计算机在化学中的应用-chemdraw专讲

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1、计算机在化学中的应用——ChemDraw专讲化学分子结构式的绘图绘制2D分子结构的软件:ChemWindow,CSChemDraw,ISISDraw和ChemSketch等绘制3D分子结构的软件:CSChem3D,HyperChem,WebLabViewerPro,ArgusLab和RasMol等。(CSChem3D和HyperChem还集成了分子力学、分子动力学、半经验以及从头算量子化学计算的部分)Chemoffice2006ChemDrawUltra10.0Chem3DUltra10.0ChemFinderUltra10.0主要内容ChemDraw简介示例练习化

2、学结构的绘制文本说明及原子标记轨道、符号、箭头、弧等高级绘图技巧ChemDraw在线信息ChemDraw简介点位:移动鼠标直到鼠标的光标放到所要进行操作的位置,如果选择的位置在图形结构中的键、原子、线等的上面,一般出现黑方块,称之为光标块,选择块或操作块。光标块常用术语选择:用鼠标的光标选中某种选择,使对象产生光标。选择对象并不意味着动作,只是标记要操作的对象和点位;单击:快速按下鼠标键(左或右键),然后快速抬起;双击:快速操作两次单击;拖动:由三部分动作组成——按下鼠标左键选择对象,移动鼠标,将被选的对象移动到指定位置后抬起鼠标;ChemDraw简介“键+单击”:

3、按下特殊的键和单击鼠标键同时进行。如,“Shift+单击”意思是按下”Shift”键和单击鼠标键;“键+拖动”:按下特殊的键和鼠标键,移动鼠标。如,“Shift+拖动”意思是按下”Shift”键和拖动鼠标光标。ChemDraw简介图形工具板状态/信息栏编辑区滚动栏菜单栏工具栏ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw

4、简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介ChemDraw简介快捷键命令灰色表示命令未激活小三角表示子菜单省略号表示新对话框文件格式介绍1CDTemplate(*.ctp,*.ctr)——用于保存模板文档2ChemDraw(*.cdx)——ChemDraw原本格式,是一个公共标记的文件格式,易被其它程序建立和解释3ChemDrawSteylSheet(*.cds)——用于存储文件设置和其它物体4ConnectionTable(

5、*.ct)——一种实例格式,存储关于原子与元素、系列编号、X和Y轴、键序、键类型等的连接和联系的列表。是用于多类应用程序间互换信息的通用格式文件格式介绍5DARC-F1(*.fld)——QuestelDARC系统中存储结构的原本文件格式7ISISReaction(*.rxn)——MDL开发的格式,用于存储元素反应信息8ISISSketch(*.skc)——在Windows或Macintosh环境下,存储并传输到另外的ISIS应用程序中6DARC-F1Query(*.flq)——QuestelDARC系统中存储查询的原本文件格式文件格式介绍9MDLMolFile(*.

6、mol)——MDL(分子设计有限公司)MolFile文件格式用于其它一些在Windows、Macintosh和Unix环境下的化学数据库和绘画应用软件11JcampSpectra(*.jdx,*.dx)——图谱文件格式,可读入紫外、质谱、红外、核磁等数据文件12MSIChemNote(*.msm)——一种ASCII文本文件,可以用于像ChemNote一类的应用程序10GalacticSpectra(*.spc)——银河图谱文件格式文件格式介绍13SMD4.2(*.smd)——ASCII文本文件,一般用于检索化学文摘数据库14WindowsMetafile(*.wmf

7、)——图片文件格式,可以将ChemDraw图片传输到其它应用程序中,如Word。WMF文件格式含有ChemDraw的结构信息,可被ChemDraw早期版本编辑示例1——反应方程式示例2——绘制中间体结构示例3——复杂环结构示例4—Fischer葡萄糖结构示例5——透视图形示例6——Newman结构示例7——立体化学化学结构的绘制化学结构的绘制文本说明及原子标记原子标记原子标记键编辑化学命名限制多于一桥以上的桥环(如:三环)自由基非标准价态化合物螺环体系含同位素的化合物聚合物生物分子轨道、符号、箭头、弧等轨道工具化学符号箭头工具箭头的使用指示电荷转移指示键角键长绘

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