水产生物基因组研究进展和趋势

《水产生物基因组研究进展和趋势》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在工程资料-天天文库。

1、水产生物基因组研究进展与趋势郑先虎，匡友谊，吕伟华，栾培贤，孙志鹏，鲁翠云，孙效文（中国水产科学研究院黑龙江水产研究所，淡水鱼类育种国家地方联合工程实验室,农业农村部淡水水产生物技术与遗传育种重点实验室，黑龙江哈尔滨150070）摘要：本文综述了水产生物基因组研究相关技术的发展历程和关键技术的应用。以二代测序技术的出现为分界点，我们首先回顾了早期水产养殖生物在遗传学和分子生物学方面的研究结果，以及为开展全基因组测序所做的相关基础研究，然后重点介绍了二代测序应用于水产生物全基因组测序和经济性状遗传基础解析的研究进展，最后展

2、望了水产生物基因组研究发展趋势。水产生物经济性状遗传机制高度复杂，从全基因组角度阐明其遗传机制仍有很多难题，但基因决定性状是生物学法则之一，探索这一过程的奥秘引人入胜。关键词：水产生物；基因组；下一代测序ProgressandPerspectiveoftheGenomeResearchinAquaticOrganismZHENGXianhu,KUANGYouyi,LVWeihua,LUANPeixian,SUNZhipeng,LUCuiyun,SUNXiaowenNationalandLocalJointEngineer

3、ingLaboratoryforFreshwaterfishBreeding;KeyLaboratoryofFreshwaterAquaticBiotechnologyandBreeding,MinistryofAgricultureandRuralAffairs;HeilongjiangRiverFisheriesResearchInstitute,ChineseAcademyofFisherySciences,Harbin,150070,ChinaAbstract:Inthispaper,thedevelopment

4、andapplicationofrelatedtechnologiesinaquaticgenomeresearcharereviewed.Takingtheappearanceofthenext-generationsequencing(NGS)technologyasademarcationpoint,wefirstlylookedbackontheresearchesofgeneticsandmolecularbiologyofaquaticorganismintheearlystages,andthebasicr

5、esearchesforthewholegenomesequencing.AndthenweemphaticallyintroducedthedevelopmentoftheNGStechnologyapplicationforwholegenomesequencingandeconomictraitsanalysis.Atlast,thedevelopmenttrendofaquaticorganismwholegenomeresearchesisprospected.Thegeneticmechanismofecon

6、omictraitsofaquaticorganismishighlycomplex,thustherearestillalotofdifficultiesinexplainingthegeneticmechanisminthewholegenomelevel.However,itisabasiclawthattraitisdeterminedbygenes,sotheexplorationwillstillbeexcited.Keywords:AquaticOrganisms;Genome;Nextgeneration

7、sequence资助项目：国家自然科学基金（31672655，31602150）Fundingprojects:NationalNaturalScienceFoundationofChina(31672655,31602150)通讯作者：孙效文，E-mail：sunxw2002@163.com水产生物基因组研究的最终目的是获得经济性状的决定基因或标记以用于培育性状优异的新品种，或是利用基因组知识进行疾病防治和营养生理调控，最终提高水产业的经济效益和生态效益。水产生物的基因组研究开展较晚，借助于二代测序技术，目前已有牡蛎（

8、Crassostreagigas）、鲤（Cyprinuscarpio）、草鱼（Ctenopharyngodonidellus）、半滑舌鳎（Cynoglossussemilaevis）、虹鳟（Oncorhynchusmykiss）和大西洋鲑（Salmosalar）等上百个水产生物的全基因组测序完成，为从全基因组层面探索