鸡AMPD1基因和A-FABP基因PCR-SSCP分析及其相关性状的研究

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1、西北农林科技大学硕士学位论文鸡AMPD1基因和A-FABP基因PCR-SSCP分析及其相关性状的研究姓名：罗桂芬申请学位级别：硕士专业：动物遗传育种与繁殖指导教师：孙世铎;杨公社20040501摘要目前家禽育种工作已经取得了很大进展，然而这种高强度选择又带来了许多负面影响。其中控制脂肪在鸡体内的过多蓄积，提高肉鸡的的胭体质量和适口性是我国养禽业急需解决的问题。用基于分子遗传学的标记辅助选择进行脂肪与风味相关性状选择，将是解决这类问题的主要手段之一。本实验分为两部分，第一部分是将AMPD1基因作为影响鸡肉中风味物质肌营酸含量的候选基因，采用单链构象多态性(PCR-

2、SSCP)技术，以隐性白羽肉鸡、白来航型蛋鸡和两个地方品种(北京油鸡、三黄胡须鸡)为实验材料，对AMPD1基因进行SNPs(单核昔酸多态性)检测和基因类型判别。卡方检验结果表明，除三黄胡须鸡和隐性白羽肉鸡，北京油鸡和白来航鸡间差异不显著(P>0.05)外，突变产生的基因型频率在其它各品种间差异极显著(P<0.01)oAMPDI基因多态性与北京油鸡生产性能和屠体性状(活重、胸肌率、肌昔酸含量等)相关分析结果表明:肌普酸含量在三种基因型间差异显著(P<0.05)。初步推断AMPDI可能为影响鸡肉中肌昔酸生成的主效基因或与主效基因相连锁。第二部分是以A-FABP基因作

3、为脂肪代谢和生长的候选基因，设计了两对引物P1,P2，采用SSCP(单链构象多态性)，以隐性白羽肉鸡、白来航鸡和两个地方鸡品种(三黄胡须鸡、北京油鸡)为试验材料，对A-FABP基因进行SNPs检测和基因类型判别。(1)P1位点独立性检验结果(X，检验)表明:除北京油鸡与白来航鸡、隐性白羽鸡间差异极显著(P<0.01)外，其余各品种间差异均不显著(P>0.05)。不同基因型间胸肌率、净膛率差异显著(P<0.05);腹脂率、皮脂厚、脂带宽、肌内脂肪含量、腿肌率差异极显著(P<0.01)。多重比较结果表明，腹脂率、皮脂厚和脂带宽BB型均显著高于AA型和AB型(P<0.

4、05);BB型净膛率显著低于AA型和AB型(P<0.05);BB型肌内脂肪含量显著高于AB型(P<0.05)a(2)P2位点独立性检验结果(梦检验)表明，四个品种间差异显著(P>0.05).总卡方分割比较结果表明，除北京油鸡和白来航鸡间差异显著外(P<0.05)，其他品种间均无显著差异(P>0.05)。基因型与屠体性状方差分析结果表明:腹脂率和腿肌率三种基因型间差异显著(P<0.05)，但其它性状在各基因型间差异不显著(P>0.05)。对腹脂率而言，AA型显著的高于AB型，均值顺序为AA>BB>AB型.对腿肌率而言，AA型均显著的高于BB型，均值顺序为AA>AB

5、)BB.P1与P2位点组合基因型方差分析结果表明，基因型间IMF,腹脂率、活体重、屠宰率差异显著(P<0.05)。由以上结果推测A-FABP〕可能为影响鸡体内脂肪代谢的主效基因或与主效基因相连锁。关键词:FASP基因AMPDI基因PCR-SSCPIMF肌昔酸AbstractPresently,theimprovementinpoultrybreedinghasbeenmade.However,negativeeffectshaveappearedaccompaniedwithhighintensityselection..Problemsneededresolv

6、edbypoultryindustryinChina,existincontrollingexcessivefatnessaccumulationthataffectschicken.carcassquality.Toresovetheseproblems,onemainmethodtoselectfatandflavourtraitsisusingmarker-assistedselection(MAS)basedonmoleculargenetics.Inthisstudy,AMPDIandA-FABPgenewerestudiedascandidatesf

7、orIMP臀neconcentratioinandiattraitsinchicken.AMP-deaminasel(AMPD1)catalyzestheirreversiblehydrolysisofAMPtoIMPandammoniabeingtheintegralenzymeofpurinenucleotidecycle.ThisstudywasdesignedtoinvestigatetheeffectofAAIPD1geneonchichenIMPconcentratioin.Thefourthgenerationpopulationofdiverge

8、ntselectionY