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《计算机在化工中的应用-上机实验五-Gaussian》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、计算机化学-Gaussian实验练习1利用Gaussian03进行甲醛单点能，并查看分子轨道。输入文件为：%chk=HCHO.chk#RHF/6-31G(d)Pop=FullTestFormaldehydeSinglePoint0,1C0.00.00.0O0.01.220.0H0.94-0.540.0H-0.94-0.540.0采用GaussView打开Scratch目录中的HCHO.chk文件，打开菜单的“Results”—— “Surfaces”，逐个查看各轨道的形状。比较：不同的输入(优化结构)#B3LYP/6-31GOPTForm
2、aldehyde01C1O21AH31B2CH41B2C3DA=1.28B=1.10C=121.0D=180.0比较：不同的输入(振动分析)#B3LYP/6-31GFreqExample:aldehyde01C1O21AH31B2CH41B2C3DA=1.28B=1.10C=121.0D=180.0比较：甲醛的激发态优化在Gaussian中可以进行激发态的优化和频率分析。步骤是，首先进行能量计算得到激发态，然后在此结构基础上进行结构优化和频率分析。%Chk=c2ho_es#TRCIS/6-31+G(D)TestFormaldehyde(C
3、2V)VerticalExcitedStates0,1CO,1,ABH,1,AH,2,HABH,1,AH,2,HAB,3,180.AB=1.18429AH=1.09169HAB=122.13658--Link1--%Chk=c2ho_es%NoSave#RCIS(Root=1,Read)/6-31+G(D)Guess=ReadOptFreqTestGeom=AllCheck第一个步骤计算最低的三个激发态，第二步骤是利用其结果进行结构优化和频率分析.在本例的计算中，得到的激发态出现了虚频，其结构显示碳原子要离开原子平面。由于原来的分子结构中
4、，所有原子都在同一平面上，所以，也得到一个共平面的激发态结构。这样，就要设法产生一个正确的几何结构。(激发态的结构优化目前没有包含内坐标冗余，所以在初始结构中定义一个平面结构，得到的激发态结构就也是共平面的)。比较：甲醛激发态优化，确定甲醛第一激发态的结构，比较红外光谱。#TRCIS(Root=1)/6-31+G(D)OptFreqDensity=CurrentTestFormaldehyden-->pi*CsOptimization0,1CO,1,R2X,1,1.,2,A3H,1,R4,3,A4,2,90.H,1,R4,3,A4,2,-
5、90.R2=1.25546079R4=1.08213788A3=145.A4=60.这里使用了虚原子，使得对于分子的描述更加简单，这个分子也不再是共平面的结构。计算采用校正因子0.8929，结果如下：计算值校正值实验值平面外弯曲495442683CH2摇摆978873898CH2剪式142612731290CO伸缩164714711173对称CH伸缩320028572847反对称CH伸缩329529422968基本与实验值相符练习2利用Gaussian03进行水分子结构优化与红外分析输入文件为：%chk=H2O#PB3LYP/6-311G
6、OPTFREQGeometryoptimizationandthefrequencycalculationofH2O0,1OH11.0H11.02105.4练习3利用GaussView画出苯环分子，并计算单点能。练习41,2-二氯-1,2-二氟乙烷分子几何构型输入法及气态能量计算实验目的：掌握分子几何构型的输入方法。掌握能量计算的方法及对其结果z进行分析。基本原理： 单点能计算是指对给定几何构型的分子的能量以及性质进行计算,由于分子的几何构型是固定不变的,只是"一个点",所以叫单点能计算。单点能的计算可以在不同理论等级,采用不同基
7、组进行。使用单点能计算除了得到该点的能量，还可以得到分子轨道和轨道能级、电荷分布、偶极矩和多极矩、核磁等信息。操作步骤：1,2-二氯-1,2-二氟乙烷可能有以下三种构型：方法1．可在Gaussview中构建分子的初始构型并进行相关计算。1）在计算机上找到Gaussview的图标，双击该图标调出Gaussview程序。2）在示有元素周期表的位置处单击，找到你所需要的元素。3）在画面上单击即可调入该元素与氢元素的化合物，而后进行该元素键型的选择及特殊基团的选择，重新构建分子直至构建为所需要的分子。4）按住鼠标左键拖动鼠标可以使分子转动，以便看
8、到后面的被其它原子遮挡住的原子。5）该程序还可以查看分子键长、键角、二面角等参数。6）在Gaussview的calculate选项中选择需要计算的关键词即可进行计算。方法2.（在以后的实验中这
