linux并行计算环境使用

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1、Linux并行计算环境使用(深腾7000上机指导）曹宗雁zycao@sccas.cn中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心系统运维部什么是并行计算环境能让采用了一种或多种并行计算技术编写的软件或程序（简程“并行程序”）正确运行的计算机软硬件环境。并行计算环境既可以由超级计算机、大型计算机提供，也可以存在于普通工作站、桌面台式机甚至便携式笔记本之上，只要能够使并行程序能够正确的执行，就可以称之为并行环境。架设在Linux操作系统上，并能够运行并行程序的环境即为Linux并行计算环境。2Linux并行计算环境使用登录Linux并行环境之前明确自己要完成的工作。学习一点Linux基本知识和常用命令

2、操作。对于删除修改等危险操作和不熟的命令切记要谨慎执行。通过各种途径了解机器基本环境。硬件情况：结点配置、网络结构文件系统情况，磁盘配额编译调试工具、并行环境、函数库及应用软件情况作业管理系统获取一个可以登录的帐号。仔细阅读系统管理员提供的有关并行环境使用的手册或指南，了解如何登录和使用该并行环境。3Linux并行计算环境使用Linux操作系统使用入门4Linux并行计算环境使用登录Linux系统需要一个被允许登录的用户名及其密码本地登录终端字符界面图形界面远程登录（通过SSH）Windows系统——Windows本身不支持SSH登录，必须使用第三方模拟终端程序登录系统。PUTTYXmanag

3、erSecureCRT/SecureFXSSHSecureShell.....Linux系统——在不同的桌面环境下启动终端后，直接执行ssh命令远程登录。sshhostname

4、ipaddress5Linux并行计算环境使用系统信息命令主机相关主机名和IP地址hostname[--ip-address]操作系统基本情况uname[-a]系统时间date[+FORMAT]退出登录exit用户相关看自己whoamiid修改登录密码passwd适用于单机环境yppasswd适用于启用了NIS认证的集群环境（如深腾7000)6Linux并行计算环境使用基本目录和文件操作（一）改变当前所在目录cd[目录

5、名]不加参数将回到用户主目录相对路径(./)dirname./当前目录../上一层目录绝对路径/home/user/dirname创建目录mkdir删除空目录rmdirrmdir不能删除非空目录7Linux并行计算环境使用基本目录和文件操作（二）显示当前所在目录pwd输出文件列表ls[参数][目录或文件名]不加目录或文件名表示列表当前目录下的文件常用参数-l详细文件详细信息-a显示所有文件-t/-S(-r)按时间/大小排序(逆排序）统计目录中所有文件大小总和（包含子目录）du[参数][目录名]-s直接列出最终统计值-h自动加上数学单位(G/M/K)--max

6、-depth=n最多统计到指定目录下第n层8Linux并行计算环境使用基本目录和文件操作（三）复制文件cp[参数]<源文件><目标文件或路径>-r递归复制所有子文件夹和其中的文件-a保留源文件的属性文件或目录移动mv<源文件或目录><目标文件或路径>常用来对文件和目录进行重命名删除文件或目录rm[参数]<文件名>-r递归删除-f强制删除特别提醒：对于覆盖和删除操作，默认情况下系统不会进行提示并确认。设置命令转义防误操作（加入.bashrc当中）：aliasrm=”rm-i”aliasmv=”mv-i”aliascp=”cp-i”9Linux并行计算环境使用基本目录和文件操作（四）输出文件全部内

7、容cat<文件名>输出文件开头部分内容head[-n行数]<文件名>输出文件末尾部分内容tail[-n行数]<文件名>分屏查看文件内容more<文件名>less<文件名>执行其它命令的输出信息较多时，通常使用command

8、more或是command

9、less来分屏查看输出结果。10Linux并行计算环境使用基本目录和文件操作(五）改变文件属性chmod<参数><文件或目录名>(+/-)rwx(赋予/去除)读/写/可执行属性-R递归更改文件或目录属性搜索符合条件的文件find<路径>[参数]常用find<路径>-name“<文件名>”查找文件从文件中搜索匹配字符串grep[参数]“<字符串>”

10、<文件或目录名>常用参数：-i忽略大小写-r子目录递归搜索-v反匹配模式-n显示匹配行的行号11Linux并行计算环境使用文件打包和解包tar打包工具解包：.tar:tarxvf<压缩包>.tar.gz/.tgz:gzip压缩包tarzxvf<压缩包>.tar.Z:compress压缩包tarZxvf<压缩包>.tar.bz2:bzip2压缩包tarjxvf<压缩包>亦可使用相应解压工具先解压成t