第六章 细菌的分类与命名

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1、第六章细菌的分类与命名第一节细菌的分类地位在全面了解细菌生物学特征的基础上，研究它们的种类，探索其起源、演化以及与其他类群之间的亲缘关系，进而提出能反映自然发展的分类系统，并将细菌加以分门别类。2012年春季学期《兽医微生物》课件版权所有者：盖新娜1细菌过去归属植物界，自1974年以来，划为原核生物。细菌作为另一个系统进化类别的原核生物，包括对动物和人具有致病作用的衣原体、立克次体、霉形体、螺旋体、放线菌等，此外还涉及蓝细菌、紫色光合细菌等。分类单元细菌属原核生物界，包括衣原体、立克次体、霉形体

2、、螺旋体、放线菌等。分类有纲、目、科、属、种，但最重要、最基本的是种，其次是属。2012年春季学期《兽医微生物》课件版权所有者：盖新娜31.属（genus）：具有共性的若干种的组合，与其他属有明显差异。2.种（species）：微生物学分类的最基本单元。种是一群性质相似的菌株，与其他菌株群体有明显差异。3.菌株（strain）：不同来源的某一种细菌的纯培养物。2012年春季学期《兽医微生物》课件版权所有者：盖新娜4标准菌株或模式菌株(standard/typestrain)具有某种细菌典型特征的菌株

3、，它是该种菌株的参比菌株。在细菌的分类、鉴定和命名时以模式菌株为依据，也可作为质量控制的标准。2012年春季学期《兽医微生物》课件版权所有者：盖新娜5第二节细菌的命名依据“国际细菌命名法规”学名用拉丁文，遵循“双名法”，具备拉丁化文字形式和明确分类等级的两个特点，即有一个属名和一个种名构成。属名在前，首字母大写；种名在后，均用小写；两者均用斜体表示。细菌学名的中文译名则种名在前，属名在后。2012年春季学期《兽医微生物》课件版权所有者：盖新娜6例如Salmonellatyphi(伤寒沙门

4、菌)。属名也可用第一个字母代表，如Styphi等。有时泛指某一属细菌而不特指其中的某个细菌则可在属名之后加上sp，如Salmonellasp，即表示沙门菌属细菌（sp代表菌种species，复数用spp）2012年春季学期《兽医微生物》课件版权所有者：盖新娜7新种，拉丁文学名后加上“sp.nov”。如，Lawsoniaintracellularisgen.nov.,sp.nov.，译为胞内劳森菌，新属新种。亚种，用subsp.或ssp.表示。如Pasteurellamultocidasubsp.

5、septica，多杀性巴氏杆菌败血亚种。2012年春季学期《兽医微生物》课件版权所有者：盖新娜8第三节细菌的分类方法①细菌的生理生化分类法：包括有传统分类法（双歧检索条目分类法）和数值分类法；②种系分类法：细菌核酸的同源程度进行分类。2012年春季学期《兽医微生物》课件版权所有者：盖新娜9一、生理生化分类法细菌的形态、染色以及特殊结构是最早的分类依据，有传统分类和数值分类法两种。2012年春季学期《兽医微生物》课件版权所有者：盖新娜10传统分类法（双歧检索条目分类法）以形态生理特征为依据选择稳定的

6、生物学性状，如形态结构、染色性、培养特性、生化反应、抗原性作为分类依据，然后按主次顺序逐级区分。使用方便，分类亦明确，但有主观性。2012年春季学期《兽医微生物》课件版权所有者：盖新娜11数值分类法各种生物学性状按“等重要原则”进行分类如选择100-200项生理生化指标，比较结果，以相似系数或相似百分数表示：相似系数=相同特征数/（相同特征数+不同特征数）相似系数越大表示相同特征越多，说明两个菌种间有较高的亲缘性商品鉴定试剂及自动化细菌鉴定系统即采用数值分类原理2012年春季学期《兽医微生物》课件

7、版权所有者：盖新娜12二、种系分类法（遗传学分类法)目前分类依据是细菌的种系发生关系，即分析其基因特性，确定分类地位。以细菌的核酸的同源程度分类，优点是：对细菌的“种”有较为一致的概念使分类不会出现根本性的变化可制定可靠的细菌鉴定方案有利于了解进化和亲缘关系2012年春季学期《兽医微生物》课件版权所有者：盖新娜13研究种系发生关系采用三种方法：DNA（G+C）含量测定（mol％）核酸同源值测定（核酸分子杂交）16SrRNA寡核苷酸同源性2012年春季学期《兽医微生物》课件版权所有者：盖

8、新娜14DNA（G+C）含量的测定DNA分子两条链上（G+C）的摩尔百分数是稳定的，能反映出细菌间DNA分子同源程度，习惯上以（G+C）作为细菌分类标记不同菌属间的（G+C）mol％范围很大，在25％～75％之间同一种细菌（G+C）mol％相当稳定，不受菌龄、培养条件和其他外界因素影响亲缘关系越近，细菌的（G+C）mol％越相近2012年春季学期《兽医微生物》课件版权所有者：盖新娜15核酸同源值测定利用DNA分子杂交技术测定DNA分子的相似度。1.提取待鉴定细菌