%RJ5fixRJ12Transcriptionalregulator,LysRfamily与1021相似性低但与其他物种比对也是这个蛋白总结----6个差异

3、基因Q-PCR验证部分差异基因RJ4secARJ6CgtARJ6bProB1RJ7prkARJ9gltARJ14thiC总结abaabcbacbabaaaabbbbbacccJY9（gltA）文献报道：根瘤菌突变体中：不能结瘤或形成无效瘤，类菌体减少，胞外多糖比野生型多三倍，推测破坏了侵染线，缺乏能量，对结瘤固氮必须；大肠杆菌中：突变体生长速度减慢。abcJY14---thiC文献报道：Putativethiaminebiosynthesisprotein；突变体会推迟结瘤；Thiamineisaroleduringth

4、etransitionfromaerobictofermentative-likemetabolismbaJY4（secA）文献报道：细菌特有的一种蛋白质，具有ATP酶活性，是Sec蛋白质转运途径中的“动力泵”，通过ATP的水解循环驱使多肽穿过通道。cbaJY7（prkA）文献报道：丝氨酸蛋白激酶；仅在芽孢杆菌中有报到；是一种cAMP依赖的蛋白激酶作用。cbaJY6B和JY6（下调）DisruptionofthecgtAgenewaslethal,demonstratingthatthisgeneisessentialf

5、orcellgrowth.secAE.coliandBacillus功能已经明确，hydrolyzesATPandanessentialcomponentoftheproteintranslocationATPase；SecAProtein的ATP-bindingsite已经确定；SecA识别并结合preprotein-SecBcomplex,结合到inner-membraneanionicphospholipids,插入themembranebilayer以后，再与thepreproteintranslocator,S

6、ecY/SecE结合，从而将蛋白运输过膜.putativetransportproteintransmembranehypotheticalproteincbaSecBthiC文献分布：Sinorhizobiummeliloti(2)R.etli(2)E.coliandelse(15)Sinorhizobium突变体库中有关于这个突变体的信息；Rhizobiumetli：在其中表达thiCOGE，将增加其固氮效率；Thiaminbiosynthesisinprokaryotes：其中涉及12个基因（thiFSGH,I,a

7、nddxs，thiC，thiE，thiD,thiM,thiL,andpdxK）突变体库查询内容prkA(1)hypotheticalproteinSMc01266Bacillussubtilis：prkAgeneencodinganovelserineproteinkinasecbaSMc00367（假定蛋白）Protein:putativeoxidoreductaseproteinputativeoxidoreductaseproteinRJ2360bpSMc00367Conservedprotein(氧化还原酶位于同

8、一个操纵元中,同源性98%,还没有关于此基因的研究)98%JY6B和JY6（下调）/obgEobgE/proB150SribosomalproteinL21hypotheticalproteingamma-glutamylkinasegamma-glutamylphosphatereductasenicotinica