生物信息学复习要点

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1、一、名词解释（每小题3分，共30分）1.生物信息学2.数据库技术3.数据仓库4.EST5.概念性翻译6.同源性7.讥系类群8.全局排列9.基因作图10.直系同源体簇二、填空题（每空1分，共10分）1.生物信息学主要研究的两种信息载体是和2.国际上的三大核甘酸序列数据库分别是—和01.数据挖掘的三大技术支柱是、和2.相同类型核甘酸的替换称为,不同类型核井酸的替换称为。三、单项选择题（每小题1分，共10分）1.在对模式主物进行全基因组的测定中，作为真菌模式生物的是0A、大肠杆菌B、青霉菌C、酵母菌D、线虫2.NCBI成立于oA、1988年B、1989年C、1990年D、1992年3.根据数据库管

2、理系统所支持的基木数据模型的不同，町以将数据库分为五类，其中第二代数据库是oA、层次数据胯13、网状数据库C、关系数据库D、分布式数据库4.在向GenBank投送序列的工具中，是标准的序列投送工具。A、Cn3DB、tbl2asnC、BankItD、Sequin5.kl前最为常用和注释最全的蛋白质序列数据库是oA、IdentifyB、OWLC、PIRD、SWISS-PROT6.下列选项中根据蛋白质三维折叠模式和进化关系划分的结构分类数据库是。A>PDBsumB、GDBC、SCOPI）、CATH1.构建系统发牛树的方法很多，其中耗时最短的是oA、进化简约法B、最人简约法C^最大似然法D、距离矩阵

3、法2.下列数据库选项中不属于蛋白质序列二次数据库的是一A、PROSTTEB、PRINTSC、BLOCKSD、PDB3.在系统发生树的检验中，较为常川的方法是A、MP法B、重复取样法C、NJ法D、ML法4.下列工具中川于发现开放阅读框的软件是A、TranslatcToolB、ORFFinderC、GeneWiseD、E-PCR四、多项选择题（每小题2分，共20分）1.生物人分子携带的三种信息是oA、遗传信息B、功能信息C、调控信息I）、进化信息2.为实现3个抽彖级别间的数据转换，DBMS提供的两层映射是A、外模式/概念模式映射B、外模式/内模式映射C、概念模式/内模式映射D、概念模式/外模式3

4、.数据挖掘和知识发现一般可用于发现oA、广义知识B、关联知识C、聚类知识D、预测性知识4.用于检测DNA序列中潜在的CDS的儿种特征是。A、ORF长度B、Kozak序列C、密码子用法D、密码子使川偏性1.下列数据库选项中属于蛋白质结构二次数据库的是°A、DSSPB、FSSPC^ProfilesD、HSSP2.下列选项中属于整合牛物信息学数据系统。A、SRSB、EntrezC、GeneraD、FLYBASE3.公用的EST的分析工具有oA、序列相似性杳询B、序列分类C、序列组装D、序列聚类4.根据有无外类群，可以将系统树分为oA、有根树B、无根树C、基因树D、标度树5.在构建系统发牛树的软件包

5、中，基丁•最大似然法的构树软件包是.A、MOLPHY软件包B、TreeView软件包C、PAM软件包D、PUZZLE软件包6.双向凝胶电泳技术的双向是指。A、正向B＞等电聚焦C＞反向D、SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳五、问答题（第1、2、3题每小题6分，第4题12分，共30分）1.简述蛋白质组分析的主要过程和关键技术?2.比较BLAST系列软件。3.简述基于计算的比较棊因组学的各研究方法及其原理?4.请举例分析某属真菌的分子系统学研究结果并联系其各口的地理分布、牛态、经纬度、海拔等信息分析其生物信息学和生态学意义。一、名词解释（每小题3分，共30分）1.基因芯片2.数据库系统3.数据挖掘4.相似

6、性度量1.电子克隆2.并系类群3.系统发牛树4.局部排列5.基因组6.育•系同源体簇二、填空题（每空1分，共10分）1.牛物信息学产牛于20世纪年代。，没有外类群作为树根的系统2.系统树中具有外类群作为树根的系统树称为树称为o3.根据数据管理的特点，数据库管理按其发展的先后顺序对划分为三个阶段，分别是、、。4.国际上的三大核背酸序列数据库分别是、、。5.世界上第一个蛋白质组研究中心是=三、单项选择题（每小题1分，共10分）1.人类基因组计划开始于。A、1985B、1988C、1990D、19982.第一个细菌全基因组测序完成于。A、1988年B、1992年C、1995年D、1998年3.下列

7、选项中那一个不是模式牛物基因组数据库oA、YEASTSBnArabinetC>FlyBaseD、AceDB4.蛋口质三维空间结构数据库有很多，其屮皋于网络的概要数据库是PDBsumB、CATHC、SCOPD、PDB5•下列选项中根据蛋白质结构域划分的结构分类数据库是oA、PTRB、SWISS-PROTC、SCOPD、CATH1.概念性翻译将产生条与核甘酸对应的蛋白质序列。A、4B、5C、6D、72.在进行序列