Diamond软件问题集锦

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1、小木虫Diamond软件问题集锦小木虫Diamond软件问题集锦晶体版版主yanhualover2010年6月13日第1页共13页小木虫Diamond软件问题集锦1.Diamond出图时怎么设置dpi数目我在使用Diamond出图时分辨率并不算小,可是编辑说我的图只有96dpi,但杂志要求至少600dpi,请问我该怎么设置?答:在picture/layout.../对话框的Targets中选择Bitmap,然后就可以自己输入需要的分辨率了.要保存为位图格式才可以。如果是JPG格式,还是96dpi.答:呵呵,发现在tools下拉菜单的option里.2.Diamond

2、椭球图阴影画图如图中所示,怎么画出每个椭球中的阴影部分?我用的是3.1d版本.答:这个是在diamond中的'原子设置中'中选的,具体如下:picture-------atomsdesign-------styleandcolors-------style中选择octant即可。3.怎样建立氢键我这儿有一个cif文件,一个tab文件和两个已经用diamond作好的图,但不知道这两个图是怎么画出来的,想知道作图过程,请diamond高手用word或pdf写出作图过程。第2页共13页小木虫Diamond软件问题集锦答:没什么技术含量的吧,堆积一下,删掉多余的原子,创建氢

3、键就好。4.怎样建立单个分子diamond一打开cif,就是堆积图,怎么才能显示一个分子。答:好像最新的更新包已经改过这个bug了。但是因为没有对应的破解程序,所以俺还是用以前的3.0,经常遇到这个问题。如果你的分子间没有作用,即:没有乱七八糟的键连在一起,选中一个原子,然后,ctrol+M,选中一个分子,然后,反选,即选中除该分子之外的所有分子,然后一键delete,就ok了。如果分子连成片,就删吧。对于非中心分子,即含反离子的分子结构要小心,不要把反离子漏掉了。当然,如果不用画就没问题了。以上拙见,仅供参考。答:diamond打开cif时选“建立单个分子”,然后

4、点完成,不要点下一步。5.请教diamond画C60遇到的问题(1)我这个C60在画多面体的时候,中间inset的atom的半径在每个面上都要自己一个一个去设定radium,有没有同类原子半径一起设置的?里面没有找到。(2)当我把中间的dummy原子(就是为了画多面体的时候新加入的)的半径设为0后,如果想改C60的每个面的颜色的画,这个怎么改的?(3)最后问一下,我保存的图片中背景的diamonddemonstrator如何去掉。另献上我第一幅diamond图,如下。答:1.可以在atom设置里找到假原子直接设置2.以假原子为中心画多面体3.你用的应该是未破解版本。

5、6.diamond中如何在螺旋链中插入一根棒diamond中如何在螺旋链中插入一根棒,以及如何看结构是单螺旋还是双螺旋结构,如何画出单,双螺旋结构?答:插入几个哑原子,然后连键,进行一些设置就可以了。前段时间有人传了一些Diamond的说明,其中有一个文件就是详细说明这个棒怎么画的。找到了这个文件,感谢原作者Crystalsnet,我把它上传到纳米盘,你自己下载下来看看就知道怎么做了。答:在孔道两侧虚拟两个原子,然后在这两个原子间成建,设置一下键参数就可以了!答:具体说,选择两端的几个院子,再找这几个的中心位置,分别insertatoms,再连接心连接,insert

6、bond,在按你的意思editthebond。7.如何去掉M-C,M-H连接打开一个晶体数据后,在connectivity中把M-C,M-H去掉后。再点completefragments第3页共13页小木虫Diamond软件问题集锦后,这些M-C,M-H又连上了,求助高手。答:点下connectnow再确定试试。8.diamond里面如何定义元素化合价怎么样定义元素的化合价,然后使半径比例随之改变??默认设置好像都是原子半径。答:问题解决了,在atomicparameter里面。9.diamond画配位环境时到一定程度原子就长不出来了,是怎么回事今天用diamond

7、画配位环境时画到一定程度(配位环境没画完)原子就长不出来了,不知是怎么回事?请高手指点,谢谢!答:试试在“Typeofsphere”中把Rmax值设大一些。答:或者试试用小太阳符号“Fillcoordinationdirectly"。10.修改Diamond的默认单胞数我不知道动了什么参数让Diamond的默认单胞数为2了,也就是说每次一打开就是两个单胞里的不对称结构单元,在哪改回去吖?答:菜单栏的picture-->guidance-->picturecreationassistant-->destroyallatoms,bonds项选勾,下一步-->在fil

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