昆虫转录后的RNA编辑模式的功能研究

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1、分类号UDC密级编号中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所博士后研究工作报告昆虫整丞盾的B盟垒编辑槿式的功能硒究余曜工作完成时间2013年6月报告提交时间2013年6月2摘要IIIIIIIllIlUlIIIILIMIIY2432056RNA编辑是一种重要的转录后调控机制，通过对mRNA上核苷酸的改变来影响蛋白质翻译的产物，从而影响其功能。RNA编辑是生物系统中的重要环节，参与了组织发育过程，与环境适应密切相关。在高等动物中，可能与神经系统的病变有一定的相关性。根据目前的研究，对RNA编辑靶位点的鉴定和进化功能分析始终缺乏高效而准确

2、的方法和理论，且实验验证较为困难，RNA编辑的研究目前也主要集中在高等动物中，昆虫中尚处于起步阶段。了解昆虫RNA编辑机制的进化和功能，对认识生物体调控系统进化规律有重要作用，为研究RNA编辑和表型的关联奠定基础。在博士后阶段的研究中。以高通量测序数据为基础，结合了其他的生物实验数据，对昆虫的RNA编辑机制进行系统化分析。结合基因家族进化分析，初步阐述了RNA编辑在长期进化选择中扮演的角色：从转录调控网络角度探索其在生物学功能。本工作中建立一套通过大规模数据鉴定RNA编辑靶位点，并对其进行注释、进化分析、功能分析的技术方法。AbStrac

3、tRNAeditingisoneoftheimportantmechanismoftranscriptionalregulation，affectingthetranslationoftheproteinproductbychangingnucleotideinthemRNAtoaffectitsfunction．RNAeditingplayskeyroleinthebiologicalsystems，whichisnvolvedintissuedevelopment，andadaptationtotheenvironment．Inhig

4、heranimals，andnervoussystemlesionsmayhavesomerelevancewithRNAeditingAccordingtocurrentresearchonRNAediting，thepredictionoftargetsiteandfunctionalanalysisofevolutionlackofefficientandaccuratemethodsandtheoriesbesidestheexperimentalverificationisverydifficult．Thusthiskindof

5、studyiscurrentlyfocusedonthehigheranimals．ThestudyofinsectsRNAeditingisstillinnfancy．Tounderstandthemechanism，evolutioncharacters，andbiologicalfunctionofRNAeditingininsectsishelpfultotheunderstandingofregulatorysystems．Inthepost-doctoralphaseofmystudy，basedonhigh-throughp

6、utsequencingdatacombinedwithdatafromotherbiologicalexperiments，thesystematicanalysisofRNAeditingmechanismsininsectspeciesisperformed．Combininggenefamilyevolutionanalysis，wepreliminaryelaboratelong-termevolutionofRNAeditinginnatureselectionandexploreitsbiologicalfunctionsf

7、romtheperspectiveoftranscriptionalregulatorynetwork．Thisworkestablishesalarge—scaledatabasedsystemofRNAeditingtargetsiteidentification，annotation，evolutionaryanalysis，andfunctionalanalysis4目录研究背景⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯71．1RNA编辑机制的发现⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．71．2RNA编辑在生命

8、系统中的作用⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．81．3RNA编辑在动物中的研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．91．4RNA编辑靶标的确定⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯10