《动物遗传分析》PPT课件

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1、陆生动物部动物产品局加拿大食品检测机构TerrestrialAnimalHealthDivisionAnimalProductsDirectorateCanadianFoodInspectionAgency动物遗传资源进口风险分析2动物遗传资源进口风险分析释放和暴露评估 活动物 精液 胚胎3释放和暴露评估活动物对进口活动物作为遗传材料情形,分组或年度采用三个表达式,以便估计所有进口动物试验阴性,但至少有一个受感染的动物的条件概率。通常由于疾病流行率很低,诊断试验不完善,以及要排除引进外来疾病后果可能昂贵的代价,要反复进行诊断试验(M=2,3,4次试验或更多)以便提高检测到感染动物的概率

2、。这些可以是相同诊断试验的重复,也可以是不同试验的组合。4活动物对于大多数传染病,一旦进口动物完成检疫,暴露的可能就被理解为100%,除非是病媒传染疾病、或进口的动物永久隔离、立即宰杀或送到动物园,则情况有所不同。成批进口时,要考虑分组进口符合进口国的需求,否则要考虑每年有多少动物要进口。释放和暴露评估5活动物三个表达式中的第一个用于:共进口n个单个动物,每个都进行m次相同的诊断试验,敏感性为s,特异性为t。我们假定每个单独的动物i可能来自不同的群体,它的具体流行率为pi.因此所有试验阴性中,至少有一个感染动物的概率是:(1)其中qi=(1-pi).这个表达式需要估计出口国或区动物流行

3、率pi,及其诊断试验的敏感性s,特异性t。释放和暴露评估6活动物流行率输入:pi=(1-qi)=感染流行率(Gamma(2,0.0000063))驼科动物的流行率等于出口国牛存栏中所估计的流行感染数。年度新感染畜群牛群数量畜群发病率199811,115,6508.96E-07199941,095,9603.65E-062000101,077,5609.28E-062001131,050,9101.24E-052002111,040,4011.06E-05200331,013,5702.96E-0620043989,4603.03E-0620054982,5104.07E-0620069

4、971,4009.26E-0620077967,4407.24E-062008平均6.33E-06释放和暴露评估7活动物流行率输入:释放和暴露评估8活动物敏感性输入s=试验的敏感性(Beta(27,10)试验敏感性Beta分布参数基于对自然感染和人工感染的驼类应用结核菌素试验进行检测时,使用在腋窝下进行皮试的方法。这三项研究的资料表明,35只羊驼中的26只腋窝下进行皮试检测阳性。统计学上该计算敏感性估计值0.74,95%置信度的区间0.56到0.87。释放和暴露评估9活动物敏感性投入进口荷兰的羊驼诊断感染牛分枝杆菌后突然死亡。同一地点的其他12只羊驼所到之处做的比较结核菌素皮肤试验为阴

5、性(Dinklaetal.1991)。前腿后面重复的皮肤试验结果是10只动物中有2只呈阳性反应。ELISA试验10只动物有7只为阳性。后来发现所有10只动物组织培养都感染了牛分枝杆菌(Stevens1990)。释放和暴露评估10活动物敏感性输入在阿根廷所作的项目中评价在美洲驼(llamas)中使用结核菌素试验(tuberculintest),24只驼吸入牛型结核菌感染,剂量通常感染牛所用的十分之一。其中4只死亡,有几只用一种抗结核药异烟肼(Isoniazid)进行治疗。评价试验是腋后、颈中部和耳皮层结核菌素试验,用USDA和PAHO结核菌素PPD。颈中部和耳皮层试验比腋后试验容易测量。

6、所有美洲驼对不同皮层试验的反应≥5mm。(VanTiemetal.1995).释放和暴露评估11活动物敏感性输入Stevens等(1996)做了一次研究,用牛分支杆菌试验感染6只美洲驼,注射0.2ml牛结核菌素PPD后,腋下来测量皮层试验反应。感染后(PI)80天,5只存活的中4只美洲驼对结核菌素试验有反应(6只中有1只在感染后68天死亡),在感染后(PI)142天,3只存活的中全部对结核菌素试验产生反应(另2只在此次试验前死亡)。释放和暴露评估12活动物t=试验的特异性(最大值为1.0)m=试验次数=2n=动物数量(50,100,200)如果3年大约有14次许可进口驼科动物297只,

7、三年之内进口的驼科动物分别为50,100和200。释放和暴露评估13活动物在许多情况下,动物以群来进口,每群在出口国来源于一个特定的畜群。这样的话,上述的表达式需要被扩展和改进。假设动物来源国或地区的畜群流行率为ph,动物总数为n,来自k畜群:那么进口的动物是n=n1+n2+...+nk。ni是来自i畜群,其流行率为pa(i).释放和暴露评估14活动物如果对所以动物进行同样的试验m次,所有的试验都是阴性的话,那么至少有一只动物为感染的可能性:(

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