南方红豆杉4个微卫星位点等位基因变异分析

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1、园艺学报，2016，43(2)：373–383.ActaHorticulturaeSinicadoi：10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0418；http：//www.ahs.ac.cn373南方红豆杉4个微卫星位点等位基因变异分析1,23,*1411谢伟东，文亚峰，韩文军，周宏，徐刚标，陈建华123（中南林业科技大学林学院，长沙410004；广西大学林学院，南宁530004；中南林业科技大学风景园林学院，4长沙410004；广东省韶关市林业局，广东韶关512000）摘要：以南方红豆

2、杉（Taxuschinensisvar.mairei）的4个微卫星位点为例，通过等位基因长度和序列变异分析，对各位点等位基因的变异特点、变异来源和进化关系进行研究。结果表明：这4个位点在南方红豆杉种内表现出丰富而复杂的变异特点，既有SSR重复区突变形成的等位基因，也有因侧翼序列插入/缺失（Indel）形成的等位基因，还存在同一长度形态的同形异源等位基因（allelichomoplasy），同时，在1个mtSSR位点中检测到了线粒体基因的异质性（heteroplasmy）。SSR重复序列和侧翼序列突变的共同作用是

3、引起等位基因长度异常的主要原因。等位基因分布及其进化关系研究表明，4个位点的序列突变更符合逐步突变模型（SMM），常见等位基因在进化上具有原始性。关键词：南方红豆杉；微卫星标记；等位基因；序列变异；基因突变中图分类号：S68文献标志码：A文章编号：0513-353X（2016）02-0373-11VariationAnalysisofFourMicrosatelliteLociWithinMaireYewSpecies1,23,*1411XIEWei-dong，WENYa-feng，HANWen-jun，ZHO

4、UHong，XUGang-biao，andCHENJian-hua12（CollegeofForestry，CentralSouthUniversityofForestryandTechnology，Changsha410004，China；Collegeof3Forestry，GuangxiUniversity，Nanning530004，China；CollegeofLandscapeArchitecture，CentralSouthUniversityof4ForestryandTechnology，Ch

5、angsha410004，China；ForestryBureauofShaoguan，GuangdongProvince，Shaoguan，Guangdong512000，China）Abstract：Thispaperfocusedonthevariationandphylogenyrelationshipoffourmicrosatellitelocioriginatedfrommaireyew（Taxuschinensisvar.mairei）.Comparisonofallelicsizeandseq

6、uencesindicatedthatabundantvariationandcomplexSSRstructureexistedinfourSSRloci.Inter-allelicsizevariationinSSRlociwasduetothemutationofSSRrepeatsandinsertionsordeletions（Indels）inflankingregions，whichalsothemainreasoncausedtheallelicsizemismatchwithsequences

7、data.TwosetsallelichomoplasywereobservedinTY05locuswhereallelesidenticalinstatearenotidenticalbydescent.MitochondrialDNAheteroplasmywasdetectedinonemitochondrialSSRlocus（TB01）.Allelicdistributionandtheirphylogenyrelationshipsuggestedthatstepwisemutationmodel

8、（SMM）appropriatedfortheseloci，commonallelehavethecharacteristicofaboriginalityonevolutionphylogeny.Keywords：Taxuschinensisvar.mairei；microsatellitemarker；allele；sequencevariation；genemutation收稿日