不同地理种群鳄蜥的形态变异及亲缘关系研究

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1、单位代码10602学号2015011137分类号Q951密级公开硕士学位论文不同地理种群鳄蜥的形态变异及亲缘关系研究ResearchontheMorphologicalVariationandGeneticRelationshipofChineseCrocodileLizard(Shinisauruscrocodilurus)amomgDifferentGeographicalPopulations学院：生命科学学院学科名称：生物学研究方向：动物学年级：2015级研究生：谢海指导教师：武正军教授冯平讲师完成日期：2018年6月不同地理种群鳄蜥的形态变异及亲缘关系研究研

2、究生：谢海年级：2015级导师：武正军教授冯平讲师学科专业：生物学研究方向：动物学摘要鳄蜥（ShinisauruscrocodilurusAhl,1930）属鳄蜥科(Shinisauridae)鳄蜥属(Shinisaurus)，是第四纪冰川末期残留在我国华南地区的原始爬行动物，是我国I级保护动物，于1989年被列入CITES附录II中。由于栖息地遭到破坏和鳄蜥遭到人类猎杀，鳄蜥种群数量迅速减少，已经处于濒临灭绝的边缘。因此了解这个物种的遗传变异和地理亲缘关系，对鳄蜥的保护管理工作有着重要意义。本研究利用微卫星DNA和线粒体DNA两种分子标记技术，同时结合不同区域间的形

3、态差异，对16个不同地理种群的遗传多样性及地理亲缘关系进行研究，结果如下：（1）广西大桂山、广东罗坑、广东茂名和越南四个分布区的鳄蜥形态存在一定程度上的差异，广西大桂山种群的头体长和头宽明显比广东罗坑、广东茂名的大（P<0.05），略大于越南鳄蜥，但不显著。广东茂名鳄蜥种群雌性个体第四趾鳞片数比罗坑的多，雄性个体则比罗坑、大桂山的多(P<0.05)。（2）微卫星检测结果显示，10个微卫星位点总共检测得到107个等位基因，16个鳄蜥种群的平均等位基因数为4.975，平均有效等位基因数3.159，平均观察杂合度为0.465，平均期望杂合度为0.624。线粒体检测结果为，9

4、8个个体得到10种单倍型，单倍型多态性为0.195246，核苷酸多态性为0.000303，单倍型多态性和核苷酸多态性都很低。基于微卫星与线粒体检测鳄蜥不同地理种群遗传多样性，结果显示鳄蜥的遗传多样性水平较低。（3）基于微卫星与线粒体探讨鳄蜥种群遗传结构和系统发育。微卫星分析显示两两种群间的遗传分化系数（Fst）范围是0.032~0.267，Fst在0.05~0.25范围内的占大部分，种群间遗传分化处于中等以上水平。Mantel检验结果显示，除桂平饲养种群外（GPY），其余15个自然种群间存在显著的距离隔离模式（r=0.67，P=0.01）地理距离与遗传距离呈现极显著的

5、正相关性。利用微卫星分子标记的Structure聚类分析结果显示，16个种群分为广西大桂山（DCC，CSC，DSC，YSC），广东罗坑（MBC，CSK，DBT，SK），广东茂名（LZD，LHD），越南（HH，TYT，DS，YT）4个居群。基于微卫星Nei遗传距离构建16个鳄蜥种群的NJ系统发育树，结果显示16个种群分为中国与越南两大支，广西大桂山和广东罗坑先与广东茂名分为两I支后再各自分支。线粒体NJ、ML、UPGMA三种系统发育树均显示，16个鳄蜥地理种群聚为中国与越南两大支系。10种单倍型的中介网络关系分为广西和广东罗坑、广东茂名和越南三支，但未出现中心单倍型。对

6、16个种群进行AMOVA遗传变异分析，微卫星数据显示种群内变异为主要变异来源，而线粒体数据则显示绝大部分变异来源于种群间变异。（4）基于微卫星标记进行瓶颈效应检测结果显示，分为4个居群的鳄蜥种群在3种不同检测模型（I.A.M、T.P.M、S.M.M）和Mode-Shift检测下，除了广东罗坑4个种群不显著外，其他种群均可能经历了显著的瓶颈效应。（5）基于线粒体探讨鳄蜥种群历史动态。Tajima’sD、FuandLi’sD、FuandLi’sF均显著大于0（P<0.05），表明鳄蜥种群偏离中性选择状态，可能经历了瓶颈效应或者平衡选择。关键词：鳄蜥；微卫星；mtDNA；遗

7、传多样性；IIResearchontheMorphologicalvariationandGeneticrelationshipofChineseCrocodilelizard(Shinisauruscrocodilurus)amomgdifferentgeographicalpopulationsMasterCandidate:XieHaiGrade:2015Supervisor:WuZheng-junFengPingMajor:BiologyResearchDirection:ZoologyAbstractShinisauruscrocodilu