氨基酸的亲_疏水性研究__各种氨基酸及其残基的疏水性标度

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1、《》,,eot,.et.:[56〕李芳生等;永寿大骨节病考察文集195弓338[62]迅mC叭in“即丁亡脚PSti行oPWLoO..,.,..,~,.页,人民卫生出版社尸坛解‘sonset1979(EdLyJMal)441.,.,.·,.[57〕F.YYang(杨福愉)FHg(黄芬)ZH[63]王育启,王洪春等:《》,2;1851981Uan植物生理学报U。,n“,即渡亡‘o用夕051“”;《》2‘,l:,198七(林治焕)I3dl阴ti耐勿〔6书〕鲍风等植物学报60,....,,亡”苦剐。召井e,eseta:‘,tofSel脚洲及耐君yd人肠动公访,Beijin岛[6,]PeoPlT

2、RlPZP]lysiof623261978.1984(inpress)二.,.,,,,.aeta:户s[58」,沃维汉;《中国科学,〔66]ChanDJl尸肠妊P儿夕iof72225杨福愉(待发表)脚.[5夕1沃维汉,心》1983杨福愉;中国科学(待发表)...son,.,:.,,:《》,:,[601R滋JKetdi“刃dP肠刀廿尸子砂510,杨福偷等科学通报‘3701953枷109..,.《》,(EdStumPfPK.里1979.{:;}杨福愉等:植物学报(待发表).,.onset.[61]LyJM欲.:in“LowTe附P害tr阶i月c.Op4刀打,,(Eds,Lyons,M.eta

3、l.),1979,i,【全文完1P1J氨基酸的亲、疏水性研究各种氮基酸及其残基的硫水性标度温元凯程门燕(中国科学技术大学量子生物学实验室)蛋白质由20种氨基酸组成.它们的亲、疏电荷的重心不相重叠,则称分子具有极性.对,0)、、水性的相互作用是维持蛋白质三级结构最重要于蛋白质大分子chothial定义N0s为极山.,、、的作用力之一有些变性的蛋白质(即随机松性原子侧链带有NOs的氨基酸残基为极,成,侧c散分布的多肤链)能够自动地重新折叠起来性残基链上只有原子的残基为非极性残、,.高度有序的天然构象,为具有生物活性就是疏基一般认为非极性残基埋在蛋白质分子内.因此,研究,水基起着关键作用各种氨

4、基酸侧部形成一个疏水核它被和溶剂接触的外层极链亲水性或疏水性的大小及其相互作用(该方性残基包着.但是,全部残基的疏水性与从原面,.的工作是七十年代才开展起来的)对于深人子观点定义的极性毕竟不是一回事有人通过、,,了解蛋白质核酸等生物大分子的结构与功能实验研究氨基酸从水中转人有机试剂中自由..能的变化来定义疏水性场”Lee等人15,一13]使用具有重要意义,,不同方法分别测定了蛋白质的X射线结构经、一疏水性的定义验地定义了氨基酸的疏水性,现将这些工作分.一般来说,基团的疏水性与其极性呈正比.别介绍如后.,水是强非极性大意味疏水性强这是因为极、,二各种盆墓酸硫水性的标度与讨论性的而非极性的有

5、机分子中没有任何分离的,因此二者之间没有有效的吸引,而水1.从甚团质心平均减少的距离(,闭Tbe净电荷>(,reuetcer:ecLre分子之间的吸引却是可观的故能把非极性液~哪d司disanf‘hen砧m二)“”,‘切.体的分子挤出去使之几乎完全不溶于水,一定义。李R,我们就认为该液体疏水性很强,但是蛋白质各种残基的疏水性与极性还R:从蛋白质质心到分子中某一残基的距是有区别蒯sl.极性是从原子观点定义的一种性离..,,质笼统地说若分子中电荷分布不每匀正数R,:蛋白质旋转半径的均方根.‘!,把分成0.。,一个区间的不连续区域得衷t权谷.舀团质心减小的距离,到从基团质心平均减少的距离<)的

6、计算公用于计算每一:rs式氨基酸氨基酸<>.·的侧链原子(r>一,,[005伏一‘)+o025]艺..‘...夕093土002094士002介AI:AsCyGIPhlGI,leHia巧UePy拓以口1.01土0.021.08斗0.03.、‘、‘、Zr‘/,.几了、尸‘了白,、..一艺0.88十0.03084土004..dNel助1.02土0.02112士0D3p*(·*一‘·>)2’‘’N‘0.78士0.030.73士0.03△r,N丢一(){不}/1.00士Q.020.吕9士0.0月0.92士0.05_廿南r,_N走..,.079+002076士002月,I。JClCa创

7、伪以郎印CalCsl郎少七气凌—N,l—NLvseuMetAsn1.05+0.021.23士0.02ArsProGln..0.85土0.02082士003N蛋白质样品中某一残基的总数;..08斗士0030.83土0.04N*某一残基在区间及内的数目;....098士002104土002.伙第互个区间内减小的半径值1.00士0.021.04土0.03....蛋,.102土003111立003白质样品19个(选择条件详见文献)0.98土

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