生物医学信息资源及其检索

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1、医学信息检索PubMed主要内容PubMed概况PubMed数据来源PubMed检索机制PubMed检索运算符PubMed检索方法结果的显示、保存其他辅助功能PubMed概况创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI)1997年6月开始向全球开放特色：具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点，部分文献还可在网上直接免费获得全文。与Medline光盘数据库的区别：检索机制、检索界面、检索方法以及收录文献数量不同。PubMed数据来源MEDLINE：[pubmed-indexedformedline]InProcessCitati

2、ons：每天收录，尚未经规范处理的数据。[pubmed-inprocess]Publisher-SuppliedCitations：由出版商提供的电子文献，每条记录标有[PubMed-assuppliedbyPublisher]。自动转换匹配功能(AutomaticTermMapping)对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换，再进行检索。词表匹配转换顺序是：MeSH表(MeSHTranslationTable)、期刊刊名表(JournalTranslationTable)、短语表(Phraselist)、作者索引(AuthorInd

3、ex)。如果在以上4个表中都找不到相匹配的词，PubMed将把短语分开，以单词为单位，分别重复以上的过程，检索时各个词之间是AND逻辑关系。如果仍找不到相匹配的词，则用单个词在所有字段查找，各个词之间也是AND逻辑关系。PubMed检索机制短语检索(PhraseSearching)也可称为强迫词组检索，即，如果要将短语作为一个词组进行检索，可用双引号“”将其引起来。如：“drugtherapy”作为词组进行检索的词，系统不进行自动转换匹配，也不进行MeSH词的扩检。PubMed检索机制PubMed检索运算符逻辑运算符：逻辑与：AND，逻辑或：OR，逻辑非：NOT

4、。当一个检索表达式中同时含有三个运算符时，运算顺序从左至右，括号可以改变运算顺序。截词符：*，一个词或字拼写出部分字母后面加上一个截词符，chem*表示用词根进行检索。双引号：“”，表示对引号中的短语进行检索。检索字段标识符：[tag]，tag为字段名称。[ti]，[au]，[ta]，[la]，[pt]。常用字段组成标识符字段名称中文释义TITitle题目AUAuthor作者ADAffiliation作者单位ABAbstract文摘DPPublicationDate出版日期TAJournalTitleAbbreviation刊名缩写MHMeSHTerms主题词P

5、TPublicationType出版类型http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/PubMed网址高级检索主题检索期刊检索文献匹配临床咨询特定主题咨询PubMed检索方法基本检索高级检索主题检索辅助检索基本检索默认检索字段为主题、作者、期刊关键词、词(词组)或短语：⑴输入任意关键词：livercancer、Lungcancer；⑵带有双引号””作为短语检索：”cancertherapy”；⑶带有连接号”-”作为一个词组检索：interleukin-6。限制检索字段：如livercancer[ti]作者：SmithJ、Smith[au]

6、2002年以后的文献如果作者有全称，可用全称基本检索期刊刊名：⑴可用期刊全称：GENETHERAPY[TA]；⑵可用期刊简称：JAMA[TA]；(TheJournaloftheAmericanMedicalAssociation)⑶刊名中含有特殊字符，如[]、&等，要去掉：如JHANDSURG[AM]输入时要写成JHANDSURGAM截词：chemo*复杂表达式：livercancerANDtherapy带有摘要文献的检索：livercancerANDhasabstract基本检索分析该检索课题，包含两个方面：肝癌：livercancer；治疗：therapy两

7、个主题之间的逻辑关系是AND，即livercancerANDtherapy基本检索举例1：肝癌的治疗分析该检索课题，包含两个方面：作者为：马大龙（madl）；作者单位为：北京大学（pekinguniversity[ad]）。基本检索举例2：北京大学医学部马大龙教授发表的文献得到了两个检索结果：作者为：马大龙（madl）的检索结果作者单位为：北京大学（pekinguniversity[ad]）的检索结果利用检索史把这两个检索结果用AND组合起来基本检索举例2：北京大学医学部马大龙教授发表的文献高级检索限制检索或条件检索：Limit(1)全文、摘要(2)动物、人类(

8、3)文献类型(4)语种(