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时间:2019-05-11
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1、3.4原核与真核生物mRNA特征比较3.4.1原核生物mRNA特征1、半衰期短;2、许多mRNA以多顺反子的形式存在;多顺反子----指一条mRNA可以编码多条蛋白质肽链。一般是一组相邻或相互重叠基因的转录产物构成一个操纵子。3、mRNA的5/端无帽子结构,3/段没有多聚A的尾巴结构或只有较短多聚A的尾巴。4、5/端的AUG上游有7~12核苷酸的保守区-----SD序列。作用:是与核糖体30S小亚基内的16SrRNA的3/端序列互补,是起始的tRNA正确的定位于mRNA的5/端结构的起始密码子上原核mRNA的SD序列3.4.2真核生物mRNA特征1、半衰期相对较长;2、许多mRN
2、A以单顺反子的形式存在;3、mRNA的5/端存在帽子结构;4、绝大多数mRNA3/段有多聚A的尾巴结构。(1)帽子的结构(2)帽子的功能Ⅰ、有助于mRNA穿过核孔进入细胞质;Ⅱ、保护5′不被酶降解;Ⅲ、有助于在翻译时起始因子IFⅢ和核糖体识别。(3)帽子的类型及加帽位点Ⅰ在末端鸟苷的第7位上存在单个甲基化位点的称0号帽子(cap0);Ⅱ在次末端核苷酸的核糖上的2′-0位点上还有一个甲基位点的称1号帽子(cap1);Ⅲ在第三个核苷酸的核糖上(2′-0)有甲基化位点的称2号帽子(cap2)。帽子的类型(4)加帽生化过程Ⅰ剪切前加帽如呼肠病毒,牛豆病毒Ⅱ剪切后加帽如疱疹病毒和口炎病毒加
3、尾(1)加尾作用和时间多聚A是mRNA由细胞核进入细胞质所必需的形式。多聚A是转录后加上去的。(2)加尾过程Ⅰ特殊组分(CPSF)识别AAUAAA并指导其它的活性Ⅱ剪切因子(CF)在加尾位点AAUAAA下游11-30nt(核苷酸)处剪切RNA;Ⅲ末端腺苷转移酶[poly(A)聚合酶]合成poly(A)尾巴;Ⅳ结合蛋白(PBP)与poly(A)结合,反应停止。加尾生化反应第一步加一个短的寡聚A序列(10nt),此反应依赖于AAUAAA序列(加尾信号);此反应由poly(A)聚合酶在特殊因子指导下完成的。第二步是寡聚A尾巴延伸到240nt的长度。此反应并不需要AAUAAA序列,但需要
4、一个识别寡聚A并指导poly(A)聚合酶延伸的刺激因子。3.5RNA合成的延伸终止和抗终止RNA合成的延伸3.5.1延伸速度快慢和转录暂停1、延伸速度延伸速度快慢与DNA模板含G、C的区域有关;在富含G、C区慢或暂停。2、转录暂停当RNA聚合酶转录过程遇到特殊序列,转录速度变慢为0.1b/s或0称为暂停;这段序列称为暂停信号.3.5.2RNA合成的终止1、一旦RNA聚合酶启动了基因转录,它就会沿着模板5‘→3’方向不停地移动合成RNA链,直到遇到终止信号时才释放新生的RNA链,并与模板DNA脱离。2、模板DNA上都有终止转录的特殊信号--终止子,每个基因或操纵子都有一个启动子,
5、一个终止子。3、在新生RNA中出现发卡式结构会导致RNA聚合酶的暂停,破坏RNA-DNA杂合链5'端的正常结构。寡聚U的存在使杂合链的3'端部分出现不稳定的rU·dA区域。原核转录的终止以大肠杆菌为例(体外实验)1、终止子(terminator,t)弱终止子-需要ρ因子(rhofactor)又称为依赖ρ因子终止子强终止子-内在终止子(intrinsicterminators)又称为不依赖ρ因子终止子依赖于ρ因子的终止ρ因子是一个相对分子质量为2.0×105的六聚体蛋白。它能水解各种核苷三磷酸,实际上是一种NTP酶。由于催化了NTP的水解,ρ因子能促使新生的RNA链从三元转录复合物
6、中解离出来,从而终止转录。作用:ρ因子即附着在新生的RNA链上,靠ATP水解产生的能量,沿着5‘→3’方向朝RNA聚合酶移动,到达RNA的3‘-OH端后取代了暂停在终止位点上的RNA聚合酶,并从模板和酶上释放RNA,完成转录过程。终止过程需要消耗能量,所以,ρ因子具有终止转录和核苷三磷酸酶两种功能。b、不依赖于ρ因子的终止若终止点上游存在一个富含GC碱基的二重对称区,由这段DNA转录产生的RNA容易形成发卡式结构;在终止点前面有一段由4-8个A组成的序列,导致转录产物的3‘端为寡聚U。这两种结构特征的存在同样决定了转录的终止。 在新生RNA中出现发卡式结构会导致RNA聚合
7、酶的暂停,破坏RNA-DNA杂合链5'端的正常结构。寡聚U的存在使杂合链的3'端部分出现不稳定的rU·dA区域。强终止子的结构…NNAAGCGCCGNNNCCGGCGCTTTTTTNNN……NNTTCGCGGCNNNGGCCGCGAAAAAANNN…DNA…NNAAGCGCCGNNNCCGGCGCUUUUUUNNN…RNA强终止子的结构特点(1)有回文结构存在;(2)茎的区域富内含G-C;(3)强终止子3′端上有6个U;NNNNNG·CC·GC·GG·CC·GG·CC·U…NNN
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