pubmed生物学数据库

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1、6课PubMed生物医学数据库内容见教材4章1节（P59）目的与要求：了解PubMed的特点，掌握使用该数据库进行课题检索的基本途径与方法。本课内容安排有实习，要求掌握检索途径与方法。教学重、难点：利用PubMed可检索哪些数据资源。自动词语匹配转换功能；主题词/副主题词检索；五种检索辅助工具的特点及使用。9/15/20211教学内容：6.1Pubmed简介6.2通过PubMed可检索到的信息6.3PubMed检索界面的结构6.4PubMed的检索6.5检索结果显示及下载6.6MyNCBI9/15/202126.1PubMed简介PUBMED是美国国立图书馆（NLM）所属国家生物技术信息中心

2、（NCBI）建立的生物医学文献检索系统（1997年免费开放），是NCBI开发的Entrez检索系统重要组成部分。IMMEDLINEPubMed(手工检索)(联机检索、光盘检索)(网络检索)特点：信息资源丰富、质量高、更新及时、检索方式灵活多样、链接功能强大、使用免费等。9/15/2021326.2通过PubMed可检索信息6.2.1Medline6.2.2PreMedline6.2.3出版商提供的书目信息6.2.4NCBI其它数据库的相关记录9/15/202146.2.1MEDLINE：美国国立医学图书馆MEDLARS系统中最大的生物医学数据库。收录1966年以来70多个国家近4800种生物

3、医学期刊的书目信息和著者文摘，每周更新。每条记录均带有[PubMed--IndexedforMEDLINE]标志。9/15/202156.2.2PreMedline未正式给予MeSH词、出版类型等深度标引信息的一个前期临时库，可检索。“PubMed计划”：出版商在期刊出版之前或同时，将期刊论文题录提供给PubMed，每天NLM把最新记录加入到PreMedline库。工作人员一周内将这些记录标引，然后转入MEDLINE，同时从PreMedline中删去。带有[PubMed--inProcess]标志。9/15/202166.2.3出版商提供的书目信息：出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分没有

4、被MEDLINE收录，PubMed仍保存，在记录中做[PubMed--assuppliedbypublisher]的标记。出版商提供的记录若有全文，PubMed则建立了与此期刊节点的链接，可免费或交一定的费用直接联机获取原文。9/15/20217图19/15/202186.2.4NCBI其它数据库的相关记录：PubMed建立了与NCBI其他数据库之间联系，通过Medline记录链接获取相关的基因库记录，也可以通过基因库记录链接获取相关的Medline记录。9/15/20219PubMed与其它数据库的关系9/15/202110NCBI数据库PubMed：在主页上提供与NCBI的7个数据库建立

5、了超链接：Nucleotide：DNA序列数据库。Protein：氨基酸（蛋白质）序列数据库。Genome：基因组序列数据库，提供所有基因与染色体纪录与图片的查询服务，这个库中数以百万的基因序列是由庞大的基因排序工作得来的。Structure：分子结构模型数据库，这个数据库保存的是由X线晶体成像、NMR分光光度法建立的三维分子结构。Popset：种群、种系发生或突变序列数据库，是由相关种族、人类发展、突变研究得来的人类进化与人种差异的结果。Taxonomy：生物分类数据库OMIM：人类孟德尔遗传学联机数据库。Books：相关图书，可链接到相关参考书籍的文摘页。9/15/202111AllDa

6、tabase跨库检索9/15/202112Pre-MedlineMedlineNewDataCollectPubMedProcess检索出版商提供书目信息PubMed可检信息示意图NCBI其它数据库9/15/202113PUBMED进入方式www.pubmed.comwww.ncbi.nlm.nih.gov/pubmedwww.pubmed.netwww.pubmed.org或用搜索引擎搜“PubMed”地址。9/15/2021146.3PubMed检索界面的结构基本检索区相关数据库链接、检索提问框检索提示区对各项检索功能的简单描述Entrez简介、PubMed服务、特有检索、相关资源辅助检

7、索区个性化检索区9/15/202115Overview-介绍PubMed的覆盖范围和刊物信息。New/Noteworthy-关于PubMed系统更新和未来发展。JournalDatabases-通过标题，关键词，标题缩写，或者ISSN号，在PubMed和其他Entrez数据库中检索期刊标题，还可以查看提供全文的刊物的列表。MeSHDatabases-浏览MeSH表并选词检索。CitationMatcher-通