欢迎来到天天文库
浏览记录
ID:37080907
大小:746.92 KB
页数:15页
时间:2019-05-16
《chemdraw的使用方法》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、Chemdraw使用指南(6.0&7.0版)WuXiPharmaTechCo.,Ltd.ChemDraw使用指南(6.0&7.0版)陈华祥、马汝建药明康德新药开发有限公司一、Chemdraw界面简介Scheme1:Chemdraw界面(6.0&7.0)打开Chemdraw6.0(图左),将可以看到其标准界面如(Scheme1),蓝条下第一排为主菜单,从左到右依次有:“File”,“Edit”,“Tools”,“Tools”等。第二排为工具栏,为一排图标,从左到右依次有:“新建”,“打开”,“复制”等快捷工具图标。左边印有“T
2、ools”的可移动长条为工具条,我们将主要使用它来绘制结构,其功能在以下应用时可看到。如果需要,您还可在主菜单“Tools”中选“ShowCrosshair”,“ShowRulers”将分别显示绘图网格和标尺。Chemdraw7.0界面(图右)基本一样,少了一个“Estimate”,其中的功能放到了“Structure”中;并且“Tools”改名为“View”,功能差不多。两个版本各主菜单中的内容小有差别。二、新建Chemdraw文档我们公司要求使用统一的Chemdraw格式(见Scheme2,“File”主菜单下,“Dra
3、wingSettings”,“CaptionTextSettings”and“LabelTextSettings”;7.0版本中,其功能被整合成“DocumentSettings”活页夹的形式,见Scheme2上排右边),这个格式可在内部网上下载,文件名为“pharmatech.cds”,建议大家把它存在桌面上,应用时双击打开即可。如果要将它应用到已有的Chemdraw文档中则可参照以下操作:依次点击主菜单“File”“ApplySettings”“Other…”随后会弹出一个对话框,选择您所存的文件药明康德内部保密资料第1
4、页共15页Chemdraw使用指南(6.0&7.0版)WuXiPharmaTechCo.,Ltd.“pharmatech.cds”打开即可(见Scheme3)。注意:字体不能自动被应用,需要自己手动调整。不过,因为字体是统一的“Arial10号字”,所以,全选后,统一调整即可。Scheme2:“页面设置”“结构式格式设置”,“文档中文字格式设置”和“结构式中的文字格式设置”Scheme3:应用标准格式到已有Chemdraw文档中三、结构绘制格式定好后就可以进行结构绘制了,Chemdraw的操作比较简单、方便,基本上只需应用工
5、具条(Tools)中的功能就可以将一幅完整的结构式绘出,其中的功能大都比较简单明了,简要介绍如Scheme4。药明康德内部保密资料第2页共15页Chemdraw使用指南(6.0&7.0版)WuXiPharmaTechCo.,Ltd.135791113151719212324681012141618202224Scheme4:Tools功能介绍(依次为上下左右)按钮1、选定结构(呈方框状选定);2、选定结构(自由圈定,和1配合使用);3、删除;4、单键(在两个原子之间重复使用即为双键,再重复则为三键);5、在结构中输入文字;6
6、、虚线;7、画曲线;8、粗虚线;9、箭头(各式各样);10、虚楔形线(用于手性中心);11、纺锥形;12、粗实线;13、括号(各式各样,其中一头细一头粗的椭圆方形常用于目标分子的圈定);14、粗楔性实线(用于手性中心);15、在原子上标电子(自由基等)或正负电荷;16、空心楔形键;17、不同角度圆弧;18、配位键;19、??;20、波浪线(用于不确定的手性原子);21、??;22、??;23、模板(内有极丰富的结构模板:氨基酸、糖、RNA、DNA、构象等等);24、画长链;25以下很直观略。绘图技巧:a.在画结构中,使用任何
7、画结构的功能时,您只需在您指定的地方点一下,这样它将自动形成默认的效果(键角,形状等),而不必用鼠标拖着,这样反而不能保证您画出结构是想要的效果。b.当要对某原子进行编辑时(如:延伸碳链或输入元素符号),光标所到处一定会变黑,如果没变黑则编辑没到位,即您想接上的原子或链没有到位,在Chemdraw中会显示红色。换句话说,只要您画的结构在Chemdraw中呈红色,那您画的结构肯定哪里出错了,赶紧检查吧。(参Scheme5)Scheme5:欲被编辑的原子呈黑色;出错的结构呈红色(左,苯环);欲移动的结构呈闪烁的虚线(右,环己烷)
8、药明康德内部保密资料第3页共15页Chemdraw使用指南(6.0&7.0版)WuXiPharmaTechCo.,Ltd.c.当您欲移动某个结构时,您将它选定后会呈闪烁的虚框(参Scheme5),这时您就可以自由移动它了。当结构比较大时,有时很难一下将其圈住,这时您可以只圈住结构的一部分,
此文档下载收益归作者所有