《不结球白菜品种（系）遗传多样性与亲缘关系的ssr分析》

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1、分子植物育种，2014年，第12卷，第3期，第499—508页MolecularPlantBreeding，2014，Vo1．12，No．3，499—508研究报告ResearchReport不结球白菜品种(系)遗传多样性与亲缘关系的SSR分析刘冬媛1王新华t刘杨1张峻。陈火英1上海交通大学农业与生物学院，上海，200240；2上海市闵行区农业科学研究所，上海，201109通讯作者，c~y@sjtu．edu．ca摘要利用具有多态性的31对SSR引物，对国内外191份不结球白菜的遗传多样性及亲缘关系进行了分析。引物平均多态性信息含量()为0．

2、34；供试不结球白菜品种(系)的平均期望杂合度(He)为0．41，Shannon’S信息指数∽为0．65；遗传分化系数(Gs为0．20，说明80％的遗传多样性来自品种(系)之间的差异。不同生态区域的遗传多样性具有差异：国内高于国外，且江淮流域最高。利用UPGMA法作图，将供试的191份品种(系)聚为六大类，同时Structure种质遗传结构分组结果与UPGMA法聚类结果基本吻合，两种分析方法均说明了类群划分与地理分布有一定相关性。研究结果表明不结球白菜品种(系)具有丰富的遗传多样性，大部分品种(系)的亲缘关系聚类是按照地理来源及种质遗传背景

3、进行，本研究为不结球白菜育种研究提供了参考。关键词不结球白菜，SSR，遗传多样性，亲缘关系AnalysisofGeneticDiversityandRelationshipofPakchoiAccessionsBasedonSSRMarkersLiuDongyuanWangXinhuaLiuYangZhangJunChenHuoying’ISchoolofAgricultureandBiologyShanghaiJiaoTongUniversity，Shanghai，200240；2InstituteofAgriculturalScienc

4、eofMinhangDistrict，Shang·hai，201109Correspondingauthor．c~y@sjtu．edu．cnDOI：10．13271／j．mpb．012．000499AbstractThirtyonepairsofSSRprimerwereusedtoanalyzethegeneticdiversityandrelationshipamong191cultivars(strains)ofPakchoi(BrassicarapaL．ssp．chinensisMakino)，inordertoprovidesom

5、emolecularinform-ationtosupporttheefectivePakchoibreeding．Theaveragevalueofpolymorphisminformationcontent(me)was0．34；Theaveragevalueofexpectedgeneheterogeneity(日e)andShannon’SinformationindexoftestedPakchoiaccessionswere0．41and0．65，respectively．Thecoeficientofgenediferenti

6、ation(Gst)was20％，indicating80％ofthegeneticvariationexistedwithinpopulations．GeneticdiversityoftestedcultivarsandstrainsfromJianghuaiPlainwasthehighestamongdiferentecologicalareas．Inaddition．geneticdiversityofcultivarsfromChinawashigherthanthoseofJapanandSouthKorea．The191ac

7、cessionscouldbeseparatedinto6groupsbyUPGMA(unweightedpairgroupmethodwitharithmeticaverage)analysis．Meanwhile，theresultofgroupinggermplasmgeneticstructurebySTRUCTUREwasbasicallyconsistentwiththatofUPGMAclustering，twomethodsbothshowedthatspeciesdividedhadcertaincorrelationwi

8、thgeographicdistribution．Theresultshowedthatthegeneticdiversityof191testedPakchoicultivar